MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017058	A	6	6	349644	349649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017058	T	8	8	349677	349684	0 %	100 %	0 %	0 %	383501246
9003	NC_017058	A	6	6	349730	349735	100 %	0 %	0 %	0 %	383501246
9004	NC_017058	TAA	2	6	349775	349780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501246
9005	NC_017058	A	7	7	349779	349785	100 %	0 %	0 %	0 %	383501246
9006	NC_017058	CTTATG	2	12	349802	349813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501246
9007	NC_017058	ATG	2	6	349828	349833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501246
9008	NC_017058	TTA	2	6	349928	349933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501246
9009	NC_017058	TCG	2	6	349947	349952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501246
9010	NC_017058	T	7	7	349956	349962	0 %	100 %	0 %	0 %	383501246
9011	NC_017058	TG	3	6	349981	349986	0 %	50 %	50 %	0 %	383501246
9012	NC_017058	CGT	2	6	350011	350016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501246
9013	NC_017058	AAG	2	6	350024	350029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501246
9014	NC_017058	CAG	2	6	350030	350035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501246
9015	NC_017058	TTTA	2	8	350057	350064	25 %	75 %	0 %	0 %	383501246
9016	NC_017058	GAA	2	6	350068	350073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501246
9017	NC_017058	GGC	2	6	350079	350084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501246
9018	NC_017058	TTG	2	6	350132	350137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501246
9019	NC_017058	GGA	3	9	350143	350151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501246
9020	NC_017058	CGG	2	6	350211	350216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501246
9021	NC_017058	GATG	2	8	350223	350230	25 %	25 %	50 %	0 %	383501246
9022	NC_017058	TAT	2	6	350235	350240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501246
9023	NC_017058	AT	3	6	350244	350249	50 %	50 %	0 %	0 %	383501246
9024	NC_017058	AAG	2	6	350250	350255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501246
9025	NC_017058	ATTTA	2	10	350369	350378	40 %	60 %	0 %	0 %	383501246
9026	NC_017058	TTG	2	6	350450	350455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501246
9027	NC_017058	CCT	2	6	350485	350490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501246
9028	NC_017058	GGC	3	9	350533	350541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501246
9029	NC_017058	ATT	2	6	350544	350549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501246
9030	NC_017058	GAT	2	6	350605	350610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501246
9031	NC_017058	CT	3	6	350614	350619	0 %	50 %	0 %	50 %	383501246
9032	NC_017058	TG	3	6	350620	350625	0 %	50 %	50 %	0 %	383501246
9033	NC_017058	A	6	6	350720	350725	100 %	0 %	0 %	0 %	383501247
9034	NC_017058	TTC	2	6	350726	350731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501247
9035	NC_017058	TAA	2	6	350746	350751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501247
9036	NC_017058	AAT	2	6	350753	350758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501247
9037	NC_017058	T	7	7	350777	350783	0 %	100 %	0 %	0 %	383501247
9038	NC_017058	TATT	2	8	350811	350818	25 %	75 %	0 %	0 %	383501247
9039	NC_017058	T	6	6	350817	350822	0 %	100 %	0 %	0 %	383501247
9040	NC_017058	A	7	7	350832	350838	100 %	0 %	0 %	0 %	383501247
9041	NC_017058	GTA	2	6	350866	350871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501247
9042	NC_017058	AT	3	6	350902	350907	50 %	50 %	0 %	0 %	383501247
9043	NC_017058	AT	3	6	350912	350917	50 %	50 %	0 %	0 %	383501247
9044	NC_017058	ACA	2	6	350999	351004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501247
9045	NC_017058	GAA	3	9	351075	351083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501247
9046	NC_017058	TAC	2	6	351095	351100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501247
9047	NC_017058	GTT	2	6	351189	351194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501247
9048	NC_017058	TAA	2	6	351233	351238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501247
9049	NC_017058	TTC	2	6	351296	351301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501247
9050	NC_017058	TAA	4	12	351326	351337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501247
9051	NC_017058	A	7	7	351376	351382	100 %	0 %	0 %	0 %	383501247
9052	NC_017058	GAG	2	6	351384	351389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501247
9053	NC_017058	ATG	2	6	351463	351468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501247
9054	NC_017058	AGC	2	6	351482	351487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501247
9055	NC_017058	ATCT	2	8	351490	351497	25 %	50 %	0 %	25 %	383501247
9056	NC_017058	AAT	2	6	351532	351537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501247
9057	NC_017058	ATT	2	6	351557	351562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501248
9058	NC_017058	AT	3	6	351568	351573	50 %	50 %	0 %	0 %	383501248
9059	NC_017058	TA	3	6	351575	351580	50 %	50 %	0 %	0 %	383501248
9060	NC_017058	CAT	2	6	351614	351619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501248
9061	NC_017058	ATAG	2	8	351644	351651	50 %	25 %	25 %	0 %	383501248
9062	NC_017058	TAA	2	6	351657	351662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501248
9063	NC_017058	AAG	2	6	351690	351695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501248
9064	NC_017058	TGA	2	6	351705	351710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501248
9065	NC_017058	AAG	2	6	351735	351740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501248
9066	NC_017058	GCT	2	6	351751	351756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501248
9067	NC_017058	ATA	2	6	351792	351797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017058	TGT	2	6	351806	351811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_017058	TTG	2	6	351836	351841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_017058	AAT	2	6	351880	351885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_017058	TGA	2	6	351909	351914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_017058	ATG	2	6	351944	351949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_017058	GGT	2	6	351951	351956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_017058	TA	3	6	351995	352000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_017058	TTTA	2	8	352008	352015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_017058	TTA	2	6	352024	352029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_017058	CTA	2	6	352042	352047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501249
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9082	NC_017058	ATT	2	6	352482	352487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501250
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9087	NC_017058	CTA	2	6	352751	352756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501250
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9093	NC_017058	GAA	2	6	352834	352839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501250
9094	NC_017058	GAT	2	6	352915	352920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501250
9095	NC_017058	A	7	7	352936	352942	100 %	0 %	0 %	0 %	383501250
9096	NC_017058	TAT	2	6	352950	352955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501250
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9100	NC_017058	CGT	2	6	353157	353162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9102	NC_017058	TCA	2	6	353224	353229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_017058	ATA	2	6	353230	353235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_017058	AAT	2	6	353306	353311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_017058	TGCT	2	8	353393	353400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_017058	TTG	2	6	353477	353482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_017058	TTAA	2	8	353529	353536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017058	GAT	2	6	353661	353666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_017058	AT	3	6	353802	353807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_017058	TATC	2	8	353835	353842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_017058	TCATA	2	10	353843	353852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9112	NC_017058	ATT	2	6	353862	353867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_017058	AGGTT	2	10	353937	353946	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017058	T	7	7	353960	353966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_017058	AT	3	6	353979	353984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_017058	TTA	2	6	353991	353996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_017058	CAT	2	6	354043	354048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_017058	ATT	2	6	354072	354077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_017058	GCTGAG	2	12	354090	354101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9120	NC_017058	AGA	2	6	354233	354238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_017058	TC	3	6	354317	354322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_017058	TAT	2	6	354379	354384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501251
9123	NC_017058	T	6	6	354397	354402	0 %	100 %	0 %	0 %	383501251
9124	NC_017058	TTTG	2	8	354422	354429	0 %	75 %	25 %	0 %	383501251
9125	NC_017058	GTT	2	6	354545	354550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501251
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