MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017058	AAAT	2	8	311130	311137	75 %	25 %	0 %	0 %	383501217
8002	NC_017058	TGA	2	6	311164	311169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501217
8003	NC_017058	ATG	2	6	311306	311311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017058	TAT	2	6	311341	311346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017058	TTG	2	6	311348	311353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017058	ATT	2	6	311354	311359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017058	CTT	2	6	311398	311403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_017058	TAC	2	6	311425	311430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501218
8009	NC_017058	CTT	2	6	311464	311469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501218
8010	NC_017058	TA	3	6	311474	311479	50 %	50 %	0 %	0 %	383501218
8011	NC_017058	T	6	6	311520	311525	0 %	100 %	0 %	0 %	383501218
8012	NC_017058	CAA	2	6	311546	311551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501219
8013	NC_017058	CCG	2	6	311557	311562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501219
8014	NC_017058	TAAT	2	8	311611	311618	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8015	NC_017058	ATT	2	6	311640	311645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501219
8016	NC_017058	TA	3	6	311653	311658	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8017	NC_017058	TA	3	6	311713	311718	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8018	NC_017058	GCT	2	6	311757	311762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501219
8019	NC_017058	TGC	2	6	311771	311776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501219
8020	NC_017058	CAAG	2	8	311797	311804	50 %	0 %	25 %	25 %	383501219
8021	NC_017058	A	6	6	311870	311875	100 %	0 %	0 %	0 %	383501219
8022	NC_017058	CCG	2	6	311907	311912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501219
8023	NC_017058	TGA	2	6	312077	312082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501219
8024	NC_017058	ATC	2	6	312090	312095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501219
8025	NC_017058	TTC	2	6	312096	312101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501219
8026	NC_017058	GAGCAA	2	12	312112	312123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501219
8027	NC_017058	AT	3	6	312134	312139	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8028	NC_017058	GTA	2	6	312205	312210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501219
8029	NC_017058	A	6	6	312219	312224	100 %	0 %	0 %	0 %	383501219
8030	NC_017058	CCA	2	6	312359	312364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501219
8031	NC_017058	AAT	2	6	312381	312386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501219
8032	NC_017058	GAA	2	6	312482	312487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501219
8033	NC_017058	TA	3	6	312490	312495	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8034	NC_017058	AGA	2	6	312496	312501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501219
8035	NC_017058	AT	3	6	312515	312520	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8036	NC_017058	A	6	6	312578	312583	100 %	0 %	0 %	0 %	383501219
8037	NC_017058	AAT	3	9	312591	312599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501219
8038	NC_017058	TAA	2	6	312641	312646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501219
8039	NC_017058	AT	3	6	312669	312674	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8040	NC_017058	T	6	6	312674	312679	0 %	100 %	0 %	0 %	383501219
8041	NC_017058	AAGAA	2	10	312716	312725	80 %	0 %	20 %	0 %	383501219
8042	NC_017058	A	6	6	312737	312742	100 %	0 %	0 %	0 %	383501219
8043	NC_017058	CAAGC	2	10	312790	312799	40 %	0 %	20 %	40 %	383501219
8044	NC_017058	CAA	2	6	312808	312813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501219
8045	NC_017058	GAG	2	6	312831	312836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501219
8046	NC_017058	ATAG	2	8	312854	312861	50 %	25 %	25 %	0 %	383501219
8047	NC_017058	TACAT	2	10	312900	312909	40 %	40 %	0 %	20 %	383501219
8048	NC_017058	AT	3	6	312908	312913	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8049	NC_017058	TAA	2	6	312940	312945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501219
8050	NC_017058	AT	4	8	312954	312961	50 %	50 %	0 %	0 %	383501219
8051	NC_017058	TTA	2	6	312967	312972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501219
8052	NC_017058	GATA	2	8	312989	312996	50 %	25 %	25 %	0 %	383501219
8053	NC_017058	TAG	2	6	313039	313044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017058	CAT	2	6	313049	313054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017058	A	7	7	313069	313075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017058	A	7	7	313114	313120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017058	AAT	2	6	313124	313129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017058	CAAA	2	8	313224	313231	75 %	0 %	0 %	25 %	383501220
8059	NC_017058	ACA	2	6	313245	313250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501220
8060	NC_017058	ATAA	2	8	313251	313258	75 %	25 %	0 %	0 %	383501220
8061	NC_017058	TA	3	6	313262	313267	50 %	50 %	0 %	0 %	383501220
8062	NC_017058	CGAT	2	8	313359	313366	25 %	25 %	25 %	25 %	383501220
8063	NC_017058	T	6	6	313369	313374	0 %	100 %	0 %	0 %	383501220
8064	NC_017058	ATAAA	2	10	313385	313394	80 %	20 %	0 %	0 %	383501220
8065	NC_017058	TAG	2	6	313408	313413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501220
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8067	NC_017058	TCG	2	6	313440	313445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501220
8068	NC_017058	ATTT	2	8	313453	313460	25 %	75 %	0 %	0 %	383501220
8069	NC_017058	GTT	2	6	313520	313525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501220
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8071	NC_017058	GTA	2	6	313618	313623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501220
8072	NC_017058	AT	3	6	313629	313634	50 %	50 %	0 %	0 %	383501220
8073	NC_017058	TAG	2	6	313652	313657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501220
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8075	NC_017058	GTTTG	2	10	313700	313709	0 %	60 %	40 %	0 %	383501220
8076	NC_017058	ATA	2	6	313724	313729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
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8080	NC_017058	TAGTT	2	10	313829	313838	20 %	60 %	20 %	0 %	383501220
8081	NC_017058	ATA	2	6	313857	313862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8082	NC_017058	AATA	2	8	313873	313880	75 %	25 %	0 %	0 %	383501220
8083	NC_017058	TTG	2	6	313891	313896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501220
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8088	NC_017058	A	6	6	314126	314131	100 %	0 %	0 %	0 %	383501220
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8091	NC_017058	ATA	2	6	314250	314255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8092	NC_017058	CGC	2	6	314284	314289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501220
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8095	NC_017058	CAAA	2	8	314329	314336	75 %	0 %	0 %	25 %	383501220
8096	NC_017058	AGC	2	6	314341	314346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501220
8097	NC_017058	CTA	2	6	314350	314355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501220
8098	NC_017058	GCG	2	6	314382	314387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383501220
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8101	NC_017058	AAT	2	6	314495	314500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8102	NC_017058	AAT	2	6	314594	314599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8103	NC_017058	TTA	2	6	314602	314607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501220
8104	NC_017058	CAA	2	6	314644	314649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501220
8105	NC_017058	GCT	2	6	314661	314666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501220
8106	NC_017058	AAT	2	6	314742	314747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8107	NC_017058	CTG	2	6	314761	314766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501220
8108	NC_017058	A	7	7	314783	314789	100 %	0 %	0 %	0 %	383501220
8109	NC_017058	AAAG	2	8	314796	314803	75 %	0 %	25 %	0 %	383501220
8110	NC_017058	TCC	2	6	314832	314837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383501220
8111	NC_017058	ACG	2	6	314865	314870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501220
8112	NC_017058	TAA	2	6	314966	314971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8113	NC_017058	ATT	2	6	315015	315020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501220
8114	NC_017058	ATA	3	9	315037	315045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501220
8115	NC_017058	A	6	6	315045	315050	100 %	0 %	0 %	0 %	383501220
8116	NC_017058	ATT	2	6	315060	315065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501220
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8118	NC_017058	TTA	2	6	315106	315111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501220
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8120	NC_017058	TTA	2	6	315208	315213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501221
8121	NC_017058	AT	3	6	315219	315224	50 %	50 %	0 %	0 %	383501221
8122	NC_017058	TAA	2	6	315225	315230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501221
8123	NC_017058	GCT	2	6	315259	315264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501221
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8125	NC_017058	CAA	2	6	315326	315331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501221
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