MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	CCG	2	6	11	16	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017058	TA	4	8	42	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017058	AAT	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017058	TAAC	2	8	95	102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017058	AAAATC	2	12	118	129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017058	TTA	2	6	134	139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017058	ATT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017058	TA	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017058	GAATT	2	10	215	224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017058	AGT	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017058	TAT	2	6	327	332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017058	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017058	AGT	3	9	373	381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500937
14	NC_017058	AT	3	6	400	405	50 %	50 %	0 %	0 %	383500937
15	NC_017058	GATAAA	2	12	536	547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383500937
16	NC_017058	ATGCT	2	10	561	570	20 %	40 %	20 %	20 %	383500937
17	NC_017058	TAG	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500937
18	NC_017058	TTGC	2	8	607	614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017058	GCC	2	6	652	657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017058	AGG	2	6	674	679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017058	A	7	7	688	694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017058	TA	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017058	T	6	6	785	790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017058	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017058	TTGC	2	8	814	821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017058	GAA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017058	GCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017058	ACG	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017058	TC	3	6	1015	1020	0 %	50 %	0 %	50 %	383500938
30	NC_017058	ATA	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
31	NC_017058	ACG	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500938
32	NC_017058	ACT	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500938
33	NC_017058	TAC	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500938
34	NC_017058	AAGA	2	8	1175	1182	75 %	0 %	25 %	0 %	383500938
35	NC_017058	AAT	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
36	NC_017058	T	7	7	1332	1338	0 %	100 %	0 %	0 %	383500938
37	NC_017058	AAT	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500938
38	NC_017058	T	7	7	1392	1398	0 %	100 %	0 %	0 %	383500938
39	NC_017058	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	383500939
40	NC_017058	ATTA	2	8	1479	1486	50 %	50 %	0 %	0 %	383500939
41	NC_017058	TA	3	6	1550	1555	50 %	50 %	0 %	0 %	383500939
42	NC_017058	GCCC	2	8	1568	1575	0 %	0 %	25 %	75 %	383500939
43	NC_017058	TCT	2	6	1588	1593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500939
44	NC_017058	AGA	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500939
45	NC_017058	AGT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500939
46	NC_017058	CCG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500939
47	NC_017058	T	6	6	1795	1800	0 %	100 %	0 %	0 %	383500939
48	NC_017058	CCA	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500939
49	NC_017058	TCA	3	9	1951	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500939
50	NC_017058	TTAG	2	8	1972	1979	25 %	50 %	25 %	0 %	383500939
51	NC_017058	CAT	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500939
52	NC_017058	AAG	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500939
53	NC_017058	TAG	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017058	TAATT	2	10	2158	2167	40 %	60 %	0 %	0 %	383500940
55	NC_017058	CACC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	383500940
56	NC_017058	TTTTC	2	10	2194	2203	0 %	80 %	0 %	20 %	383500940
57	NC_017058	T	6	6	2208	2213	0 %	100 %	0 %	0 %	383500940
58	NC_017058	AGC	3	9	2214	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500940
59	NC_017058	CAC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500940
60	NC_017058	TTG	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500940
61	NC_017058	TA	3	6	2319	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	383500940
62	NC_017058	CTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500940
63	NC_017058	TTGC	2	8	2387	2394	0 %	50 %	25 %	25 %	383500940
64	NC_017058	CTG	3	9	2423	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500940
65	NC_017058	TCTT	2	8	2475	2482	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
66	NC_017058	TTA	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500941
67	NC_017058	CTTT	2	8	2542	2549	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
68	NC_017058	TCC	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017058	AT	3	6	2612	2617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017058	A	7	7	2626	2632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017058	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017058	TAAT	2	8	2661	2668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017058	TCA	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
74	NC_017058	GAT	2	6	2712	2717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500942
75	NC_017058	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
76	NC_017058	T	7	7	2785	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
77	NC_017058	T	6	6	2794	2799	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
78	NC_017058	CAT	2	6	2801	2806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
79	NC_017058	ATC	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
80	NC_017058	CAG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
81	NC_017058	CAAT	2	8	2896	2903	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
82	NC_017058	GCA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
83	NC_017058	CTT	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500942
84	NC_017058	ATA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
85	NC_017058	TTTC	2	8	3071	3078	0 %	75 %	0 %	25 %	383500942
86	NC_017058	ACA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500942
87	NC_017058	CAT	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
88	NC_017058	ACT	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
89	NC_017058	CTA	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
90	NC_017058	ATA	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
91	NC_017058	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
92	NC_017058	ACG	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500942
93	NC_017058	GAA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500942
94	NC_017058	TTA	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
95	NC_017058	T	6	6	3562	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
96	NC_017058	T	6	6	3618	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
97	NC_017058	CCA	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500942
98	NC_017058	ATCA	2	8	3642	3649	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
99	NC_017058	CAT	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500942
100	NC_017058	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	383500942
101	NC_017058	ATA	2	6	3710	3715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500942
102	NC_017058	A	7	7	3736	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	383500942
103	NC_017058	TAT	2	6	3743	3748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500942
104	NC_017058	T	6	6	3765	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	383500942
105	NC_017058	ACA	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500942
106	NC_017058	ATT	2	6	3843	3848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
107	NC_017058	TAAA	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	383500943
108	NC_017058	ATA	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
109	NC_017058	GCT	2	6	4014	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
110	NC_017058	TAC	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
111	NC_017058	AT	3	6	4059	4064	50 %	50 %	0 %	0 %	383500943
112	NC_017058	GAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500943
113	NC_017058	GCA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500943
114	NC_017058	CTG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
115	NC_017058	TCT	2	6	4274	4279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500943
116	NC_017058	TCT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500943
117	NC_017058	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500943
118	NC_017058	TAA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
119	NC_017058	CGT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
120	NC_017058	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
121	NC_017058	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500943
122	NC_017058	T	8	8	4515	4522	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
123	NC_017058	T	7	7	4537	4543	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
124	NC_017058	GCT	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
125	NC_017058	ATT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
126	NC_017058	TTA	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
127	NC_017058	ACT	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
128	NC_017058	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500943
129	NC_017058	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500943
130	NC_017058	TC	3	6	4808	4813	0 %	50 %	0 %	50 %	383500943
131	NC_017058	GGA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383500943
132	NC_017058	AGT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500943
133	NC_017058	A	6	6	4859	4864	100 %	0 %	0 %	0 %	383500943
134	NC_017058	TAT	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500943
135	NC_017058	TGT	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500943
136	NC_017058	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	383500943
137	NC_017058	TAA	2	6	4902	4907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017058	ATA	2	6	4930	4935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017058	TA	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017058	TTAA	2	8	4942	4949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017058	A	6	6	4963	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017058	T	7	7	5014	5020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017058	T	6	6	5032	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017058	AAATT	2	10	5039	5048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017058	TAC	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017058	TGA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017058	TTA	2	6	5377	5382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017058	TTA	3	9	5477	5485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017058	AAC	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017058	AT	4	8	5505	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017058	TAAC	2	8	10301	10308	50 %	25 %	0 %	25 %	383500946
270	NC_017058	TA	3	6	10370	10375	50 %	50 %	0 %	0 %	383500946
271	NC_017058	ACTA	2	8	10422	10429	50 %	25 %	0 %	25 %	383500946
272	NC_017058	ACC	2	6	10456	10461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500946
273	NC_017058	TTA	2	6	10559	10564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500946
274	NC_017058	CAA	2	6	10628	10633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500946
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401	NC_017058	AT	3	6	15813	15818	50 %	50 %	0 %	0 %	383500948
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