MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 30217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017057	GAA	2	6	550679	550684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500522
15003	NC_017057	TAAA	2	8	550812	550819	75 %	25 %	0 %	0 %	383500522
15004	NC_017057	ATAAAG	2	12	550821	550832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383500522
15005	NC_017057	ACT	2	6	550835	550840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500522
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15009	NC_017057	AAG	2	6	551043	551048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500522
15010	NC_017057	AAG	2	6	551053	551058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500522
15011	NC_017057	TTG	2	6	551089	551094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_017057	TTG	2	6	551100	551105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_017057	ATT	2	6	551195	551200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017057	TGG	2	6	551255	551260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383500523
15015	NC_017057	GCC	2	6	551315	551320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500523
15016	NC_017057	TAC	2	6	551372	551377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500523
15017	NC_017057	TAC	2	6	551392	551397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500523
15018	NC_017057	AT	3	6	551450	551455	50 %	50 %	0 %	0 %	383500523
15019	NC_017057	TTC	2	6	551462	551467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500523
15020	NC_017057	TAAA	2	8	551471	551478	75 %	25 %	0 %	0 %	383500523
15021	NC_017057	T	6	6	551489	551494	0 %	100 %	0 %	0 %	383500523
15022	NC_017057	TA	4	8	551572	551579	50 %	50 %	0 %	0 %	383500523
15023	NC_017057	TTA	2	6	551580	551585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500523
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15025	NC_017057	CAT	2	6	551605	551610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500523
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15029	NC_017057	TAT	2	6	551777	551782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500523
15030	NC_017057	TAG	2	6	551808	551813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500523
15031	NC_017057	TTC	2	6	551822	551827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500523
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15033	NC_017057	TA	3	6	551871	551876	50 %	50 %	0 %	0 %	383500523
15034	NC_017057	TAA	2	6	551889	551894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500523
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15037	NC_017057	AAT	2	6	551958	551963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500523
15038	NC_017057	CTA	2	6	552000	552005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500523
15039	NC_017057	TTTTAA	2	12	552041	552052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500523
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15041	NC_017057	T	6	6	552091	552096	0 %	100 %	0 %	0 %	383500523
15042	NC_017057	A	8	8	552113	552120	100 %	0 %	0 %	0 %	383500523
15043	NC_017057	TA	3	6	552176	552181	50 %	50 %	0 %	0 %	383500523
15044	NC_017057	TAT	2	6	552193	552198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500523
15045	NC_017057	GAG	2	6	552217	552222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383500523
15046	NC_017057	GTA	2	6	552226	552231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500523
15047	NC_017057	TAAT	2	8	552247	552254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_017057	TATAT	2	10	552282	552291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_017057	TA	3	6	552312	552317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_017057	TGA	2	6	552339	552344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500524
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15052	NC_017057	GA	3	6	552373	552378	50 %	0 %	50 %	0 %	383500524
15053	NC_017057	TTG	2	6	552414	552419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500524
15054	NC_017057	A	6	6	552425	552430	100 %	0 %	0 %	0 %	383500524
15055	NC_017057	CT	3	6	552443	552448	0 %	50 %	0 %	50 %	383500524
15056	NC_017057	TAC	2	6	552451	552456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500524
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15060	NC_017057	A	6	6	552503	552508	100 %	0 %	0 %	0 %	383500524
15061	NC_017057	GAA	2	6	552653	552658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500524
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15065	NC_017057	AATG	2	8	552763	552770	50 %	25 %	25 %	0 %	383500524
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15068	NC_017057	AAACA	2	10	552882	552891	80 %	0 %	0 %	20 %	383500524
15069	NC_017057	TTA	2	6	552896	552901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500524
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15089	NC_017057	TGA	2	6	553606	553611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500524
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15095	NC_017057	ATAG	2	8	554048	554055	50 %	25 %	25 %	0 %	383500524
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15106	NC_017057	CTG	2	6	554376	554381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500524
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15111	NC_017057	AATA	2	8	554665	554672	75 %	25 %	0 %	0 %	383500524
15112	NC_017057	TTA	2	6	554701	554706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_017057	GCAAAA	2	12	554713	554724	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15114	NC_017057	GTT	2	6	554750	554755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_017057	ATG	2	6	554809	554814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_017057	AT	3	6	554816	554821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_017057	ATA	2	6	554883	554888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_017057	TATC	2	8	554914	554921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15119	NC_017057	TTA	2	6	554928	554933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_017057	TAA	2	6	554977	554982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_017057	A	6	6	555000	555005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15497	NC_017057	T	8	8	569180	569187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_017057	A	7	7	569188	569194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_017057	TAGAT	2	10	569207	569216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_017057	ACA	2	6	569235	569240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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