MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 30217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017057	TTA	2	6	408373	408378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017057	AATAA	2	10	408392	408401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_017057	ACA	2	6	408406	408411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_017057	AAT	2	6	408443	408448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_017057	A	7	7	408459	408465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017057	TAA	2	6	408491	408496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_017057	TAA	2	6	408581	408586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017057	ATTA	2	8	408593	408600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017057	A	6	6	408629	408634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_017057	AT	3	6	408648	408653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_017057	A	6	6	408678	408683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017057	GCA	2	6	408799	408804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500409
11013	NC_017057	AAAT	2	8	408831	408838	75 %	25 %	0 %	0 %	383500409
11014	NC_017057	TAAA	2	8	408887	408894	75 %	25 %	0 %	0 %	383500409
11015	NC_017057	TGT	2	6	408906	408911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500409
11016	NC_017057	AATA	2	8	408975	408982	75 %	25 %	0 %	0 %	383500409
11017	NC_017057	GTA	2	6	409025	409030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500409
11018	NC_017057	AAAG	2	8	409084	409091	75 %	0 %	25 %	0 %	383500409
11019	NC_017057	TAT	2	6	409179	409184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500409
11020	NC_017057	AGCA	2	8	409197	409204	50 %	0 %	25 %	25 %	383500409
11021	NC_017057	TAA	2	6	409214	409219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500409
11022	NC_017057	TATT	2	8	409266	409273	25 %	75 %	0 %	0 %	383500409
11023	NC_017057	AAT	2	6	409302	409307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500409
11024	NC_017057	TAA	2	6	409371	409376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500409
11025	NC_017057	AT	3	6	409405	409410	50 %	50 %	0 %	0 %	383500409
11026	NC_017057	GAAATT	2	12	409417	409428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500409
11027	NC_017057	TAG	2	6	409448	409453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500409
11028	NC_017057	CCT	2	6	409501	409506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500409
11029	NC_017057	TA	4	8	409573	409580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_017057	GGT	2	6	409611	409616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383500410
11031	NC_017057	ATT	2	6	409665	409670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500410
11032	NC_017057	A	7	7	409708	409714	100 %	0 %	0 %	0 %	383500410
11033	NC_017057	AAG	2	6	409717	409722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500410
11034	NC_017057	TGA	2	6	409793	409798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500410
11035	NC_017057	TGC	2	6	409829	409834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500410
11036	NC_017057	TGC	2	6	409919	409924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500410
11037	NC_017057	TAA	2	6	409928	409933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500410
11038	NC_017057	TAGCAA	2	12	410023	410034	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500410
11039	NC_017057	TCA	2	6	410129	410134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500410
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11041	NC_017057	GTA	2	6	410320	410325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500410
11042	NC_017057	GA	3	6	410359	410364	50 %	0 %	50 %	0 %	383500410
11043	NC_017057	ATC	2	6	410384	410389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500410
11044	NC_017057	GAT	2	6	410409	410414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500410
11045	NC_017057	ATGG	2	8	410439	410446	25 %	25 %	50 %	0 %	383500410
11046	NC_017057	A	6	6	410487	410492	100 %	0 %	0 %	0 %	383500410
11047	NC_017057	GAT	2	6	410505	410510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500410
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11049	NC_017057	TTTAAA	2	12	410534	410545	50 %	50 %	0 %	0 %	383500410
11050	NC_017057	TTA	3	9	410559	410567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500410
11051	NC_017057	A	6	6	410594	410599	100 %	0 %	0 %	0 %	383500410
11052	NC_017057	TTA	2	6	410639	410644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500411
11053	NC_017057	T	8	8	410735	410742	0 %	100 %	0 %	0 %	383500411
11054	NC_017057	GAT	2	6	410743	410748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500411
11055	NC_017057	ATT	2	6	410768	410773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500411
11056	NC_017057	ATA	2	6	410792	410797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500411
11057	NC_017057	GAAAAA	2	12	410845	410856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383500411
11058	NC_017057	TGTTT	2	10	410865	410874	0 %	80 %	20 %	0 %	383500411
11059	NC_017057	CGT	2	6	410917	410922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500411
11060	NC_017057	GTT	2	6	410957	410962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500411
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11062	NC_017057	ATT	2	6	410998	411003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500411
11063	NC_017057	TCC	2	6	411072	411077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500411
11064	NC_017057	ATT	3	9	411165	411173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500411
11065	NC_017057	AAAGC	2	10	411175	411184	60 %	0 %	20 %	20 %	383500411
11066	NC_017057	GAA	2	6	411211	411216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500411
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11076	NC_017057	ATA	2	6	411608	411613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500411
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11082	NC_017057	TA	3	6	411852	411857	50 %	50 %	0 %	0 %	383500412
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11089	NC_017057	AC	3	6	412238	412243	50 %	0 %	0 %	50 %	383500412
11090	NC_017057	TAC	2	6	412268	412273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500412
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11093	NC_017057	ATT	2	6	412321	412326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500412
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11100	NC_017057	AAAT	2	8	412642	412649	75 %	25 %	0 %	0 %	383500412
11101	NC_017057	ATT	2	6	412661	412666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500412
11102	NC_017057	CTA	2	6	412672	412677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500412
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11105	NC_017057	TAAA	2	8	412825	412832	75 %	25 %	0 %	0 %	383500412
11106	NC_017057	ATG	3	9	412844	412852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500412
11107	NC_017057	TAA	2	6	412862	412867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017057	AAAT	2	8	412893	412900	75 %	25 %	0 %	0 %	383500413
11109	NC_017057	A	7	7	412954	412960	100 %	0 %	0 %	0 %	383500413
11110	NC_017057	TATAT	2	10	413095	413104	40 %	60 %	0 %	0 %	383500413
11111	NC_017057	ATA	2	6	413120	413125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500413
11112	NC_017057	AAG	2	6	413142	413147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500413
11113	NC_017057	TCATA	2	10	413164	413173	40 %	40 %	0 %	20 %	383500413
11114	NC_017057	TATC	2	8	413272	413279	25 %	50 %	0 %	25 %	383500413
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11118	NC_017057	TTTA	2	8	413368	413375	25 %	75 %	0 %	0 %	383500413
11119	NC_017057	TTC	2	6	413452	413457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500413
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