MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 30186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_017056	ACA	2	6	1031544	1031549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28002	NC_017056	CTTAC	2	10	1031577	1031586	20 %	40 %	0 %	40 %	383500038
28003	NC_017056	CTC	2	6	1031643	1031648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500038
28004	NC_017056	TA	3	6	1031669	1031674	50 %	50 %	0 %	0 %	383500038
28005	NC_017056	T	7	7	1031680	1031686	0 %	100 %	0 %	0 %	383500038
28006	NC_017056	TCA	2	6	1031719	1031724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500038
28007	NC_017056	ATA	3	9	1031813	1031821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500038
28008	NC_017056	T	8	8	1031869	1031876	0 %	100 %	0 %	0 %	383500038
28009	NC_017056	TTTA	2	8	1031997	1032004	25 %	75 %	0 %	0 %	383500038
28010	NC_017056	GATAA	2	10	1032101	1032110	60 %	20 %	20 %	0 %	383500038
28011	NC_017056	ATTAT	2	10	1032166	1032175	40 %	60 %	0 %	0 %	383500038
28012	NC_017056	AT	3	6	1032305	1032310	50 %	50 %	0 %	0 %	383500038
28013	NC_017056	T	7	7	1032314	1032320	0 %	100 %	0 %	0 %	383500038
28014	NC_017056	TAA	2	6	1032327	1032332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500038
28015	NC_017056	AAC	2	6	1032406	1032411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500038
28016	NC_017056	TAT	2	6	1032500	1032505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500038
28017	NC_017056	GTAT	2	8	1032541	1032548	25 %	50 %	25 %	0 %	383500038
28018	NC_017056	T	6	6	1032602	1032607	0 %	100 %	0 %	0 %	383500038
28019	NC_017056	CTA	2	6	1032620	1032625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500038
28020	NC_017056	GTCA	2	8	1032630	1032637	25 %	25 %	25 %	25 %	383500038
28021	NC_017056	TTC	2	6	1032723	1032728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500038
28022	NC_017056	TA	3	6	1032732	1032737	50 %	50 %	0 %	0 %	383500038
28023	NC_017056	ATC	2	6	1032831	1032836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500038
28024	NC_017056	ATA	2	6	1032852	1032857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500038
28025	NC_017056	CTAA	2	8	1032859	1032866	50 %	25 %	0 %	25 %	383500038
28026	NC_017056	AT	3	6	1032875	1032880	50 %	50 %	0 %	0 %	383500038
28027	NC_017056	TAT	3	9	1032878	1032886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500038
28028	NC_017056	TG	3	6	1032925	1032930	0 %	50 %	50 %	0 %	383500038
28029	NC_017056	TTC	2	6	1032933	1032938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500038
28030	NC_017056	A	6	6	1033000	1033005	100 %	0 %	0 %	0 %	383500038
28031	NC_017056	AT	3	6	1033016	1033021	50 %	50 %	0 %	0 %	383500038
28032	NC_017056	A	6	6	1033034	1033039	100 %	0 %	0 %	0 %	383500038
28033	NC_017056	TCT	2	6	1033056	1033061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500038
28034	NC_017056	CAAAAG	2	12	1033094	1033105	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383500038
28035	NC_017056	CAC	2	6	1033180	1033185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28036	NC_017056	A	6	6	1033208	1033213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28037	NC_017056	GGT	2	6	1033225	1033230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28038	NC_017056	A	8	8	1033280	1033287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28039	NC_017056	TA	3	6	1033302	1033307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28040	NC_017056	TAT	2	6	1033316	1033321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28041	NC_017056	T	6	6	1033321	1033326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28042	NC_017056	A	6	6	1033329	1033334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28043	NC_017056	TA	3	6	1033376	1033381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28044	NC_017056	TA	3	6	1033385	1033390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28045	NC_017056	ATA	2	6	1033394	1033399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28046	NC_017056	TA	3	6	1033440	1033445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28047	NC_017056	ATA	2	6	1033455	1033460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28048	NC_017056	ATC	2	6	1033462	1033467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28049	NC_017056	AAC	2	6	1033482	1033487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28050	NC_017056	ATTAT	2	10	1033525	1033534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28051	NC_017056	CAA	2	6	1033559	1033564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28052	NC_017056	GCA	2	6	1033579	1033584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28053	NC_017056	TCA	2	6	1033603	1033608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28054	NC_017056	CTT	2	6	1033637	1033642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28055	NC_017056	AAT	2	6	1033672	1033677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28056	NC_017056	TA	3	6	1033705	1033710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28057	NC_017056	TAT	2	6	1033722	1033727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28058	NC_017056	ACA	2	6	1033731	1033736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28059	NC_017056	TTA	2	6	1033738	1033743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28060	NC_017056	CTA	2	6	1033775	1033780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28061	NC_017056	ATT	2	6	1033838	1033843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28062	NC_017056	ATT	2	6	1033860	1033865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28063	NC_017056	CTAC	2	8	1033887	1033894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28064	NC_017056	TA	3	6	1033923	1033928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28065	NC_017056	A	8	8	1033936	1033943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28066	NC_017056	GAA	2	6	1033965	1033970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28067	NC_017056	ACT	2	6	1033974	1033979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28068	NC_017056	GTA	2	6	1034021	1034026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28069	NC_017056	CTAC	2	8	1034030	1034037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28070	NC_017056	TA	3	6	1034038	1034043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28071	NC_017056	ATT	2	6	1034061	1034066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28072	NC_017056	TAA	2	6	1034128	1034133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28073	NC_017056	TA	3	6	1034146	1034151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28074	NC_017056	CT	3	6	1034196	1034201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28075	NC_017056	A	6	6	1034236	1034241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28076	NC_017056	TTTA	2	8	1034269	1034276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28077	NC_017056	AGTAA	2	10	1034284	1034293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28078	NC_017056	TAGA	2	8	1034319	1034326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28079	NC_017056	GA	3	6	1034325	1034330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28080	NC_017056	TAA	2	6	1034343	1034348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28081	NC_017056	A	6	6	1034359	1034364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28082	NC_017056	ATC	2	6	1034392	1034397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28083	NC_017056	TTA	2	6	1034409	1034414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28084	NC_017056	AAT	2	6	1034442	1034447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28085	NC_017056	ACC	2	6	1034451	1034456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28086	NC_017056	CAGT	2	8	1034478	1034485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28087	NC_017056	CT	3	6	1034504	1034509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28088	NC_017056	TAA	2	6	1034521	1034526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28089	NC_017056	AT	3	6	1034548	1034553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28090	NC_017056	TAA	2	6	1034575	1034580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28091	NC_017056	TAT	2	6	1034586	1034591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28092	NC_017056	TAT	2	6	1034611	1034616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28093	NC_017056	TAC	2	6	1034627	1034632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28094	NC_017056	TTACTG	2	12	1034668	1034679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28095	NC_017056	ATT	2	6	1034681	1034686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28096	NC_017056	TTA	2	6	1034728	1034733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28097	NC_017056	AG	3	6	1034846	1034851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28098	NC_017056	AGT	2	6	1034915	1034920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28099	NC_017056	ATG	3	9	1034930	1034938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28100	NC_017056	AAATTT	2	12	1034957	1034968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28101	NC_017056	AGT	2	6	1035027	1035032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28102	NC_017056	ATAA	2	8	1035051	1035058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28103	NC_017056	CTA	2	6	1035065	1035070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28104	NC_017056	AAT	2	6	1035081	1035086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28105	NC_017056	TTA	2	6	1035109	1035114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28106	NC_017056	AGCAA	2	10	1035133	1035142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28107	NC_017056	TATTGT	2	12	1035149	1035160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28108	NC_017056	ATA	2	6	1035168	1035173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28109	NC_017056	TACTG	2	10	1035201	1035210	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28110	NC_017056	TAT	2	6	1035236	1035241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28111	NC_017056	AAT	2	6	1035261	1035266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28112	NC_017056	TTA	2	6	1035288	1035293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28113	NC_017056	TAT	2	6	1035315	1035320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28114	NC_017056	TAA	2	6	1035324	1035329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28115	NC_017056	A	6	6	1035362	1035367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28116	NC_017056	TAAA	2	8	1035436	1035443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28117	NC_017056	AAAT	2	8	1035500	1035507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28118	NC_017056	ATA	2	6	1035525	1035530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28119	NC_017056	TTA	2	6	1035531	1035536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28120	NC_017056	AAT	2	6	1035562	1035567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28121	NC_017056	AT	3	6	1035584	1035589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28122	NC_017056	TAAT	2	8	1035621	1035628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28123	NC_017056	ACATA	2	10	1035790	1035799	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28124	NC_017056	T	6	6	1035945	1035950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28125	NC_017056	TTA	2	6	1035966	1035971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28126	NC_017056	ATT	2	6	1036014	1036019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28493	NC_017056	TA	3	6	1049018	1049023	50 %	50 %	0 %	0 %	383500051
28494	NC_017056	CCT	2	6	1049085	1049090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500051
28495	NC_017056	AGT	2	6	1049096	1049101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500051
28496	NC_017056	TA	3	6	1049120	1049125	50 %	50 %	0 %	0 %	383500051
28497	NC_017056	TAAT	2	8	1049149	1049156	50 %	50 %	0 %	0 %	383500051
28498	NC_017056	A	6	6	1049183	1049188	100 %	0 %	0 %	0 %	383500051
28499	NC_017056	TTGCA	2	10	1049189	1049198	20 %	40 %	20 %	20 %	383500051
28500	NC_017056	TCT	2	6	1049199	1049204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500051

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