MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 30186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017056	ATAA	2	8	551373	551380	75 %	25 %	0 %	0 %	383499687
15003	NC_017056	CAT	2	6	551382	551387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499687
15004	NC_017056	TAA	2	6	551413	551418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499687
15005	NC_017056	CCG	2	6	551474	551479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383499687
15006	NC_017056	AAG	2	6	551481	551486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499687
15007	NC_017056	TAT	2	6	551554	551559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499687
15008	NC_017056	TAG	2	6	551585	551590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499687
15009	NC_017056	TTC	2	6	551599	551604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499687
15010	NC_017056	CTT	2	6	551628	551633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499687
15011	NC_017056	TA	3	6	551648	551653	50 %	50 %	0 %	0 %	383499687
15012	NC_017056	TAA	2	6	551666	551671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499687
15013	NC_017056	GCT	2	6	551675	551680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499687
15014	NC_017056	TAAA	2	8	551710	551717	75 %	25 %	0 %	0 %	383499687
15015	NC_017056	AAT	2	6	551735	551740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499687
15016	NC_017056	CTA	2	6	551777	551782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499687
15017	NC_017056	TTTTAA	2	12	551818	551829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499687
15018	NC_017056	ATT	2	6	551833	551838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499687
15019	NC_017056	T	6	6	551868	551873	0 %	100 %	0 %	0 %	383499687
15020	NC_017056	A	8	8	551890	551897	100 %	0 %	0 %	0 %	383499687
15021	NC_017056	TA	3	6	551953	551958	50 %	50 %	0 %	0 %	383499687
15022	NC_017056	TAT	2	6	551970	551975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499687
15023	NC_017056	GAG	2	6	551994	551999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383499687
15024	NC_017056	GTA	2	6	552003	552008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499687
15025	NC_017056	TAAT	2	8	552024	552031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_017056	TATAT	2	10	552059	552068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_017056	TA	3	6	552089	552094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_017056	TGA	2	6	552116	552121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499688
15029	NC_017056	A	6	6	552124	552129	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15030	NC_017056	GA	3	6	552150	552155	50 %	0 %	50 %	0 %	383499688
15031	NC_017056	TTG	2	6	552191	552196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499688
15032	NC_017056	A	6	6	552202	552207	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15033	NC_017056	CT	3	6	552220	552225	0 %	50 %	0 %	50 %	383499688
15034	NC_017056	TAC	2	6	552228	552233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499688
15035	NC_017056	GAA	2	6	552241	552246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15036	NC_017056	AAT	2	6	552247	552252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499688
15037	NC_017056	AT	3	6	552258	552263	50 %	50 %	0 %	0 %	383499688
15038	NC_017056	A	6	6	552280	552285	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15039	NC_017056	GAA	2	6	552430	552435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15040	NC_017056	ATT	2	6	552457	552462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15041	NC_017056	GAA	2	6	552469	552474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15042	NC_017056	ATA	2	6	552488	552493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499688
15043	NC_017056	AATG	2	8	552540	552547	50 %	25 %	25 %	0 %	383499688
15044	NC_017056	ATT	2	6	552568	552573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15045	NC_017056	AT	3	6	552626	552631	50 %	50 %	0 %	0 %	383499688
15046	NC_017056	AAACA	2	10	552659	552668	80 %	0 %	0 %	20 %	383499688
15047	NC_017056	TTA	2	6	552673	552678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15048	NC_017056	GAA	2	6	552679	552684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15049	NC_017056	ACT	2	6	552706	552711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499688
15050	NC_017056	TTA	2	6	552713	552718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15051	NC_017056	GCAT	2	8	552756	552763	25 %	25 %	25 %	25 %	383499688
15052	NC_017056	CAA	2	6	552766	552771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499688
15053	NC_017056	A	6	6	552791	552796	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15054	NC_017056	ATT	3	9	552806	552814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15055	NC_017056	TGA	2	6	552849	552854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499688
15056	NC_017056	A	7	7	552883	552889	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15057	NC_017056	AAG	2	6	552911	552916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15058	NC_017056	CTGAAT	2	12	552929	552940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383499688
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15060	NC_017056	A	6	6	553067	553072	100 %	0 %	0 %	0 %	383499688
15061	NC_017056	TAT	2	6	553116	553121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15062	NC_017056	TAT	2	6	553169	553174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499688
15063	NC_017056	CCA	2	6	553186	553191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383499688
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15065	NC_017056	TGG	2	6	553263	553268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499688
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15068	NC_017056	CTTG	2	8	553434	553441	0 %	50 %	25 %	25 %	383499688
15069	NC_017056	TGT	2	6	553512	553517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499688
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15073	NC_017056	ATAG	2	8	553825	553832	50 %	25 %	25 %	0 %	383499688
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15077	NC_017056	AGA	2	6	553890	553895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499688
15078	NC_017056	GTA	2	6	553904	553909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499688
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15084	NC_017056	CTG	2	6	554153	554158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499688
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15088	NC_017056	ACC	2	6	554358	554363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383499688
15089	NC_017056	AATA	2	8	554442	554449	75 %	25 %	0 %	0 %	383499688
15090	NC_017056	TTA	2	6	554478	554483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_017056	GCAAAA	2	12	554490	554501	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15092	NC_017056	GTT	2	6	554527	554532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_017056	ATG	2	6	554586	554591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_017056	AT	3	6	554593	554598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_017056	ATA	2	6	554660	554665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_017056	TATC	2	8	554691	554698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15097	NC_017056	TTA	2	6	554705	554710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_017056	T	6	6	554745	554750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_017056	A	6	6	554778	554783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_017056	T	6	6	554798	554803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_017056	TTAA	3	12	554853	554864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_017056	A	6	6	554890	554895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_017056	ATT	2	6	554906	554911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_017056	AAT	2	6	554919	554924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_017056	CATTAA	2	12	554929	554940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15106	NC_017056	TTA	2	6	554943	554948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_017056	AT	3	6	554956	554961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_017056	T	7	7	554967	554973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_017056	TTAA	2	8	554977	554984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017056	TAT	2	6	554987	554992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017056	ATTAAT	2	12	554994	555005	50 %	50 %	0 %	0 %	383499689
15112	NC_017056	A	6	6	555007	555012	100 %	0 %	0 %	0 %	383499689
15113	NC_017056	ATT	2	6	555060	555065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499689
15114	NC_017056	ATT	2	6	555091	555096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499689
15115	NC_017056	TAA	2	6	555099	555104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499689
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15117	NC_017056	GGA	2	6	555232	555237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383499689
15118	NC_017056	TGG	2	6	555267	555272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499689
15119	NC_017056	AAGT	2	8	555278	555285	50 %	25 %	25 %	0 %	383499689
15120	NC_017056	TAA	2	6	555360	555365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499689
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15122	NC_017056	TAA	2	6	555447	555452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499689
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