MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 30186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017056	TTCT	2	8	242020	242027	0 %	75 %	0 %	25 %	383499445
6502	NC_017056	TCA	2	6	242031	242036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499445
6503	NC_017056	TAA	2	6	242041	242046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499445
6504	NC_017056	ATT	2	6	242116	242121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6505	NC_017056	T	7	7	242183	242189	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6506	NC_017056	TTAA	2	8	242220	242227	50 %	50 %	0 %	0 %	383499446
6507	NC_017056	GATCT	2	10	242228	242237	20 %	40 %	20 %	20 %	383499446
6508	NC_017056	TAT	2	6	242260	242265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6509	NC_017056	ATTA	2	8	242276	242283	50 %	50 %	0 %	0 %	383499446
6510	NC_017056	TAT	2	6	242321	242326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6511	NC_017056	CTT	2	6	242371	242376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499446
6512	NC_017056	TAA	2	6	242378	242383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499446
6513	NC_017056	TAG	2	6	242386	242391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499446
6514	NC_017056	T	6	6	242421	242426	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6515	NC_017056	TTA	2	6	242448	242453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6516	NC_017056	TAT	2	6	242479	242484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6517	NC_017056	AT	3	6	242488	242493	50 %	50 %	0 %	0 %	383499446
6518	NC_017056	T	6	6	242500	242505	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6519	NC_017056	ATA	2	6	242521	242526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499446
6520	NC_017056	GGT	2	6	242583	242588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499446
6521	NC_017056	AGCTA	2	10	242609	242618	40 %	20 %	20 %	20 %	383499446
6522	NC_017056	CTG	2	6	242626	242631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499446
6523	NC_017056	AT	3	6	242653	242658	50 %	50 %	0 %	0 %	383499446
6524	NC_017056	TTA	2	6	242704	242709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6525	NC_017056	T	6	6	242743	242748	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6526	NC_017056	TAC	2	6	242789	242794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499446
6527	NC_017056	ATCA	2	8	242795	242802	50 %	25 %	0 %	25 %	383499446
6528	NC_017056	TGT	2	6	242817	242822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499446
6529	NC_017056	TTA	2	6	242824	242829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6530	NC_017056	TA	3	6	242911	242916	50 %	50 %	0 %	0 %	383499446
6531	NC_017056	GTC	2	6	242943	242948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499446
6532	NC_017056	CTA	2	6	242953	242958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499446
6533	NC_017056	GTTC	2	8	243021	243028	0 %	50 %	25 %	25 %	383499446
6534	NC_017056	GTT	2	6	243046	243051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499446
6535	NC_017056	TTA	2	6	243063	243068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6536	NC_017056	ATA	2	6	243075	243080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499446
6537	NC_017056	ATT	2	6	243083	243088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6538	NC_017056	CT	3	6	243093	243098	0 %	50 %	0 %	50 %	383499446
6539	NC_017056	T	7	7	243122	243128	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6540	NC_017056	TTA	2	6	243168	243173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6541	NC_017056	TAC	2	6	243191	243196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499446
6542	NC_017056	GTC	2	6	243203	243208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499446
6543	NC_017056	CCA	2	6	243210	243215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383499446
6544	NC_017056	CTT	2	6	243256	243261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499446
6545	NC_017056	ACC	2	6	243290	243295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383499446
6546	NC_017056	TGC	2	6	243431	243436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499446
6547	NC_017056	TTA	2	6	243460	243465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6548	NC_017056	ATT	2	6	243479	243484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6549	NC_017056	T	6	6	243483	243488	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6550	NC_017056	T	6	6	243507	243512	0 %	100 %	0 %	0 %	383499446
6551	NC_017056	TAAA	2	8	243516	243523	75 %	25 %	0 %	0 %	383499446
6552	NC_017056	TTA	2	6	243558	243563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
6553	NC_017056	AATTT	2	10	243568	243577	40 %	60 %	0 %	0 %	383499446
6554	NC_017056	ACT	2	6	243584	243589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499446
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6556	NC_017056	TAAC	2	8	243610	243617	50 %	25 %	0 %	25 %	383499446
6557	NC_017056	A	6	6	243619	243624	100 %	0 %	0 %	0 %	383499446
6558	NC_017056	TAT	2	6	243691	243696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499446
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6560	NC_017056	TAA	2	6	243766	243771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499446
6561	NC_017056	TAG	2	6	243811	243816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499446
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6563	NC_017056	ATTTT	2	10	243900	243909	20 %	80 %	0 %	0 %	383499447
6564	NC_017056	T	6	6	243906	243911	0 %	100 %	0 %	0 %	383499447
6565	NC_017056	AT	3	6	243938	243943	50 %	50 %	0 %	0 %	383499447
6566	NC_017056	TTG	2	6	243963	243968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499447
6567	NC_017056	TGT	2	6	244019	244024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499447
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6569	NC_017056	GTA	2	6	244073	244078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499447
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6573	NC_017056	AGAGT	2	10	244211	244220	40 %	20 %	40 %	0 %	383499447
6574	NC_017056	TTTA	2	8	244225	244232	25 %	75 %	0 %	0 %	383499447
6575	NC_017056	GAT	2	6	244290	244295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499447
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6579	NC_017056	TTA	2	6	244417	244422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_017056	AACAA	2	10	244463	244472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6581	NC_017056	AT	3	6	244481	244486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_017056	ACT	2	6	244532	244537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6584	NC_017056	TAT	3	9	244558	244566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6590	NC_017056	A	6	6	244868	244873	100 %	0 %	0 %	0 %	383499448
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6597	NC_017056	CAT	2	6	245194	245199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_017056	TGC	2	6	245252	245257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499449
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6605	NC_017056	TTG	2	6	245501	245506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499449
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6609	NC_017056	CT	3	6	245705	245710	0 %	50 %	0 %	50 %	383499449
6610	NC_017056	GTAT	2	8	245784	245791	25 %	50 %	25 %	0 %	383499449
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6613	NC_017056	GTT	2	6	245904	245909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499449
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