MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017051	TGA	2	6	659896	659901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489624
18003	NC_017051	AGT	2	6	659908	659913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489624
18004	NC_017051	AATA	2	8	659951	659958	75 %	25 %	0 %	0 %	383489624
18005	NC_017051	TGTC	2	8	659966	659973	0 %	50 %	25 %	25 %	383489624
18006	NC_017051	AAT	2	6	660037	660042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489624
18007	NC_017051	ATA	2	6	660097	660102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489624
18008	NC_017051	AT	3	6	660200	660205	50 %	50 %	0 %	0 %	383489624
18009	NC_017051	TTG	2	6	660206	660211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489624
18010	NC_017051	CCA	2	6	660223	660228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489624
18011	NC_017051	AT	3	6	660248	660253	50 %	50 %	0 %	0 %	383489624
18012	NC_017051	TTTG	2	8	660259	660266	0 %	75 %	25 %	0 %	383489624
18013	NC_017051	GCT	2	6	660283	660288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489624
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18015	NC_017051	CTA	2	6	660395	660400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489624
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18017	NC_017051	GAG	2	6	660428	660433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489624
18018	NC_017051	ACT	2	6	660489	660494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489624
18019	NC_017051	TATG	2	8	660521	660528	25 %	50 %	25 %	0 %	383489624
18020	NC_017051	T	6	6	660654	660659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_017051	TA	3	6	660670	660675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_017051	A	7	7	660688	660694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_017051	TTAA	2	8	660801	660808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_017051	ATA	2	6	660818	660823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_017051	TGT	2	6	660924	660929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_017051	ATA	2	6	660937	660942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_017051	TAA	2	6	660972	660977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_017051	AT	3	6	661028	661033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_017051	T	6	6	661045	661050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_017051	AT	3	6	661051	661056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_017051	ACA	3	9	661061	661069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18032	NC_017051	ATA	2	6	661073	661078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_017051	AT	4	8	661086	661093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_017051	TAA	2	6	661118	661123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_017051	ACTAA	2	10	661131	661140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18036	NC_017051	TAT	2	6	661155	661160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_017051	CTA	2	6	661175	661180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_017051	TAC	2	6	661194	661199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_017051	AT	3	6	661235	661240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_017051	ATG	2	6	661312	661317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_017051	AAT	2	6	661328	661333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_017051	AT	3	6	661366	661371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_017051	ATA	2	6	661380	661385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_017051	TAAT	2	8	661418	661425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_017051	TAAT	2	8	661441	661448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_017051	CTT	2	6	661472	661477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_017051	TAAT	2	8	661490	661497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_017051	ATTC	2	8	661514	661521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18049	NC_017051	TGC	2	6	661681	661686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18051	NC_017051	ATT	2	6	661717	661722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_017051	TATT	2	8	661854	661861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_017051	TAT	2	6	661894	661899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_017051	AT	3	6	661917	661922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_017051	TAC	2	6	661926	661931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_017051	ATTAT	2	10	661963	661972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_017051	ATC	2	6	662005	662010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_017051	TAC	2	6	662079	662084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_017051	TCA	2	6	662095	662100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18060	NC_017051	ATT	2	6	662132	662137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_017051	TAATT	2	10	662229	662238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_017051	TTA	2	6	662280	662285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_017051	ATGA	2	8	662298	662305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_017051	ATTA	2	8	662324	662331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_017051	AAT	2	6	662345	662350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_017051	ATA	2	6	662373	662378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_017051	GAT	2	6	662421	662426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18070	NC_017051	ATTTT	2	10	662491	662500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_017051	TGTA	2	8	662504	662511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18073	NC_017051	A	6	6	662548	662553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_017051	ATA	3	9	662582	662590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18097	NC_017051	TGG	2	6	663118	663123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489625
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18115	NC_017051	AT	3	6	663566	663571	50 %	50 %	0 %	0 %	383489625
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