MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017051	CGG	2	6	515584	515589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489518
14002	NC_017051	GAT	2	6	515663	515668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489518
14003	NC_017051	TAA	2	6	515670	515675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489518
14004	NC_017051	GAA	2	6	515705	515710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489518
14005	NC_017051	ACAA	2	8	515721	515728	75 %	0 %	0 %	25 %	383489518
14006	NC_017051	AT	5	10	515799	515808	50 %	50 %	0 %	0 %	383489518
14007	NC_017051	T	6	6	515825	515830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_017051	A	8	8	515902	515909	100 %	0 %	0 %	0 %	383489519
14009	NC_017051	AAG	2	6	515926	515931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489519
14010	NC_017051	ATT	2	6	516034	516039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14011	NC_017051	GTGAT	2	10	516046	516055	20 %	40 %	40 %	0 %	383489519
14012	NC_017051	TGC	2	6	516134	516139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489519
14013	NC_017051	A	6	6	516143	516148	100 %	0 %	0 %	0 %	383489519
14014	NC_017051	AGC	2	6	516199	516204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489519
14015	NC_017051	AG	3	6	516237	516242	50 %	0 %	50 %	0 %	383489519
14016	NC_017051	TAT	2	6	516264	516269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14017	NC_017051	T	8	8	516285	516292	0 %	100 %	0 %	0 %	383489519
14018	NC_017051	ATA	2	6	516355	516360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489519
14019	NC_017051	ATT	2	6	516414	516419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14020	NC_017051	GAA	2	6	516468	516473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489519
14021	NC_017051	TTA	2	6	516474	516479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14022	NC_017051	GCA	2	6	516510	516515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489519
14023	NC_017051	AGG	2	6	516529	516534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489519
14024	NC_017051	TAC	2	6	516593	516598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489519
14025	NC_017051	ATC	2	6	516664	516669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489519
14026	NC_017051	ATA	2	6	516672	516677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489519
14027	NC_017051	AATT	2	8	516682	516689	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
14028	NC_017051	AAG	2	6	516740	516745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489519
14029	NC_017051	AAG	2	6	516769	516774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489519
14030	NC_017051	CATC	2	8	516797	516804	25 %	25 %	0 %	50 %	383489519
14031	NC_017051	AT	3	6	516817	516822	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
14032	NC_017051	TTA	3	9	516832	516840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14033	NC_017051	TAAT	2	8	516982	516989	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
14034	NC_017051	TAG	2	6	517013	517018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489519
14035	NC_017051	CAAAA	2	10	517024	517033	80 %	0 %	0 %	20 %	383489519
14036	NC_017051	TCCTAT	2	12	517130	517141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383489519
14037	NC_017051	GTA	2	6	517164	517169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489519
14038	NC_017051	TGA	2	6	517205	517210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489519
14039	NC_017051	CAT	2	6	517245	517250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489519
14040	NC_017051	ATA	2	6	517285	517290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489519
14041	NC_017051	T	6	6	517323	517328	0 %	100 %	0 %	0 %	383489519
14042	NC_017051	A	6	6	517386	517391	100 %	0 %	0 %	0 %	383489519
14043	NC_017051	TA	3	6	517422	517427	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
14044	NC_017051	TAT	2	6	517456	517461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14045	NC_017051	T	7	7	517469	517475	0 %	100 %	0 %	0 %	383489519
14046	NC_017051	GAAC	2	8	517487	517494	50 %	0 %	25 %	25 %	383489519
14047	NC_017051	TGC	2	6	517549	517554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489519
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14050	NC_017051	A	6	6	517607	517612	100 %	0 %	0 %	0 %	383489519
14051	NC_017051	T	6	6	517623	517628	0 %	100 %	0 %	0 %	383489519
14052	NC_017051	A	8	8	517686	517693	100 %	0 %	0 %	0 %	383489519
14053	NC_017051	TAT	2	6	517753	517758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
14054	NC_017051	TAA	2	6	517826	517831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489519
14055	NC_017051	TCTTT	2	10	517855	517864	0 %	80 %	0 %	20 %	383489519
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14057	NC_017051	TAA	2	6	517889	517894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489519
14058	NC_017051	GAT	2	6	517938	517943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489519
14059	NC_017051	TA	3	6	518000	518005	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
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14061	NC_017051	TA	3	6	518140	518145	50 %	50 %	0 %	0 %	383489519
14062	NC_017051	TGA	2	6	518165	518170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489519
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14064	NC_017051	TGAAG	2	10	518264	518273	40 %	20 %	40 %	0 %	383489519
14065	NC_017051	ATT	2	6	518334	518339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489519
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14069	NC_017051	ATG	2	6	518490	518495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_017051	ATG	2	6	518552	518557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_017051	TCAA	2	8	518581	518588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_017051	TAATT	2	10	518593	518602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_017051	TTAA	2	8	518640	518647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_017051	GGT	2	6	518672	518677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_017051	T	7	7	518689	518695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14081	NC_017051	ATTT	2	8	518914	518921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14088	NC_017051	TGC	2	6	519114	519119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489520
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14091	NC_017051	GAA	2	6	519256	519261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489520
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14093	NC_017051	AAATC	2	10	519319	519328	60 %	20 %	0 %	20 %	383489520
14094	NC_017051	ACCGTT	2	12	519429	519440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383489520
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14096	NC_017051	T	6	6	519606	519611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_017051	ATTA	2	8	519612	519619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14099	NC_017051	AGC	2	6	519740	519745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489521
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14103	NC_017051	TCA	2	6	519861	519866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489521
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14107	NC_017051	T	7	7	519982	519988	0 %	100 %	0 %	0 %	383489521
14108	NC_017051	TAT	2	6	520007	520012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489521
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14111	NC_017051	ATCT	2	8	520068	520075	25 %	50 %	0 %	25 %	383489522
14112	NC_017051	TAT	2	6	520096	520101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489522
14113	NC_017051	AAAT	3	12	520143	520154	75 %	25 %	0 %	0 %	383489522
14114	NC_017051	TTGA	2	8	520158	520165	25 %	50 %	25 %	0 %	383489522
14115	NC_017051	ATAA	2	8	520193	520200	75 %	25 %	0 %	0 %	383489522
14116	NC_017051	AT	3	6	520201	520206	50 %	50 %	0 %	0 %	383489522
14117	NC_017051	TTTG	2	8	520207	520214	0 %	75 %	25 %	0 %	383489522
14118	NC_017051	CTG	2	6	520275	520280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489522
14119	NC_017051	T	7	7	520311	520317	0 %	100 %	0 %	0 %	383489522
14120	NC_017051	GAGC	2	8	520332	520339	25 %	0 %	50 %	25 %	383489522
14121	NC_017051	GCC	2	6	520360	520365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489522
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14497	NC_017051	GGC	3	9	533937	533945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489537
14498	NC_017051	AAG	2	6	533977	533982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489537
14499	NC_017051	ATC	2	6	534038	534043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489537
14500	NC_017051	T	6	6	534053	534058	0 %	100 %	0 %	0 %	383489537

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