MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017051	ATC	2	6	480301	480306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489492
13002	NC_017051	AAT	2	6	480316	480321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489492
13003	NC_017051	ATCTT	2	10	480324	480333	20 %	60 %	0 %	20 %	383489492
13004	NC_017051	AT	3	6	480402	480407	50 %	50 %	0 %	0 %	383489492
13005	NC_017051	GTTT	2	8	480412	480419	0 %	75 %	25 %	0 %	383489492
13006	NC_017051	ATT	2	6	480452	480457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489492
13007	NC_017051	TAA	2	6	480483	480488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489492
13008	NC_017051	T	8	8	480497	480504	0 %	100 %	0 %	0 %	383489492
13009	NC_017051	AAT	2	6	480505	480510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489492
13010	NC_017051	TTAA	2	8	480531	480538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017051	TTA	2	6	480586	480591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017051	GTA	2	6	480601	480606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017051	TGT	2	6	480633	480638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017051	TAA	2	6	480647	480652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017051	T	6	6	480659	480664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_017051	TCTATT	2	12	480685	480696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13017	NC_017051	AAT	2	6	480712	480717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_017051	TTA	2	6	480762	480767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_017051	ATT	2	6	480785	480790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_017051	GATA	2	8	480805	480812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017051	T	7	7	480824	480830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_017051	TAT	2	6	480837	480842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_017051	GTTT	2	8	480854	480861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_017051	ATTT	2	8	480865	480872	25 %	75 %	0 %	0 %	383489493
13025	NC_017051	AAT	2	6	480936	480941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489493
13026	NC_017051	TTTA	2	8	480942	480949	25 %	75 %	0 %	0 %	383489493
13027	NC_017051	A	6	6	481034	481039	100 %	0 %	0 %	0 %	383489493
13028	NC_017051	ATA	2	6	481163	481168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489493
13029	NC_017051	TTA	2	6	481210	481215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
13030	NC_017051	CAA	2	6	481220	481225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489493
13031	NC_017051	CAT	2	6	481277	481282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489493
13032	NC_017051	ATA	2	6	481288	481293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489493
13033	NC_017051	TTA	2	6	481294	481299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
13034	NC_017051	TAT	2	6	481301	481306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
13035	NC_017051	AAT	2	6	481326	481331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489493
13036	NC_017051	CAT	2	6	481353	481358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489493
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13039	NC_017051	AAG	2	6	481487	481492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489493
13040	NC_017051	A	6	6	481617	481622	100 %	0 %	0 %	0 %	383489493
13041	NC_017051	CTT	2	6	481631	481636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489493
13042	NC_017051	AAAT	2	8	481680	481687	75 %	25 %	0 %	0 %	383489493
13043	NC_017051	ATT	2	6	481713	481718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
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13045	NC_017051	ATT	2	6	481749	481754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
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13048	NC_017051	TCT	2	6	481792	481797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489493
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13050	NC_017051	ATT	2	6	481843	481848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489493
13051	NC_017051	AAT	2	6	481873	481878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_017051	CAAT	2	8	481907	481914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13053	NC_017051	TAA	2	6	481919	481924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017051	AAT	2	6	481940	481945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_017051	TAA	2	6	481951	481956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_017051	AAT	2	6	481958	481963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017051	ATTTAG	2	12	481972	481983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017051	A	7	7	482012	482018	100 %	0 %	0 %	0 %	383489494
13059	NC_017051	T	6	6	482029	482034	0 %	100 %	0 %	0 %	383489494
13060	NC_017051	TA	3	6	482040	482045	50 %	50 %	0 %	0 %	383489494
13061	NC_017051	ATA	2	6	482079	482084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489494
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13063	NC_017051	TAA	2	6	482119	482124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489494
13064	NC_017051	ACT	2	6	482147	482152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489494
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13068	NC_017051	TTTA	2	8	482262	482269	25 %	75 %	0 %	0 %	383489494
13069	NC_017051	CTA	3	9	482379	482387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489494
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13071	NC_017051	ATT	2	6	482403	482408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489494
13072	NC_017051	TTA	2	6	482409	482414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489494
13073	NC_017051	TAC	2	6	482482	482487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489494
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13075	NC_017051	TG	3	6	482523	482528	0 %	50 %	50 %	0 %	383489494
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13079	NC_017051	ATG	2	6	482707	482712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13082	NC_017051	TAAATA	2	12	482764	482775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_017051	A	6	6	482784	482789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017051	TAA	2	6	482790	482795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_017051	ATT	2	6	482815	482820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13091	NC_017051	AAGCT	2	10	482905	482914	40 %	20 %	20 %	20 %	383489495
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13094	NC_017051	GAA	2	6	482988	482993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489495
13095	NC_017051	A	7	7	482992	482998	100 %	0 %	0 %	0 %	383489495
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13106	NC_017051	A	6	6	483689	483694	100 %	0 %	0 %	0 %	383489496
13107	NC_017051	AAG	2	6	483706	483711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489496
13108	NC_017051	ATT	2	6	483730	483735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489496
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13112	NC_017051	AT	3	6	483883	483888	50 %	50 %	0 %	0 %	383489496
13113	NC_017051	GTA	2	6	483911	483916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489496
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13120	NC_017051	ATA	2	6	484244	484249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489496
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