MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_017051	AGA	2	6	280366	280371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489333
7503	NC_017051	AAT	2	6	280393	280398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489333
7504	NC_017051	AT	3	6	280446	280451	50 %	50 %	0 %	0 %	383489333
7505	NC_017051	GAA	3	9	280481	280489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489333
7506	NC_017051	CTA	2	6	280500	280505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489333
7507	NC_017051	ATA	2	6	280572	280577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489333
7508	NC_017051	GAA	2	6	280601	280606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489333
7509	NC_017051	TAG	2	6	280680	280685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489333
7510	NC_017051	AT	3	6	280755	280760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_017051	GC	3	6	280775	280780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_017051	AAAT	2	8	280808	280815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_017051	TAAA	2	8	280838	280845	75 %	25 %	0 %	0 %	383489334
7514	NC_017051	AT	3	6	280853	280858	50 %	50 %	0 %	0 %	383489334
7515	NC_017051	TAT	2	6	280874	280879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489334
7516	NC_017051	CAT	2	6	280922	280927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489334
7517	NC_017051	ATT	2	6	280933	280938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489334
7518	NC_017051	TAC	2	6	280947	280952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489334
7519	NC_017051	T	7	7	280986	280992	0 %	100 %	0 %	0 %	383489334
7520	NC_017051	T	6	6	281008	281013	0 %	100 %	0 %	0 %	383489334
7521	NC_017051	A	7	7	281021	281027	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
7522	NC_017051	AT	3	6	281033	281038	50 %	50 %	0 %	0 %	383489334
7523	NC_017051	AGAT	2	8	281090	281097	50 %	25 %	25 %	0 %	383489334
7524	NC_017051	AG	3	6	281101	281106	50 %	0 %	50 %	0 %	383489334
7525	NC_017051	AATGAA	2	12	281110	281121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383489334
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7527	NC_017051	ACA	2	6	281256	281261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489334
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7531	NC_017051	AT	3	6	281482	281487	50 %	50 %	0 %	0 %	383489334
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7539	NC_017051	AG	3	6	281847	281852	50 %	0 %	50 %	0 %	383489334
7540	NC_017051	A	7	7	281856	281862	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
7541	NC_017051	AAAT	2	8	281907	281914	75 %	25 %	0 %	0 %	383489334
7542	NC_017051	CTTTAG	2	12	281927	281938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489334
7543	NC_017051	A	7	7	281942	281948	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
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7545	NC_017051	ATA	2	6	281962	281967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489334
7546	NC_017051	AAT	2	6	281968	281973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489334
7547	NC_017051	TTC	2	6	281997	282002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489334
7548	NC_017051	AAT	2	6	282037	282042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489334
7549	NC_017051	CAA	2	6	282056	282061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489334
7550	NC_017051	TGA	3	9	282102	282110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489334
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7553	NC_017051	GTT	2	6	282177	282182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489334
7554	NC_017051	A	8	8	282185	282192	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
7555	NC_017051	GAA	2	6	282193	282198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489334
7556	NC_017051	A	6	6	282215	282220	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
7557	NC_017051	AG	3	6	282231	282236	50 %	0 %	50 %	0 %	383489334
7558	NC_017051	TTA	2	6	282239	282244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489334
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7562	NC_017051	A	7	7	282332	282338	100 %	0 %	0 %	0 %	383489334
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7567	NC_017051	TGA	2	6	282498	282503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489334
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7569	NC_017051	CAA	2	6	282633	282638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7570	NC_017051	ATT	2	6	282649	282654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_017051	TA	3	6	282682	282687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_017051	AAT	2	6	282692	282697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_017051	TAGTT	2	10	282740	282749	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_017051	TAAT	2	8	282762	282769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_017051	AT	3	6	282779	282784	50 %	50 %	0 %	0 %	383489335
7576	NC_017051	AAAGA	2	10	282807	282816	80 %	0 %	20 %	0 %	383489335
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7612	NC_017051	A	6	6	284314	284319	100 %	0 %	0 %	0 %	383489335
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