MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 30124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017051	ATGTG	2	10	224839	224848	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017051	AAT	2	6	224903	224908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017051	TAA	2	6	224912	224917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017051	TTA	2	6	224936	224941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017051	TGA	2	6	224987	224992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017051	TAT	2	6	225005	225010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017051	AT	3	6	225046	225051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017051	GTA	2	6	225054	225059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017051	TAAT	2	8	225079	225086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017051	ATA	2	6	225110	225115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017051	A	7	7	225137	225143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017051	TAT	2	6	225154	225159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017051	TAAT	2	8	225172	225179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017051	ATG	2	6	225184	225189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017051	T	6	6	225206	225211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017051	T	6	6	225227	225232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017051	ATA	2	6	225235	225240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017051	ATT	2	6	225269	225274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017051	T	6	6	225298	225303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017051	TAA	2	6	225339	225344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017051	ATTA	2	8	225383	225390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017051	TTTC	2	8	225395	225402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_017051	TTA	2	6	225422	225427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017051	A	6	6	225432	225437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017051	ATA	2	6	225450	225455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017051	T	6	6	225462	225467	0 %	100 %	0 %	0 %	383489297
6027	NC_017051	TAA	2	6	225473	225478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489297
6028	NC_017051	CAG	2	6	225495	225500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489297
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6030	NC_017051	AAAGCA	2	12	225631	225642	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383489297
6031	NC_017051	CTG	2	6	225649	225654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489297
6032	NC_017051	AAC	2	6	225672	225677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489297
6033	NC_017051	CTA	2	6	225686	225691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489297
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6035	NC_017051	TTAG	2	8	225733	225740	25 %	50 %	25 %	0 %	383489297
6036	NC_017051	AATT	2	8	225746	225753	50 %	50 %	0 %	0 %	383489297
6037	NC_017051	A	6	6	225767	225772	100 %	0 %	0 %	0 %	383489297
6038	NC_017051	CAT	2	6	225803	225808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489297
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6042	NC_017051	GTA	2	6	225896	225901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489297
6043	NC_017051	AGTTA	2	10	225929	225938	40 %	40 %	20 %	0 %	383489297
6044	NC_017051	ATTTT	2	10	225943	225952	20 %	80 %	0 %	0 %	383489298
6045	NC_017051	ATT	2	6	225967	225972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489298
6046	NC_017051	AGC	2	6	225982	225987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489298
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6048	NC_017051	TCT	2	6	226082	226087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489298
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6050	NC_017051	T	7	7	226144	226150	0 %	100 %	0 %	0 %	383489298
6051	NC_017051	AATT	2	8	226161	226168	50 %	50 %	0 %	0 %	383489298
6052	NC_017051	TA	3	6	226229	226234	50 %	50 %	0 %	0 %	383489298
6053	NC_017051	T	6	6	226289	226294	0 %	100 %	0 %	0 %	383489298
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6056	NC_017051	TAA	2	6	226384	226389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489298
6057	NC_017051	AAG	2	6	226401	226406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489298
6058	NC_017051	ACTT	2	8	226412	226419	25 %	50 %	0 %	25 %	383489298
6059	NC_017051	T	6	6	226478	226483	0 %	100 %	0 %	0 %	383489298
6060	NC_017051	ATG	2	6	226488	226493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489298
6061	NC_017051	AGT	2	6	226532	226537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489298
6062	NC_017051	GTA	2	6	226554	226559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489298
6063	NC_017051	AT	3	6	226568	226573	50 %	50 %	0 %	0 %	383489298
6064	NC_017051	A	7	7	226579	226585	100 %	0 %	0 %	0 %	383489298
6065	NC_017051	A	7	7	226621	226627	100 %	0 %	0 %	0 %	383489298
6066	NC_017051	ATT	2	6	226649	226654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489298
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6069	NC_017051	TA	4	8	226683	226690	50 %	50 %	0 %	0 %	383489298
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6077	NC_017051	AGTA	2	8	226943	226950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6102	NC_017051	ATT	2	6	227849	227854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017051	ATA	2	6	227877	227882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017051	TAA	3	9	227912	227920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_017051	ATA	2	6	227977	227982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017051	ATTA	2	8	228117	228124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017051	ATAAA	2	10	228132	228141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017051	ATTT	2	8	228179	228186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017051	CTT	2	6	228235	228240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017051	CATG	2	8	228264	228271	25 %	25 %	25 %	25 %	383489300
6113	NC_017051	TGG	2	6	228337	228342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489300
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6125	NC_017051	T	6	6	228703	228708	0 %	100 %	0 %	0 %	383489300
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6127	NC_017051	TTTA	2	8	228779	228786	25 %	75 %	0 %	0 %	383489300
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