MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017050	TTA	2	6	551367	551372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488708
15003	NC_017050	ATAA	2	8	551383	551390	75 %	25 %	0 %	0 %	383488708
15004	NC_017050	CAT	2	6	551392	551397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488708
15005	NC_017050	TAA	2	6	551423	551428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488708
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15008	NC_017050	TAT	2	6	551564	551569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488708
15009	NC_017050	TAG	2	6	551595	551600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488708
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15011	NC_017050	CTT	2	6	551638	551643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488708
15012	NC_017050	TA	3	6	551658	551663	50 %	50 %	0 %	0 %	383488708
15013	NC_017050	TAA	2	6	551676	551681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488708
15014	NC_017050	GCT	2	6	551685	551690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488708
15015	NC_017050	TAAA	2	8	551720	551727	75 %	25 %	0 %	0 %	383488708
15016	NC_017050	AAT	2	6	551745	551750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488708
15017	NC_017050	CTA	2	6	551787	551792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488708
15018	NC_017050	TTTTAA	2	12	551828	551839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488708
15019	NC_017050	ATT	2	6	551843	551848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488708
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15021	NC_017050	A	8	8	551900	551907	100 %	0 %	0 %	0 %	383488708
15022	NC_017050	TA	3	6	551963	551968	50 %	50 %	0 %	0 %	383488708
15023	NC_017050	TAT	2	6	551980	551985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488708
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15026	NC_017050	TAAT	2	8	552034	552041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_017050	TATAT	2	10	552069	552078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_017050	TA	3	6	552099	552104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_017050	TGA	2	6	552126	552131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488709
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15034	NC_017050	CT	3	6	552230	552235	0 %	50 %	0 %	50 %	383488709
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15039	NC_017050	A	6	6	552290	552295	100 %	0 %	0 %	0 %	383488709
15040	NC_017050	GAA	2	6	552440	552445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488709
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15042	NC_017050	GAA	2	6	552479	552484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488709
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15044	NC_017050	AATG	2	8	552550	552557	50 %	25 %	25 %	0 %	383488709
15045	NC_017050	ATT	2	6	552578	552583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488709
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15052	NC_017050	GCAT	2	8	552766	552773	25 %	25 %	25 %	25 %	383488709
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15055	NC_017050	ATT	3	9	552816	552824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488709
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15058	NC_017050	AAG	2	6	552921	552926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488709
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15062	NC_017050	TAT	2	6	553126	553131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488709
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15089	NC_017050	ACC	2	6	554368	554373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383488709
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15093	NC_017050	GTT	2	6	554537	554542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_017050	ATG	2	6	554596	554601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15096	NC_017050	ATA	2	6	554670	554675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_017050	TATC	2	8	554701	554708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15101	NC_017050	T	6	6	554808	554813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_017050	TTAA	3	12	554863	554874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_017050	A	6	6	554900	554905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_017050	ATT	2	6	554916	554921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_017050	AAT	2	6	554929	554934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_017050	CATTAA	2	12	554939	554950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15107	NC_017050	TTA	2	6	554953	554958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_017050	AT	3	6	554966	554971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_017050	T	7	7	554977	554983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017050	TTAA	2	8	554987	554994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017050	TAT	2	6	554997	555002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_017050	ATTAAT	2	12	555004	555015	50 %	50 %	0 %	0 %	383488710
15113	NC_017050	A	6	6	555017	555022	100 %	0 %	0 %	0 %	383488710
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15499	NC_017050	TTA	2	6	569688	569693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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