MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017049	AAT	2	6	534365	534370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_017049	CAA	2	6	534371	534376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_017049	TAA	2	6	534395	534400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_017049	ATT	2	6	534435	534440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_017049	TAAT	3	12	534442	534453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_017049	TAT	2	6	534526	534531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_017049	AAT	2	6	534551	534556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_017049	TAT	2	6	534570	534575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_017049	AGTT	2	8	534580	534587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_017049	TAA	2	6	534609	534614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_017049	TAT	2	6	534626	534631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_017049	TA	3	6	534691	534696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_017049	TTG	2	6	534697	534702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_017049	TAA	2	6	534707	534712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_017049	AT	4	8	534724	534731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_017049	TAAT	2	8	534751	534758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_017049	T	7	7	534770	534776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_017049	TCA	2	6	534813	534818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14521	NC_017049	TATAT	2	10	534853	534862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_017049	TTA	2	6	534913	534918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_017049	TGT	2	6	534936	534941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_017049	TTA	2	6	534958	534963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_017049	TAATT	2	10	535002	535011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_017049	ATT	2	6	535017	535022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_017049	ATT	2	6	535055	535060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_017049	GAT	2	6	535064	535069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14530	NC_017049	CTT	2	6	535091	535096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_017049	T	6	6	535095	535100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_017049	ATT	2	6	535149	535154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_017049	TATT	3	12	535151	535162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14538	NC_017049	AAT	2	6	535290	535295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_017049	AT	4	8	535328	535335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_017049	AAT	2	6	535345	535350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_017049	A	6	6	535389	535394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_017049	TAA	2	6	535410	535415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_017049	TAA	2	6	535460	535465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_017049	TAT	2	6	535468	535473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487852
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14549	NC_017049	TAG	2	6	535550	535555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487852
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14556	NC_017049	CTA	2	6	535811	535816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487852
14557	NC_017049	TTCT	2	8	535826	535833	0 %	75 %	0 %	25 %	383487852
14558	NC_017049	TA	3	6	535913	535918	50 %	50 %	0 %	0 %	383487852
14559	NC_017049	AAG	2	6	535947	535952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487852
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14561	NC_017049	TAA	2	6	535992	535997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487852
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14563	NC_017049	GTA	2	6	536093	536098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487852
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14567	NC_017049	TCT	2	6	536173	536178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487852
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14571	NC_017049	ATA	2	6	536236	536241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487852
14572	NC_017049	T	6	6	536250	536255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_017049	AT	3	6	536257	536262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_017049	TAA	3	9	536274	536282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14605	NC_017049	CATC	2	8	537437	537444	25 %	25 %	0 %	50 %	383487853
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14609	NC_017049	GTAGT	2	10	537585	537594	20 %	40 %	40 %	0 %	383487853
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14622	NC_017049	T	7	7	538012	538018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_017049	ATT	2	6	538020	538025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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