MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017049	ACAA	2	8	515711	515718	75 %	0 %	0 %	25 %	383487832
14003	NC_017049	AT	5	10	515789	515798	50 %	50 %	0 %	0 %	383487832
14004	NC_017049	T	6	6	515815	515820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_017049	A	8	8	515892	515899	100 %	0 %	0 %	0 %	383487833
14006	NC_017049	AAG	2	6	515916	515921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487833
14007	NC_017049	ATT	2	6	516024	516029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
14008	NC_017049	GTGAT	2	10	516036	516045	20 %	40 %	40 %	0 %	383487833
14009	NC_017049	TGC	2	6	516124	516129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487833
14010	NC_017049	A	6	6	516133	516138	100 %	0 %	0 %	0 %	383487833
14011	NC_017049	AGC	2	6	516189	516194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487833
14012	NC_017049	AG	3	6	516227	516232	50 %	0 %	50 %	0 %	383487833
14013	NC_017049	TAT	2	6	516254	516259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
14014	NC_017049	T	8	8	516275	516282	0 %	100 %	0 %	0 %	383487833
14015	NC_017049	ATA	2	6	516345	516350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487833
14016	NC_017049	ATT	2	6	516404	516409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
14017	NC_017049	GAA	2	6	516458	516463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487833
14018	NC_017049	TTA	2	6	516464	516469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
14019	NC_017049	GCA	2	6	516500	516505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487833
14020	NC_017049	AGG	2	6	516519	516524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487833
14021	NC_017049	TAC	2	6	516583	516588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487833
14022	NC_017049	ATC	2	6	516654	516659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487833
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14025	NC_017049	AAG	2	6	516730	516735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487833
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14028	NC_017049	AT	3	6	516807	516812	50 %	50 %	0 %	0 %	383487833
14029	NC_017049	TTA	3	9	516822	516830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
14030	NC_017049	TAAT	2	8	516972	516979	50 %	50 %	0 %	0 %	383487833
14031	NC_017049	TAG	2	6	517003	517008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487833
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14033	NC_017049	TCCTAT	2	12	517120	517131	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383487833
14034	NC_017049	GTA	2	6	517154	517159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487833
14035	NC_017049	TGA	2	6	517195	517200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487833
14036	NC_017049	CAT	2	6	517235	517240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487833
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14040	NC_017049	TA	3	6	517412	517417	50 %	50 %	0 %	0 %	383487833
14041	NC_017049	TAT	2	6	517446	517451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
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14043	NC_017049	GAAC	2	8	517477	517484	50 %	0 %	25 %	25 %	383487833
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14050	NC_017049	TAT	2	6	517743	517748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
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14055	NC_017049	GAT	2	6	517928	517933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487833
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14057	NC_017049	AGA	2	6	518092	518097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487833
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14059	NC_017049	TGA	2	6	518155	518160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487833
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14061	NC_017049	TGAAG	2	10	518254	518263	40 %	20 %	40 %	0 %	383487833
14062	NC_017049	ATT	2	6	518324	518329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487833
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14094	NC_017049	ATTA	2	8	519602	519609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_017049	AAC	2	6	519652	519657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14105	NC_017049	TAT	2	6	519997	520002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487835
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14109	NC_017049	TAT	2	6	520086	520091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487836
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14111	NC_017049	TTGA	2	8	520148	520155	25 %	50 %	25 %	0 %	383487836
14112	NC_017049	ATAA	2	8	520183	520190	75 %	25 %	0 %	0 %	383487836
14113	NC_017049	AT	3	6	520191	520196	50 %	50 %	0 %	0 %	383487836
14114	NC_017049	TTTG	2	8	520197	520204	0 %	75 %	25 %	0 %	383487836
14115	NC_017049	CTG	2	6	520265	520270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487836
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14117	NC_017049	GAGC	2	8	520322	520329	25 %	0 %	50 %	25 %	383487836
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14123	NC_017049	TAAT	2	8	520489	520496	50 %	50 %	0 %	0 %	383487836
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14499	NC_017049	TAC	2	6	534186	534191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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