MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017049	ACA	2	6	18408	18413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487448
502	NC_017049	AGATA	2	10	18462	18471	60 %	20 %	20 %	0 %	383487448
503	NC_017049	ATT	2	6	18473	18478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487448
504	NC_017049	TCAAA	2	10	18492	18501	60 %	20 %	0 %	20 %	383487448
505	NC_017049	CAT	2	6	18514	18519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487448
506	NC_017049	AATTAT	2	12	18550	18561	50 %	50 %	0 %	0 %	383487448
507	NC_017049	TAT	3	9	18576	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487448
508	NC_017049	TA	3	6	18629	18634	50 %	50 %	0 %	0 %	383487448
509	NC_017049	AAT	2	6	18682	18687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487448
510	NC_017049	AT	3	6	18686	18691	50 %	50 %	0 %	0 %	383487448
511	NC_017049	TAA	2	6	18747	18752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487448
512	NC_017049	TTA	2	6	18821	18826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487448
513	NC_017049	ATA	2	6	18836	18841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487448
514	NC_017049	TAT	2	6	18903	18908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487448
515	NC_017049	AAT	2	6	18919	18924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487448
516	NC_017049	ATT	2	6	18947	18952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487448
517	NC_017049	TAAA	2	8	18956	18963	75 %	25 %	0 %	0 %	383487448
518	NC_017049	TCA	2	6	18975	18980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487448
519	NC_017049	ATA	2	6	19096	19101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017049	ACC	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017049	ATA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017049	TAA	2	6	19256	19261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017049	AAG	2	6	19278	19283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017049	TTA	2	6	19320	19325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017049	ATTTA	2	10	19330	19339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017049	CTT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017049	TATT	2	8	19400	19407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017049	ATCTAA	2	12	19409	19420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_017049	ATT	2	6	19421	19426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017049	TAG	2	6	19457	19462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017049	AGTTT	2	10	19528	19537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017049	A	6	6	19560	19565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017049	GTAA	2	8	19574	19581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017049	AAT	2	6	19586	19591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017049	TTAT	2	8	19652	19659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017049	TCAA	2	8	19684	19691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017049	AT	3	6	19693	19698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017049	CAT	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017049	TATAA	2	10	19761	19770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017049	GTAA	2	8	19853	19860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017049	TA	3	6	19880	19885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017049	AT	3	6	19893	19898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017049	TAG	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017049	GTA	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017049	TAA	2	6	20043	20048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017049	ATAG	2	8	20088	20095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017049	AAT	2	6	20120	20125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017049	A	8	8	20133	20140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017049	A	8	8	20156	20163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017049	ATTA	2	8	20192	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017049	GAA	2	6	20220	20225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017049	TAA	2	6	20238	20243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017049	A	9	9	20249	20257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017049	TAG	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017049	AGT	2	6	20351	20356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017049	TAT	2	6	20412	20417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017049	A	6	6	20428	20433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017049	AAT	2	6	20439	20444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017049	TA	3	6	20449	20454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017049	AT	3	6	20545	20550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017049	AATCT	2	10	20571	20580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_017049	ATT	2	6	20598	20603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017049	AAG	2	6	20657	20662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017049	GTT	2	6	20687	20692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017049	AAT	2	6	20724	20729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017049	ATCA	2	8	20754	20761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017049	ATA	2	6	20784	20789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017049	TA	3	6	20870	20875	50 %	50 %	0 %	0 %	383487449
569	NC_017049	TCT	2	6	20917	20922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487449
570	NC_017049	TAAAA	2	10	20932	20941	80 %	20 %	0 %	0 %	383487449
571	NC_017049	ATC	2	6	20947	20952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487449
572	NC_017049	A	6	6	21031	21036	100 %	0 %	0 %	0 %	383487449
573	NC_017049	T	6	6	21043	21048	0 %	100 %	0 %	0 %	383487449
574	NC_017049	A	8	8	21050	21057	100 %	0 %	0 %	0 %	383487449
575	NC_017049	A	6	6	21094	21099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017049	TGA	2	6	21106	21111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017049	AACA	2	8	21115	21122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017049	GTAT	2	8	21154	21161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017049	T	6	6	21267	21272	0 %	100 %	0 %	0 %	383487450
580	NC_017049	TCA	2	6	21320	21325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487450
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582	NC_017049	T	6	6	21394	21399	0 %	100 %	0 %	0 %	383487450
583	NC_017049	TTC	2	6	21412	21417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487450
584	NC_017049	TTTGT	2	10	21444	21453	0 %	80 %	20 %	0 %	383487450
585	NC_017049	TCT	2	6	21467	21472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487450
586	NC_017049	TTTGTA	2	12	21501	21512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383487450
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589	NC_017049	T	6	6	21553	21558	0 %	100 %	0 %	0 %	383487450
590	NC_017049	T	7	7	21619	21625	0 %	100 %	0 %	0 %	383487450
591	NC_017049	TAAAT	2	10	21635	21644	60 %	40 %	0 %	0 %	383487450
592	NC_017049	ATT	2	6	21698	21703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487450
593	NC_017049	T	7	7	21715	21721	0 %	100 %	0 %	0 %	383487451
594	NC_017049	GTA	2	6	21722	21727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487451
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596	NC_017049	AAT	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487451
597	NC_017049	ATC	2	6	21784	21789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487451
598	NC_017049	TTA	2	6	21799	21804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487451
599	NC_017049	TGAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	25 %	0 %	383487451
600	NC_017049	T	8	8	21883	21890	0 %	100 %	0 %	0 %	383487451
601	NC_017049	T	6	6	21920	21925	0 %	100 %	0 %	0 %	383487451
602	NC_017049	T	7	7	21927	21933	0 %	100 %	0 %	0 %	383487451
603	NC_017049	TTTGT	2	10	21952	21961	0 %	80 %	20 %	0 %	383487451
604	NC_017049	TCT	2	6	22000	22005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487451
605	NC_017049	AGC	2	6	22011	22016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487451
606	NC_017049	TAT	2	6	22052	22057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487451
607	NC_017049	TTC	2	6	22065	22070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487451
608	NC_017049	A	6	6	22133	22138	100 %	0 %	0 %	0 %	383487451
609	NC_017049	AAT	2	6	22145	22150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487451
610	NC_017049	TATCAA	2	12	22154	22165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383487451
611	NC_017049	A	6	6	22193	22198	100 %	0 %	0 %	0 %	383487452
612	NC_017049	A	6	6	22223	22228	100 %	0 %	0 %	0 %	383487452
613	NC_017049	AG	3	6	22318	22323	50 %	0 %	50 %	0 %	383487452
614	NC_017049	TAAT	2	8	22427	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017049	CAT	2	6	22463	22468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487453
616	NC_017049	ATAC	2	8	22473	22480	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
617	NC_017049	CAT	2	6	22632	22637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487453
618	NC_017049	GCA	2	6	22642	22647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487453
619	NC_017049	AACT	2	8	22661	22668	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
620	NC_017049	A	7	7	22741	22747	100 %	0 %	0 %	0 %	383487453
621	NC_017049	A	6	6	22753	22758	100 %	0 %	0 %	0 %	383487453
622	NC_017049	TAG	2	6	22841	22846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487453
623	NC_017049	AATAA	2	10	22885	22894	80 %	20 %	0 %	0 %	383487453
624	NC_017049	AAAT	2	8	22895	22902	75 %	25 %	0 %	0 %	383487453
625	NC_017049	CACT	2	8	22991	22998	25 %	25 %	0 %	50 %	383487453
626	NC_017049	AAGT	2	8	23044	23051	50 %	25 %	25 %	0 %	383487453
627	NC_017049	GTA	2	6	23062	23067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487453
628	NC_017049	T	6	6	23136	23141	0 %	100 %	0 %	0 %	383487453
629	NC_017049	TAT	2	6	23218	23223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487454
630	NC_017049	ATA	2	6	23231	23236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487454
631	NC_017049	T	6	6	23340	23345	0 %	100 %	0 %	0 %	383487454
632	NC_017049	TTAGAA	2	12	23354	23365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383487454
633	NC_017049	ATTA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	383487454
634	NC_017049	TTA	3	9	23473	23481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487455
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