MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017049	TTA	2	6	224932	224937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017049	TGA	2	6	224983	224988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017049	TAT	2	6	225001	225006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017049	AT	3	6	225042	225047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017049	GTA	2	6	225050	225055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017049	TAAT	2	8	225075	225082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017049	ATA	2	6	225106	225111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017049	A	7	7	225133	225139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017049	TAT	2	6	225150	225155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017049	TAAT	2	8	225168	225175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017049	ATG	2	6	225180	225185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017049	T	6	6	225202	225207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017049	T	6	6	225223	225228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017049	ATA	2	6	225231	225236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017049	ATT	2	6	225265	225270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017049	T	6	6	225294	225299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017049	TAA	2	6	225335	225340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017049	ATTA	2	8	225379	225386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017049	TTTC	2	8	225391	225398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_017049	TTA	2	6	225418	225423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017049	A	6	6	225428	225433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017049	ATA	2	6	225446	225451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017049	T	6	6	225458	225463	0 %	100 %	0 %	0 %	383487608
6025	NC_017049	TAA	2	6	225469	225474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487608
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6028	NC_017049	AAAGCA	2	12	225627	225638	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383487608
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6031	NC_017049	CTA	2	6	225682	225687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487608
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6033	NC_017049	TTAG	2	8	225729	225736	25 %	50 %	25 %	0 %	383487608
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6036	NC_017049	CAT	2	6	225799	225804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487608
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6042	NC_017049	ATTTT	2	10	225939	225948	20 %	80 %	0 %	0 %	383487609
6043	NC_017049	ATT	2	6	225963	225968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487609
6044	NC_017049	AGC	2	6	225978	225983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487609
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6050	NC_017049	TA	3	6	226225	226230	50 %	50 %	0 %	0 %	383487609
6051	NC_017049	T	6	6	226285	226290	0 %	100 %	0 %	0 %	383487609
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6057	NC_017049	T	6	6	226474	226479	0 %	100 %	0 %	0 %	383487609
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6060	NC_017049	GTA	2	6	226550	226555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487609
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6062	NC_017049	A	7	7	226575	226581	100 %	0 %	0 %	0 %	383487609
6063	NC_017049	A	7	7	226617	226623	100 %	0 %	0 %	0 %	383487609
6064	NC_017049	ATT	2	6	226645	226650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487609
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6067	NC_017049	TA	4	8	226679	226686	50 %	50 %	0 %	0 %	383487609
6068	NC_017049	A	6	6	226701	226706	100 %	0 %	0 %	0 %	383487609
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6075	NC_017049	AGTA	2	8	226939	226946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6090	NC_017049	CAT	2	6	227507	227512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487610
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6094	NC_017049	GATT	2	8	227673	227680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017049	ATT	2	6	227682	227687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_017049	TAA	2	6	227776	227781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017049	CAA	2	6	227825	227830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017049	ATT	2	6	227845	227850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017049	ATA	2	6	227873	227878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017049	TAA	3	9	227908	227916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017049	TGC	2	6	227948	227953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6106	NC_017049	ATTA	2	8	228113	228120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017049	ATAAA	2	10	228128	228137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017049	ATTT	2	8	228175	228182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017049	CTT	2	6	228231	228236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_017049	CATG	2	8	228260	228267	25 %	25 %	25 %	25 %	383487611
6111	NC_017049	TGG	2	6	228333	228338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487611
6112	NC_017049	AGGA	2	8	228352	228359	50 %	0 %	50 %	0 %	383487611
6113	NC_017049	TAG	2	6	228361	228366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487611
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6115	NC_017049	T	6	6	228441	228446	0 %	100 %	0 %	0 %	383487611
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6117	NC_017049	CTT	2	6	228460	228465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487611
6118	NC_017049	T	6	6	228464	228469	0 %	100 %	0 %	0 %	383487611
6119	NC_017049	GGTA	2	8	228488	228495	25 %	25 %	50 %	0 %	383487611
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6123	NC_017049	T	6	6	228699	228704	0 %	100 %	0 %	0 %	383487611
6124	NC_017049	TA	3	6	228758	228763	50 %	50 %	0 %	0 %	383487611
6125	NC_017049	TTTA	2	8	228775	228782	25 %	75 %	0 %	0 %	383487611
6126	NC_017049	TAC	2	6	228866	228871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487611
6127	NC_017049	TTATTT	2	12	228939	228950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383487611
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