MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017049	TAA	2	6	168460	168465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487564
4503	NC_017049	TAG	2	6	168466	168471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4504	NC_017049	GGT	2	6	168519	168524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487564
4505	NC_017049	ACA	2	6	168533	168538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487564
4506	NC_017049	CTA	2	6	168559	168564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487564
4507	NC_017049	GTG	2	6	168631	168636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487564
4508	NC_017049	ACC	2	6	168672	168677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383487564
4509	NC_017049	AAG	2	6	168682	168687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487564
4510	NC_017049	ATA	2	6	168727	168732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487564
4511	NC_017049	ATT	2	6	168749	168754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487564
4512	NC_017049	A	6	6	168762	168767	100 %	0 %	0 %	0 %	383487564
4513	NC_017049	T	6	6	168786	168791	0 %	100 %	0 %	0 %	383487564
4514	NC_017049	CGC	2	6	168829	168834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383487564
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4516	NC_017049	GTA	2	6	168997	169002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4517	NC_017049	GAT	2	6	169005	169010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4518	NC_017049	GGT	2	6	169053	169058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487564
4519	NC_017049	GCA	2	6	169116	169121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487564
4520	NC_017049	CTG	2	6	169258	169263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487564
4521	NC_017049	TAA	2	6	169418	169423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487564
4522	NC_017049	TGA	2	6	169424	169429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4523	NC_017049	TAA	2	6	169444	169449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487564
4524	NC_017049	ATG	2	6	169495	169500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4525	NC_017049	ATG	2	6	169504	169509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487564
4526	NC_017049	GCT	2	6	169563	169568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487564
4527	NC_017049	CTG	2	6	169579	169584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487564
4528	NC_017049	TTA	2	6	169591	169596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487564
4529	NC_017049	TTA	2	6	169603	169608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487564
4530	NC_017049	TAA	2	6	169658	169663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487564
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4533	NC_017049	TAA	2	6	169774	169779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017049	ATA	2	6	169840	169845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487565
4535	NC_017049	TA	3	6	169855	169860	50 %	50 %	0 %	0 %	383487565
4536	NC_017049	ATT	2	6	169940	169945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487565
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4542	NC_017049	TA	3	6	170137	170142	50 %	50 %	0 %	0 %	383487565
4543	NC_017049	TGAT	2	8	170144	170151	25 %	50 %	25 %	0 %	383487565
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4551	NC_017049	AT	3	6	170482	170487	50 %	50 %	0 %	0 %	383487565
4552	NC_017049	T	7	7	170600	170606	0 %	100 %	0 %	0 %	383487565
4553	NC_017049	TTCAT	2	10	170635	170644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_017049	TA	4	8	170674	170681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4560	NC_017049	A	6	6	170838	170843	100 %	0 %	0 %	0 %	383487566
4561	NC_017049	GAAT	2	8	170896	170903	50 %	25 %	25 %	0 %	383487566
4562	NC_017049	GTA	2	6	170911	170916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487566
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4593	NC_017049	A	6	6	172434	172439	100 %	0 %	0 %	0 %	383487567
4594	NC_017049	TG	3	6	172456	172461	0 %	50 %	50 %	0 %	383487567
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4605	NC_017049	TCT	2	6	173013	173018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487567
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4607	NC_017049	TA	3	6	173058	173063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017049	ACAA	2	8	173120	173127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_017049	TA	3	6	173134	173139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017049	AAGAT	2	10	173209	173218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017049	AATA	2	8	173246	173253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017049	AAT	2	6	173274	173279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017049	TTG	2	6	173287	173292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017049	TTTG	2	8	173354	173361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017049	CTT	2	6	173367	173372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017049	TAT	2	6	173430	173435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017049	TTTA	2	8	173440	173447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017049	T	7	7	173463	173469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017049	AT	3	6	173529	173534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017049	TGT	2	6	173580	173585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017049	T	6	6	173658	173663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017049	ATTAT	2	10	173673	173682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017049	CTT	2	6	173698	173703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_017049	GTT	2	6	173721	173726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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