MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 30224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017048	GTAA	2	8	596680	596687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_017048	GTT	2	6	596697	596702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_017048	ATA	3	9	596720	596728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_017048	GGT	2	6	596732	596737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017048	ATT	2	6	596741	596746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_017048	TGCT	2	8	596751	596758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_017048	AT	3	6	596774	596779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_017048	T	6	6	596803	596808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017048	ATG	2	6	596814	596819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017048	T	7	7	596820	596826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_017048	GATA	2	8	596833	596840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_017048	TA	3	6	596844	596849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017048	TAA	2	6	596908	596913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_017048	ATT	2	6	596925	596930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017048	ATG	2	6	596991	596996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_017048	ATA	2	6	596997	597002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_017048	ATT	2	6	597029	597034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_017048	AT	3	6	597055	597060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017048	TAT	3	9	597058	597066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_017048	T	7	7	597066	597072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_017048	AGA	2	6	597075	597080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_017048	ATTA	2	8	597102	597109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017048	AGA	2	6	597151	597156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_017048	ATG	2	6	597176	597181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487052
16025	NC_017048	TTA	2	6	597185	597190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487052
16026	NC_017048	TTA	2	6	597219	597224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487052
16027	NC_017048	AGG	2	6	597247	597252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487052
16028	NC_017048	T	6	6	597299	597304	0 %	100 %	0 %	0 %	383487052
16029	NC_017048	ATTT	2	8	597329	597336	25 %	75 %	0 %	0 %	383487052
16030	NC_017048	T	6	6	597349	597354	0 %	100 %	0 %	0 %	383487052
16031	NC_017048	ATTTT	2	10	597394	597403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_017048	T	6	6	597400	597405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_017048	ACT	2	6	597502	597507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_017048	ATTT	2	8	597510	597517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_017048	ATC	2	6	597520	597525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_017048	T	6	6	597537	597542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_017048	T	6	6	597557	597562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_017048	TCA	2	6	597605	597610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_017048	AT	3	6	597689	597694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_017048	AT	3	6	597718	597723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_017048	AAAT	2	8	597756	597763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017048	TTA	2	6	597782	597787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017048	CTTT	2	8	597818	597825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16044	NC_017048	TAT	2	6	597844	597849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017048	TATG	2	8	597872	597879	25 %	50 %	25 %	0 %	383487053
16046	NC_017048	TGA	2	6	597906	597911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487053
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16048	NC_017048	AGATA	2	10	598223	598232	60 %	20 %	20 %	0 %	383487053
16049	NC_017048	ATT	2	6	598334	598339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487053
16050	NC_017048	GTA	2	6	598360	598365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487053
16051	NC_017048	ATA	2	6	598391	598396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487053
16052	NC_017048	A	6	6	598449	598454	100 %	0 %	0 %	0 %	383487054
16053	NC_017048	TCA	2	6	598463	598468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487054
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16055	NC_017048	A	6	6	598692	598697	100 %	0 %	0 %	0 %	383487054
16056	NC_017048	ATCC	3	12	598713	598724	25 %	25 %	0 %	50 %	383487054
16057	NC_017048	GAG	2	6	598741	598746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487054
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16060	NC_017048	AGT	2	6	598788	598793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487054
16061	NC_017048	GTAT	2	8	598794	598801	25 %	50 %	25 %	0 %	383487054
16062	NC_017048	AT	3	6	598834	598839	50 %	50 %	0 %	0 %	383487054
16063	NC_017048	AGA	2	6	598847	598852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487054
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16065	NC_017048	ATA	2	6	598948	598953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487054
16066	NC_017048	AATT	2	8	599021	599028	50 %	50 %	0 %	0 %	383487054
16067	NC_017048	ATTG	2	8	599049	599056	25 %	50 %	25 %	0 %	383487054
16068	NC_017048	AAT	2	6	599111	599116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487054
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16073	NC_017048	AGA	2	6	599261	599266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487054
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16075	NC_017048	A	6	6	599387	599392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16078	NC_017048	T	6	6	599446	599451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_017048	TAG	2	6	599485	599490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_017048	GTT	2	6	599495	599500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_017048	TA	3	6	599546	599551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_017048	ATG	2	6	599555	599560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_017048	AAT	2	6	599598	599603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_017048	TAA	2	6	599658	599663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_017048	AAG	2	6	599704	599709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_017048	TAC	2	6	599797	599802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_017048	TAAAAT	2	12	599811	599822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_017048	TCA	2	6	599870	599875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_017048	CA	3	6	599874	599879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16090	NC_017048	ATA	3	9	599946	599954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_017048	AAT	2	6	599975	599980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_017048	AATT	2	8	599986	599993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_017048	TAA	2	6	600039	600044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_017048	TGG	2	6	600052	600057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_017048	TAT	2	6	600175	600180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_017048	TA	3	6	600197	600202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_017048	GGA	2	6	600238	600243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_017048	TAG	2	6	600267	600272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_017048	A	7	7	600306	600312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_017048	ACC	2	6	600427	600432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_017048	CT	3	6	600448	600453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_017048	AGCA	2	8	600553	600560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16103	NC_017048	TTAG	2	8	600676	600683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_017048	ACT	2	6	600762	600767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_017048	TCAA	2	8	600927	600934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16106	NC_017048	CAGA	2	8	600963	600970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16107	NC_017048	AGA	2	6	601060	601065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_017048	AAC	2	6	601070	601075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_017048	AGC	2	6	601093	601098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_017048	CAT	2	6	601099	601104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_017048	AAAG	2	8	601107	601114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_017048	CAA	2	6	601152	601157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_017048	GATT	2	8	601475	601482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_017048	TAT	2	6	601516	601521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_017048	GA	3	6	601575	601580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_017048	GAA	2	6	601622	601627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_017048	TTA	2	6	601687	601692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_017048	GAC	2	6	601720	601725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_017048	AGG	2	6	601765	601770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_017048	CGG	2	6	601802	601807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_017048	ACC	2	6	602073	602078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16122	NC_017048	TGG	2	6	602134	602139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_017048	GC	3	6	602181	602186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_017048	GGT	2	6	602298	602303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_017048	TGA	2	6	602359	602364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_017048	CGA	2	6	602382	602387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_017048	TCA	2	6	602413	602418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_017048	CGT	2	6	602493	602498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_017048	GAG	2	6	602542	602547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16131	NC_017048	CTG	2	6	602644	602649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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