MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017047	AGA	2	6	142862	142867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017047	GCA	2	6	142894	142899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017047	ATG	2	6	142989	142994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017047	CAT	2	6	143096	143101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017047	GAG	2	6	143159	143164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017047	TG	3	6	143189	143194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017047	AT	3	6	143200	143205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017047	A	8	8	143215	143222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017047	TA	3	6	143231	143236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017047	AT	3	6	143288	143293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017047	GCC	2	6	143491	143496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_017047	T	6	6	143503	143508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017047	GGA	2	6	143524	143529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017047	TTA	2	6	143558	143563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017047	GCG	2	6	143598	143603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017047	AAAG	2	8	143702	143709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017047	CTG	2	6	143735	143740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017047	GAT	2	6	143747	143752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017047	TTTTA	2	10	143804	143813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017047	ACG	2	6	144018	144023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256032
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3022	NC_017047	CGC	2	6	144072	144077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256032
3023	NC_017047	GGCA	2	8	144139	144146	25 %	0 %	50 %	25 %	384256032
3024	NC_017047	GTCA	2	8	144156	144163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_017047	AAAAT	2	10	144164	144173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017047	T	7	7	144194	144200	0 %	100 %	0 %	0 %	384256033
3027	NC_017047	A	6	6	144211	144216	100 %	0 %	0 %	0 %	384256033
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3030	NC_017047	ACC	2	6	144329	144334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256033
3031	NC_017047	GACCG	2	10	144335	144344	20 %	0 %	40 %	40 %	384256033
3032	NC_017047	ATTA	2	8	144350	144357	50 %	50 %	0 %	0 %	384256033
3033	NC_017047	CGG	2	6	144431	144436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256033
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3035	NC_017047	CGG	2	6	144475	144480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256033
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3037	NC_017047	GAA	2	6	144579	144584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256033
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3039	NC_017047	TGG	2	6	144630	144635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256033
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3041	NC_017047	GGA	2	6	144760	144765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256034
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3043	NC_017047	CAT	2	6	144994	144999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256034
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3046	NC_017047	TTG	2	6	145145	145150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256034
3047	NC_017047	A	6	6	145184	145189	100 %	0 %	0 %	0 %	384256034
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3049	NC_017047	GAA	2	6	145292	145297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256034
3050	NC_017047	A	6	6	145312	145317	100 %	0 %	0 %	0 %	384256034
3051	NC_017047	GCT	2	6	145405	145410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256034
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3055	NC_017047	CGG	2	6	145552	145557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256034
3056	NC_017047	TGG	2	6	145647	145652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256034
3057	NC_017047	GGC	2	6	145694	145699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256034
3058	NC_017047	GAG	2	6	145718	145723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256034
3059	NC_017047	TGA	2	6	145768	145773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256034
3060	NC_017047	TTCCC	2	10	145845	145854	0 %	40 %	0 %	60 %	384256034
3061	NC_017047	CAG	2	6	145958	145963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256034
3062	NC_017047	TGC	2	6	145990	145995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256034
3063	NC_017047	CTGG	2	8	146026	146033	0 %	25 %	50 %	25 %	384256034
3064	NC_017047	CAGT	2	8	146056	146063	25 %	25 %	25 %	25 %	384256034
3065	NC_017047	GCTG	2	8	146202	146209	0 %	25 %	50 %	25 %	384256034
3066	NC_017047	GAT	2	6	146210	146215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256034
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3069	NC_017047	GCT	2	6	146348	146353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256034
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3075	NC_017047	TCA	2	6	146521	146526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_017047	T	6	6	146724	146729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_017047	T	7	7	146803	146809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3084	NC_017047	AACAG	2	10	146847	146856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3098	NC_017047	GC	3	6	147830	147835	0 %	0 %	50 %	50 %	384256035
3099	NC_017047	ATT	2	6	147868	147873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256035
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3105	NC_017047	CGG	2	6	148167	148172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256035
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3117	NC_017047	TC	3	6	148772	148777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_017047	CTGG	2	8	148828	148835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3120	NC_017047	TTG	2	6	148896	148901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017047	CT	3	6	149028	149033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_017047	AGC	2	6	149180	149185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3124	NC_017047	GGC	2	6	149239	149244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017047	CAGC	2	8	149253	149260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3127	NC_017047	CGC	2	6	149359	149364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3382	NC_017047	AG	3	6	161819	161824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3492	NC_017047	GA	3	6	167281	167286	50 %	0 %	50 %	0 %	384256047
3493	NC_017047	ACC	2	6	167308	167313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256047
3494	NC_017047	TGC	2	6	167324	167329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256047
3495	NC_017047	GAC	2	6	167348	167353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256047
3496	NC_017047	CTGTTC	2	12	167409	167420	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384256047
3497	NC_017047	GCG	2	6	167426	167431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256047
3498	NC_017047	GCA	2	6	167510	167515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256047
3499	NC_017047	GCCA	2	8	167530	167537	25 %	0 %	25 %	50 %	384256047
3500	NC_017047	CGA	2	6	167547	167552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256047

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