MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017047	CGG	2	6	678116	678121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_017047	T	6	6	678177	678182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_017047	TTAT	2	8	678263	678270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_017047	CTT	2	6	678282	678287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_017047	TTA	2	6	678294	678299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_017047	CG	3	6	678338	678343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_017047	TGA	2	6	678377	678382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_017047	GAC	2	6	678416	678421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14009	NC_017047	CTC	2	6	678427	678432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384256513
14010	NC_017047	ATT	2	6	678493	678498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256513
14011	NC_017047	GTCA	2	8	678596	678603	25 %	25 %	25 %	25 %	384256513
14012	NC_017047	CGCC	2	8	678632	678639	0 %	0 %	25 %	75 %	384256513
14013	NC_017047	TGA	2	6	678659	678664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256513
14014	NC_017047	CGC	2	6	678671	678676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256513
14015	NC_017047	CAAA	2	8	678719	678726	75 %	0 %	0 %	25 %	384256513
14016	NC_017047	GCT	3	9	678740	678748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14017	NC_017047	AAGGCG	2	12	678766	678777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384256513
14018	NC_017047	GAA	2	6	678786	678791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256513
14019	NC_017047	A	6	6	678822	678827	100 %	0 %	0 %	0 %	384256513
14020	NC_017047	CTT	2	6	678877	678882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256513
14021	NC_017047	TTC	2	6	678888	678893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256513
14022	NC_017047	CAGG	2	8	678897	678904	25 %	0 %	50 %	25 %	384256513
14023	NC_017047	GCC	2	6	678987	678992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256513
14024	NC_017047	GGC	2	6	679058	679063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256513
14025	NC_017047	GGCA	2	8	679073	679080	25 %	0 %	50 %	25 %	384256513
14026	NC_017047	CAG	2	6	679097	679102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14027	NC_017047	AAG	2	6	679114	679119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256513
14028	NC_017047	CGC	2	6	679120	679125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256513
14029	NC_017047	ACGT	2	8	679180	679187	25 %	25 %	25 %	25 %	384256513
14030	NC_017047	CTG	2	6	679293	679298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14031	NC_017047	TGA	2	6	679310	679315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256513
14032	NC_017047	A	6	6	679335	679340	100 %	0 %	0 %	0 %	384256513
14033	NC_017047	ACATC	2	10	679364	679373	40 %	20 %	0 %	40 %	384256513
14034	NC_017047	CTG	2	6	679446	679451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14035	NC_017047	GCA	2	6	679469	679474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256513
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14037	NC_017047	TGG	2	6	679543	679548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256513
14038	NC_017047	CGC	2	6	679567	679572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256513
14039	NC_017047	CCT	2	6	679588	679593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384256513
14040	NC_017047	CTGAAA	2	12	679600	679611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384256513
14041	NC_017047	GTG	2	6	679635	679640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256513
14042	NC_017047	GTC	2	6	679657	679662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14043	NC_017047	TGG	2	6	679670	679675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256513
14044	NC_017047	GAA	2	6	679704	679709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256513
14045	NC_017047	TTCA	2	8	679824	679831	25 %	50 %	0 %	25 %	384256513
14046	NC_017047	ACG	2	6	679843	679848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256513
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14050	NC_017047	GC	3	6	680053	680058	0 %	0 %	50 %	50 %	384256513
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14053	NC_017047	CGA	2	6	680159	680164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256513
14054	NC_017047	CTA	2	6	680210	680215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256513
14055	NC_017047	TCG	2	6	680293	680298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256514
14056	NC_017047	GCTG	2	8	680306	680313	0 %	25 %	50 %	25 %	384256514
14057	NC_017047	GAA	2	6	680327	680332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256514
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14060	NC_017047	CAG	2	6	680439	680444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256514
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14063	NC_017047	CGGG	2	8	680524	680531	0 %	0 %	75 %	25 %	384256514
14064	NC_017047	TGA	2	6	680533	680538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256514
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14085	NC_017047	CAT	2	6	681854	681859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256514
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14098	NC_017047	GC	3	6	682779	682784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14099	NC_017047	GCC	2	6	682834	682839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14100	NC_017047	ATT	2	6	682854	682859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_017047	CAG	2	6	682935	682940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256516
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14103	NC_017047	TCTT	2	8	683089	683096	0 %	75 %	0 %	25 %	384256516
14104	NC_017047	TAGT	2	8	683107	683114	25 %	50 %	25 %	0 %	384256516
14105	NC_017047	CAG	2	6	683127	683132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256516
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14241	NC_017047	GC	3	6	689861	689866	0 %	0 %	50 %	50 %	384256523
14242	NC_017047	CTG	2	6	689897	689902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256523
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14253	NC_017047	CGCTG	2	10	690402	690411	0 %	20 %	40 %	40 %	384256524
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14260	NC_017047	CTG	2	6	690797	690802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256525
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14312	NC_017047	TGCC	2	8	693300	693307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14352	NC_017047	CA	3	6	695210	695215	50 %	0 %	0 %	50 %	384256529
14353	NC_017047	GAC	2	6	695217	695222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256529
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14355	NC_017047	GCA	2	6	695484	695489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14356	NC_017047	T	7	7	695521	695527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_017047	GTTCA	2	10	695537	695546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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