MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_017047	TGT	2	6	533474	533479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_017047	CAAA	2	8	533497	533504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11005	NC_017047	CTG	2	6	533547	533552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256390
11006	NC_017047	CGA	2	6	533693	533698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256390
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11009	NC_017047	CG	3	6	533773	533778	0 %	0 %	50 %	50 %	384256390
11010	NC_017047	GAA	2	6	533823	533828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256390
11011	NC_017047	AGA	2	6	533948	533953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256390
11012	NC_017047	CCG	2	6	533957	533962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256390
11013	NC_017047	CAG	2	6	533982	533987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256390
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11015	NC_017047	GAA	2	6	534078	534083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256390
11016	NC_017047	CTG	2	6	534087	534092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256390
11017	NC_017047	GAT	2	6	534111	534116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256390
11018	NC_017047	GGCG	2	8	534260	534267	0 %	0 %	75 %	25 %	384256390
11019	NC_017047	GAT	2	6	534317	534322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256390
11020	NC_017047	TGC	2	6	534624	534629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256391
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11022	NC_017047	GCA	2	6	534645	534650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256391
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11024	NC_017047	GCTG	2	8	534862	534869	0 %	25 %	50 %	25 %	384256391
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11028	NC_017047	GC	3	6	535170	535175	0 %	0 %	50 %	50 %	384256391
11029	NC_017047	CTT	2	6	535176	535181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256391
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11033	NC_017047	TGC	2	6	535305	535310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256391
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11055	NC_017047	TGC	2	6	536111	536116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256392
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11061	NC_017047	G	7	7	536334	536340	0 %	0 %	100 %	0 %	384256392
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11113	NC_017047	TTTGA	2	10	538899	538908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11116	NC_017047	TATT	2	8	538978	538985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11120	NC_017047	GCTG	2	8	539282	539289	0 %	25 %	50 %	25 %	384256395
11121	NC_017047	CCTGAT	2	12	539367	539378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384256395
11122	NC_017047	CGC	2	6	539379	539384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256395
11123	NC_017047	AGA	2	6	539391	539396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256395
11124	NC_017047	TTC	2	6	539410	539415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256395
11125	NC_017047	CTG	2	6	539521	539526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256395
11126	NC_017047	TCG	2	6	539540	539545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256395
11127	NC_017047	AGG	2	6	539558	539563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256395
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11129	NC_017047	CTG	2	6	539643	539648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256396
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11131	NC_017047	GTG	2	6	539751	539756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256396
11132	NC_017047	TGG	2	6	539824	539829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256396
11133	NC_017047	TGAA	2	8	539893	539900	50 %	25 %	25 %	0 %	384256396
11134	NC_017047	CGC	2	6	539909	539914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256396
11135	NC_017047	CGT	2	6	539915	539920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256396
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11139	NC_017047	T	6	6	540135	540140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_017047	CAG	2	6	540199	540204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256397
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11142	NC_017047	AGCG	2	8	540257	540264	25 %	0 %	50 %	25 %	384256397
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11145	NC_017047	AT	3	6	540410	540415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11146	NC_017047	GGC	2	6	540427	540432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11147	NC_017047	GAAA	2	8	540456	540463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11148	NC_017047	TGA	2	6	540568	540573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256398
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11150	NC_017047	CTG	2	6	540630	540635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256398
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11203	NC_017047	CTG	2	6	543090	543095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11205	NC_017047	TGA	2	6	543178	543183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256402
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11211	NC_017047	CAG	2	6	543387	543392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256402
11212	NC_017047	CGAG	2	8	543395	543402	25 %	0 %	50 %	25 %	384256402
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11227	NC_017047	GGCC	2	8	544053	544060	0 %	0 %	50 %	50 %	384256402
11228	NC_017047	GCG	2	6	544076	544081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256402
11229	NC_017047	A	6	6	544083	544088	100 %	0 %	0 %	0 %	384256402
11230	NC_017047	GCA	2	6	544127	544132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256402
11231	NC_017047	ACTG	2	8	544166	544173	25 %	25 %	25 %	25 %	384256402
11232	NC_017047	CTG	3	9	544171	544179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256402
11233	NC_017047	CAA	2	6	544226	544231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256402
11234	NC_017047	TCG	2	6	544237	544242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256402
11235	NC_017047	TGA	2	6	544262	544267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256402
11236	NC_017047	ACT	2	6	544359	544364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256403
11237	NC_017047	GCT	2	6	544365	544370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256403
11238	NC_017047	CG	3	6	544372	544377	0 %	0 %	50 %	50 %	384256403
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11359	NC_017047	ATG	2	6	549566	549571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11481	NC_017047	CAGATA	2	12	555995	556006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384256416
11482	NC_017047	ATC	2	6	556038	556043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256416
11483	NC_017047	GGAA	2	8	556067	556074	50 %	0 %	50 %	0 %	384256416
11484	NC_017047	TGC	2	6	556140	556145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256416
11485	NC_017047	TCA	2	6	556162	556167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256416
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11491	NC_017047	TGC	2	6	556450	556455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256416
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11499	NC_017047	GTG	2	6	556961	556966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256417
11500	NC_017047	GCT	2	6	557000	557005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256417

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