MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TAAT	2	8	44	51	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017044	CCAA	2	8	69	76	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017044	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017044	TA	3	6	180	185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017044	ATA	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483342
6	NC_017044	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
7	NC_017044	CAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
8	NC_017044	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483342
9	NC_017044	AAAT	2	8	458	465	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
10	NC_017044	TGATA	2	10	557	566	40 %	40 %	20 %	0 %	383483342
11	NC_017044	AT	3	6	570	575	50 %	50 %	0 %	0 %	383483342
12	NC_017044	TAAA	2	8	582	589	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
13	NC_017044	ATAG	2	8	641	648	50 %	25 %	25 %	0 %	383483342
14	NC_017044	TTA	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
15	NC_017044	TTA	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
16	NC_017044	AT	3	6	778	783	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
17	NC_017044	TAA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
18	NC_017044	CTA	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483343
19	NC_017044	T	7	7	941	947	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
20	NC_017044	CTACT	2	10	1006	1015	20 %	40 %	0 %	40 %	383483343
21	NC_017044	TAT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
22	NC_017044	T	6	6	1120	1125	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
23	NC_017044	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
24	NC_017044	TAAT	2	8	1183	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
25	NC_017044	AATATC	2	12	1250	1261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383483343
26	NC_017044	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	383483343
27	NC_017044	GAT	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
28	NC_017044	GTA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
29	NC_017044	AAT	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
30	NC_017044	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
31	NC_017044	T	7	7	1355	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
32	NC_017044	CTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
33	NC_017044	TCT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
34	NC_017044	CTC	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483343
35	NC_017044	AGA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483343
36	NC_017044	ACC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483343
37	NC_017044	T	6	6	1522	1527	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
38	NC_017044	T	6	6	1532	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
39	NC_017044	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	383483343
40	NC_017044	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
41	NC_017044	ATA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
42	NC_017044	ATTA	2	8	1592	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
43	NC_017044	ATAGA	2	10	1610	1619	60 %	20 %	20 %	0 %	383483343
44	NC_017044	T	6	6	1650	1655	0 %	100 %	0 %	0 %	383483343
45	NC_017044	TTCTT	2	10	1687	1696	0 %	80 %	0 %	20 %	383483343
46	NC_017044	CTTTC	2	10	1785	1794	0 %	60 %	0 %	40 %	383483344
47	NC_017044	GAA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483344
48	NC_017044	T	6	6	1817	1822	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
49	NC_017044	TAA	2	6	1826	1831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
50	NC_017044	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
51	NC_017044	CACTC	2	10	1889	1898	20 %	20 %	0 %	60 %	383483344
52	NC_017044	T	7	7	1904	1910	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
53	NC_017044	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
54	NC_017044	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
55	NC_017044	CTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
56	NC_017044	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
57	NC_017044	GAT	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483344
58	NC_017044	T	6	6	2168	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
59	NC_017044	TAA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
60	NC_017044	TAA	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
61	NC_017044	TTC	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
62	NC_017044	TATTT	2	10	2205	2214	20 %	80 %	0 %	0 %	383483344
63	NC_017044	AT	3	6	2217	2222	50 %	50 %	0 %	0 %	383483344
64	NC_017044	T	6	6	2226	2231	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
65	NC_017044	TTTTCC	2	12	2250	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
66	NC_017044	TCA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
67	NC_017044	T	7	7	2334	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
68	NC_017044	T	7	7	2343	2349	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
69	NC_017044	ATT	2	6	2350	2355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
70	NC_017044	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	383483344
71	NC_017044	TCT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
72	NC_017044	AT	3	6	2492	2497	50 %	50 %	0 %	0 %	383483344
73	NC_017044	A	6	6	2501	2506	100 %	0 %	0 %	0 %	383483344
74	NC_017044	TTGCT	2	10	2558	2567	0 %	60 %	20 %	20 %	383483344
75	NC_017044	CAT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
76	NC_017044	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
77	NC_017044	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483344
78	NC_017044	T	6	6	2613	2618	0 %	100 %	0 %	0 %	383483344
79	NC_017044	TAT	3	9	2669	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
80	NC_017044	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017044	AT	3	6	2737	2742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017044	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017044	TGT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017044	CAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017044	ATT	3	9	2849	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017044	T	6	6	2931	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017044	TATT	2	8	2977	2984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017044	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017044	ATA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017044	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017044	A	6	6	3072	3077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017044	ATT	2	6	3116	3121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
93	NC_017044	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
94	NC_017044	ATT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
95	NC_017044	T	6	6	3396	3401	0 %	100 %	0 %	0 %	383483345
96	NC_017044	ATG	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
97	NC_017044	ATA	2	6	3536	3541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
98	NC_017044	GTA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
99	NC_017044	TTA	2	6	3690	3695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
100	NC_017044	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483345
101	NC_017044	TAA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
102	NC_017044	AT	3	6	3890	3895	50 %	50 %	0 %	0 %	383483345
103	NC_017044	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	383483345
104	NC_017044	ATA	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
105	NC_017044	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017044	TTTA	2	8	3969	3976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017044	TGT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017044	TTG	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017044	ATA	2	6	4257	4262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
110	NC_017044	AAAGTA	2	12	4290	4301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383483346
111	NC_017044	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
112	NC_017044	GTA	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
113	NC_017044	CAA	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483346
114	NC_017044	A	7	7	4420	4426	100 %	0 %	0 %	0 %	383483346
115	NC_017044	TAA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
116	NC_017044	ATTT	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017044	TCT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483347
118	NC_017044	A	6	6	4573	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
119	NC_017044	TC	3	6	4583	4588	0 %	50 %	0 %	50 %	383483347
120	NC_017044	A	6	6	4643	4648	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
121	NC_017044	AT	3	6	4708	4713	50 %	50 %	0 %	0 %	383483347
122	NC_017044	TA	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	383483347
123	NC_017044	ATA	3	9	4829	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
124	NC_017044	A	7	7	4855	4861	100 %	0 %	0 %	0 %	383483347
125	NC_017044	GTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
126	NC_017044	TGA	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
127	NC_017044	GAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
128	NC_017044	AAT	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
129	NC_017044	AAG	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
130	NC_017044	TTA	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483347
131	NC_017044	CAA	3	9	5200	5208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483347
132	NC_017044	T	8	8	5232	5239	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
133	NC_017044	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	383483348
134	NC_017044	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
135	NC_017044	T	6	6	5367	5372	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
136	NC_017044	T	6	6	5376	5381	0 %	100 %	0 %	0 %	383483348
137	NC_017044	GA	3	6	5394	5399	50 %	0 %	50 %	0 %	383483348
138	NC_017044	CGG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483348
139	NC_017044	AGC	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483348
140	NC_017044	ATA	2	6	5497	5502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
141	NC_017044	A	7	7	5502	5508	100 %	0 %	0 %	0 %	383483348
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270	NC_017044	ATT	3	9	10179	10187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483352
271	NC_017044	TCA	2	6	10199	10204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483352
272	NC_017044	CCT	2	6	10210	10215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483352
273	NC_017044	TAT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483352
274	NC_017044	TAC	2	6	10377	10382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483352
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463	NC_017044	ATT	2	6	18163	18168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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