MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_017044	GCTT	2	8	1291926	1291933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33003	NC_017044	GAA	2	6	1291961	1291966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_017044	CGA	2	6	1291980	1291985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33005	NC_017044	GT	3	6	1292000	1292005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_017044	TAT	2	6	1292006	1292011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_017044	GCT	2	6	1292038	1292043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33008	NC_017044	TA	3	6	1292064	1292069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33009	NC_017044	TGA	2	6	1292126	1292131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33010	NC_017044	AGAGA	2	10	1292193	1292202	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33011	NC_017044	CA	3	6	1292317	1292322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33012	NC_017044	CTT	2	6	1292366	1292371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484651
33013	NC_017044	T	6	6	1292404	1292409	0 %	100 %	0 %	0 %	383484651
33014	NC_017044	GCCAA	2	10	1292505	1292514	40 %	0 %	20 %	40 %	383484651
33015	NC_017044	T	7	7	1292529	1292535	0 %	100 %	0 %	0 %	383484651
33016	NC_017044	ACA	2	6	1292539	1292544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484651
33017	NC_017044	TAT	2	6	1292552	1292557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484651
33018	NC_017044	AAGC	2	8	1292561	1292568	50 %	0 %	25 %	25 %	383484651
33019	NC_017044	CTA	3	9	1292630	1292638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484651
33020	NC_017044	ATATT	2	10	1292695	1292704	40 %	60 %	0 %	0 %	383484651
33021	NC_017044	ATT	2	6	1292712	1292717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484652
33022	NC_017044	T	6	6	1292721	1292726	0 %	100 %	0 %	0 %	383484652
33023	NC_017044	CTT	2	6	1292727	1292732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484652
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33026	NC_017044	A	6	6	1292820	1292825	100 %	0 %	0 %	0 %	383484652
33027	NC_017044	TACT	2	8	1292841	1292848	25 %	50 %	0 %	25 %	383484652
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33030	NC_017044	TTA	2	6	1292913	1292918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_017044	AG	3	6	1292986	1292991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33032	NC_017044	GCGA	2	8	1293002	1293009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33033	NC_017044	TAA	2	6	1293011	1293016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_017044	AGT	2	6	1293066	1293071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33035	NC_017044	GCG	2	6	1293185	1293190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383484653
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33037	NC_017044	TA	3	6	1293446	1293451	50 %	50 %	0 %	0 %	383484653
33038	NC_017044	T	8	8	1293483	1293490	0 %	100 %	0 %	0 %	383484653
33039	NC_017044	CTA	2	6	1293503	1293508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484653
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33048	NC_017044	TAG	3	9	1293920	1293928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484653
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33057	NC_017044	CTA	2	6	1294213	1294218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484653
33058	NC_017044	TA	3	6	1294257	1294262	50 %	50 %	0 %	0 %	383484653
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33071	NC_017044	ATA	2	6	1294804	1294809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484653
33072	NC_017044	TAC	2	6	1294820	1294825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484653
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33082	NC_017044	GTAA	2	8	1295233	1295240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33083	NC_017044	GCTG	2	8	1295314	1295321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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33088	NC_017044	TGA	2	6	1295542	1295547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484656
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33091	NC_017044	AAT	2	6	1295606	1295611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484656
33092	NC_017044	TAC	2	6	1295700	1295705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33103	NC_017044	TTAT	2	8	1296139	1296146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_017044	TAAC	2	8	1296154	1296161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33105	NC_017044	CTT	2	6	1296170	1296175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33106	NC_017044	ATTTA	2	10	1296182	1296191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33107	NC_017044	AGG	2	6	1296227	1296232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33108	NC_017044	A	7	7	1296245	1296251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33109	NC_017044	GAA	2	6	1296270	1296275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33110	NC_017044	GAA	2	6	1296367	1296372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33111	NC_017044	AAAAGA	2	12	1296375	1296386	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33112	NC_017044	A	6	6	1296436	1296441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_017044	ATT	2	6	1296460	1296465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_017044	AGT	2	6	1296470	1296475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33117	NC_017044	GAA	2	6	1296573	1296578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33118	NC_017044	CAAAAT	2	12	1296675	1296686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33119	NC_017044	A	7	7	1296852	1296858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33120	NC_017044	ACA	2	6	1296867	1296872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.