MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017044	TAA	2	6	1216313	1216318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484566
31003	NC_017044	GCA	2	6	1216399	1216404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31004	NC_017044	TTA	2	6	1216418	1216423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484566
31005	NC_017044	CCT	2	6	1216426	1216431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383484566
31006	NC_017044	TAAT	2	8	1216481	1216488	50 %	50 %	0 %	0 %	383484566
31007	NC_017044	GCA	2	6	1216489	1216494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31008	NC_017044	GCA	2	6	1216564	1216569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31009	NC_017044	ATT	2	6	1216575	1216580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484566
31010	NC_017044	CAA	2	6	1216623	1216628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484566
31011	NC_017044	CAA	2	6	1216652	1216657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484566
31012	NC_017044	AGT	2	6	1216689	1216694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484566
31013	NC_017044	TAA	2	6	1216715	1216720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484566
31014	NC_017044	CAC	2	6	1216754	1216759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484566
31015	NC_017044	GTAA	2	8	1216761	1216768	50 %	25 %	25 %	0 %	383484566
31016	NC_017044	CAG	2	6	1216793	1216798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31017	NC_017044	ATT	3	9	1216839	1216847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484566
31018	NC_017044	CAT	2	6	1216853	1216858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484566
31019	NC_017044	TGC	2	6	1216866	1216871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31020	NC_017044	ATT	3	9	1216872	1216880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484566
31021	NC_017044	GCA	2	6	1216897	1216902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
31022	NC_017044	CTA	2	6	1216918	1216923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484566
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31025	NC_017044	TTG	2	6	1216974	1216979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484566
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31027	NC_017044	AT	3	6	1217017	1217022	50 %	50 %	0 %	0 %	383484566
31028	NC_017044	TAA	2	6	1217031	1217036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31029	NC_017044	T	6	6	1217071	1217076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31030	NC_017044	TAT	2	6	1217085	1217090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31031	NC_017044	TAA	2	6	1217094	1217099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_017044	GAT	2	6	1217104	1217109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_017044	TTG	2	6	1217150	1217155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31034	NC_017044	CTG	2	6	1217171	1217176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31035	NC_017044	G	6	6	1217210	1217215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31036	NC_017044	TAA	2	6	1217281	1217286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_017044	CAT	2	6	1217289	1217294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31038	NC_017044	AAT	2	6	1217327	1217332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31039	NC_017044	TAAT	2	8	1217399	1217406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_017044	GT	3	6	1217414	1217419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_017044	TTC	2	6	1217440	1217445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31042	NC_017044	ATG	2	6	1217467	1217472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_017044	TA	3	6	1217523	1217528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31044	NC_017044	CAA	2	6	1217613	1217618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31045	NC_017044	A	6	6	1217645	1217650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31051	NC_017044	TCA	2	6	1217842	1217847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484567
31052	NC_017044	CTA	2	6	1217872	1217877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484567
31053	NC_017044	TCT	2	6	1217881	1217886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484567
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31055	NC_017044	CT	3	6	1217929	1217934	0 %	50 %	0 %	50 %	383484567
31056	NC_017044	ATAA	2	8	1218016	1218023	75 %	25 %	0 %	0 %	383484567
31057	NC_017044	TAA	2	6	1218143	1218148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484567
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31062	NC_017044	CAT	2	6	1218554	1218559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484567
31063	NC_017044	ATCA	2	8	1218585	1218592	50 %	25 %	0 %	25 %	383484567
31064	NC_017044	TTC	2	6	1218606	1218611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484567
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31090	NC_017044	A	6	6	1219443	1219448	100 %	0 %	0 %	0 %	383484567
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31101	NC_017044	ATAA	2	8	1219712	1219719	75 %	25 %	0 %	0 %	383484567
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31105	NC_017044	TTTA	2	8	1219869	1219876	25 %	75 %	0 %	0 %	383484567
31106	NC_017044	ATT	2	6	1219967	1219972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_017044	AT	3	6	1220037	1220042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31113	NC_017044	T	7	7	1220172	1220178	0 %	100 %	0 %	0 %	383484568
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31228	NC_017044	A	6	6	1224327	1224332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31229	NC_017044	ATA	2	6	1224346	1224351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31231	NC_017044	A	7	7	1224415	1224421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31232	NC_017044	TAA	2	6	1224430	1224435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31486	NC_017044	TTA	2	6	1233421	1233426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484587
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31489	NC_017044	TA	3	6	1233465	1233470	50 %	50 %	0 %	0 %	383484587
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