MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_017044	TTTC	2	8	1195026	1195033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30502	NC_017044	ACT	2	6	1195055	1195060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30503	NC_017044	AAG	2	6	1195071	1195076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30504	NC_017044	GGT	2	6	1195160	1195165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30505	NC_017044	TTAT	2	8	1195185	1195192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30506	NC_017044	TA	3	6	1195198	1195203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30507	NC_017044	TA	3	6	1195209	1195214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30508	NC_017044	TAG	2	6	1195237	1195242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30509	NC_017044	TAA	2	6	1195284	1195289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30510	NC_017044	GCA	2	6	1195290	1195295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30511	NC_017044	TAT	2	6	1195306	1195311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30512	NC_017044	ATT	2	6	1195430	1195435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30513	NC_017044	TCA	2	6	1195446	1195451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30514	NC_017044	CT	3	6	1195484	1195489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30515	NC_017044	TCT	2	6	1195504	1195509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30516	NC_017044	TC	3	6	1195557	1195562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30517	NC_017044	TAT	2	6	1195589	1195594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30518	NC_017044	GCA	2	6	1195600	1195605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30519	NC_017044	CTA	2	6	1195687	1195692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30520	NC_017044	ACT	2	6	1195719	1195724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30521	NC_017044	TAT	2	6	1195739	1195744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30522	NC_017044	ACT	2	6	1195794	1195799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30523	NC_017044	GCA	2	6	1195897	1195902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484550
30524	NC_017044	TAT	2	6	1195907	1195912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484550
30525	NC_017044	CAC	2	6	1195928	1195933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484550
30526	NC_017044	GTA	2	6	1196029	1196034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484550
30527	NC_017044	CCT	2	6	1196050	1196055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30528	NC_017044	ACC	2	6	1196163	1196168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484551
30529	NC_017044	CCG	2	6	1196188	1196193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383484551
30530	NC_017044	CCT	2	6	1196209	1196214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383484551
30531	NC_017044	GCCTGT	2	12	1196241	1196252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484551
30532	NC_017044	AGT	2	6	1196259	1196264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484551
30533	NC_017044	TAT	2	6	1196270	1196275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484551
30534	NC_017044	CGT	2	6	1196300	1196305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484551
30535	NC_017044	GCC	2	6	1196307	1196312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383484551
30536	NC_017044	AT	4	8	1196331	1196338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30537	NC_017044	TA	3	6	1196339	1196344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30538	NC_017044	ACTAC	2	10	1196351	1196360	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30539	NC_017044	TGG	2	6	1196368	1196373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30540	NC_017044	TAA	2	6	1196431	1196436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30541	NC_017044	AGT	2	6	1196441	1196446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30542	NC_017044	TATT	2	8	1196554	1196561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30543	NC_017044	TGA	2	6	1196569	1196574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_017044	TAT	2	6	1196575	1196580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30545	NC_017044	ATC	2	6	1196607	1196612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30546	NC_017044	ACC	2	6	1196654	1196659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30547	NC_017044	TAT	2	6	1196705	1196710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30548	NC_017044	CCT	2	6	1196715	1196720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30549	NC_017044	GTG	2	6	1196724	1196729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30550	NC_017044	ATT	2	6	1196768	1196773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30551	NC_017044	GAA	2	6	1196799	1196804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_017044	TAC	2	6	1196824	1196829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30553	NC_017044	AGA	2	6	1196893	1196898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_017044	TAA	2	6	1196905	1196910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30555	NC_017044	TAT	2	6	1196950	1196955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30556	NC_017044	TAT	2	6	1197013	1197018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30557	NC_017044	CAT	2	6	1197029	1197034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30558	NC_017044	AAT	2	6	1197081	1197086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30559	NC_017044	TTC	2	6	1197097	1197102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30560	NC_017044	CAT	3	9	1197152	1197160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30561	NC_017044	GCA	2	6	1197202	1197207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30562	NC_017044	TGC	3	9	1197230	1197238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30563	NC_017044	TTTTG	2	10	1197264	1197273	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30564	NC_017044	TGT	2	6	1197285	1197290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30565	NC_017044	CCG	2	6	1197310	1197315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30566	NC_017044	TGA	2	6	1197324	1197329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30567	NC_017044	TAC	2	6	1197425	1197430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484552
30568	NC_017044	ATC	2	6	1197466	1197471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484552
30569	NC_017044	ATT	2	6	1197481	1197486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484552
30570	NC_017044	ATT	2	6	1197511	1197516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484552
30571	NC_017044	GTT	2	6	1197524	1197529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484552
30572	NC_017044	TGAAC	2	10	1197582	1197591	40 %	20 %	20 %	20 %	383484552
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30585	NC_017044	CCG	2	6	1198231	1198236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30586	NC_017044	TGT	2	6	1198256	1198261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30587	NC_017044	TAT	2	6	1198388	1198393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30588	NC_017044	ATT	2	6	1198431	1198436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30589	NC_017044	A	7	7	1198507	1198513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30590	NC_017044	TTA	2	6	1198586	1198591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30591	NC_017044	TTA	2	6	1198657	1198662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30592	NC_017044	AAC	2	6	1198731	1198736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30593	NC_017044	CAG	2	6	1198964	1198969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30594	NC_017044	CAA	2	6	1199033	1199038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30595	NC_017044	ATT	3	9	1199130	1199138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30596	NC_017044	TAC	2	6	1199156	1199161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30598	NC_017044	TAG	2	6	1199234	1199239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30600	NC_017044	AGT	2	6	1199394	1199399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30602	NC_017044	AAG	2	6	1199576	1199581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30603	NC_017044	T	6	6	1199594	1199599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30604	NC_017044	TTA	2	6	1199614	1199619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30605	NC_017044	ATT	2	6	1199649	1199654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30606	NC_017044	CCT	2	6	1199677	1199682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30607	NC_017044	TGC	2	6	1199706	1199711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30608	NC_017044	ACT	2	6	1199712	1199717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30609	NC_017044	CTG	2	6	1199723	1199728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30610	NC_017044	TAA	2	6	1199792	1199797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30611	NC_017044	TGT	2	6	1199799	1199804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30612	NC_017044	TGTTCC	2	12	1199859	1199870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30613	NC_017044	GTA	2	6	1199887	1199892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30614	NC_017044	TGT	2	6	1199895	1199900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30615	NC_017044	GCA	2	6	1199920	1199925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30617	NC_017044	ATT	2	6	1199967	1199972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30618	NC_017044	AGT	2	6	1199982	1199987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30619	NC_017044	CCGC	2	8	1200133	1200140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30620	NC_017044	ATT	2	6	1200162	1200167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30621	NC_017044	AT	3	6	1200182	1200187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30623	NC_017044	TAT	2	6	1200261	1200266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484554
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30980	NC_017044	GTA	2	6	1215421	1215426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484566
30981	NC_017044	TAA	2	6	1215431	1215436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484566
30982	NC_017044	ATTTAA	2	12	1215531	1215542	50 %	50 %	0 %	0 %	383484566
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30984	NC_017044	GCA	2	6	1215625	1215630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484566
30985	NC_017044	GTA	2	6	1215646	1215651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484566
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