MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_017044	CAT	2	6	1114373	1114378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484481
28503	NC_017044	TCA	2	6	1114404	1114409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484481
28504	NC_017044	TA	3	6	1114411	1114416	50 %	50 %	0 %	0 %	383484481
28505	NC_017044	A	6	6	1114437	1114442	100 %	0 %	0 %	0 %	383484481
28506	NC_017044	TA	3	6	1114446	1114451	50 %	50 %	0 %	0 %	383484481
28507	NC_017044	ATA	2	6	1114456	1114461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484481
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28509	NC_017044	AATA	2	8	1114559	1114566	75 %	25 %	0 %	0 %	383484481
28510	NC_017044	AAT	2	6	1114587	1114592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484481
28511	NC_017044	ACA	2	6	1114607	1114612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484481
28512	NC_017044	TCA	2	6	1114625	1114630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484481
28513	NC_017044	TAA	2	6	1114669	1114674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484481
28514	NC_017044	TA	3	6	1114680	1114685	50 %	50 %	0 %	0 %	383484481
28515	NC_017044	TC	3	6	1114687	1114692	0 %	50 %	0 %	50 %	383484481
28516	NC_017044	AATG	2	8	1114737	1114744	50 %	25 %	25 %	0 %	383484481
28517	NC_017044	AGC	2	6	1114754	1114759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484481
28518	NC_017044	TC	3	6	1114856	1114861	0 %	50 %	0 %	50 %	383484481
28519	NC_017044	TC	3	6	1114873	1114878	0 %	50 %	0 %	50 %	383484481
28520	NC_017044	CTA	3	9	1114933	1114941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484481
28521	NC_017044	GAT	2	6	1114956	1114961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484481
28522	NC_017044	AGC	2	6	1114980	1114985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484481
28523	NC_017044	TA	3	6	1114992	1114997	50 %	50 %	0 %	0 %	383484481
28524	NC_017044	GTATT	2	10	1115042	1115051	20 %	60 %	20 %	0 %	383484481
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28526	NC_017044	GAA	2	6	1115077	1115082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484481
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28528	NC_017044	GAA	2	6	1115114	1115119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484481
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28532	NC_017044	TAC	2	6	1115257	1115262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484481
28533	NC_017044	ACTA	2	8	1115264	1115271	50 %	25 %	0 %	25 %	383484481
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28535	NC_017044	AAATT	2	10	1115292	1115301	60 %	40 %	0 %	0 %	383484481
28536	NC_017044	TTC	2	6	1115330	1115335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484481
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28539	NC_017044	AAC	2	6	1115429	1115434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484481
28540	NC_017044	AAAG	2	8	1115457	1115464	75 %	0 %	25 %	0 %	383484481
28541	NC_017044	TTA	2	6	1115535	1115540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484481
28542	NC_017044	GTT	2	6	1115583	1115588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_017044	ATT	2	6	1115605	1115610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28544	NC_017044	TA	4	8	1115625	1115632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_017044	ATG	2	6	1115635	1115640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28546	NC_017044	AGCTTA	2	12	1115766	1115777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28547	NC_017044	TAT	2	6	1115790	1115795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28548	NC_017044	GGT	2	6	1115851	1115856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28549	NC_017044	TAAT	2	8	1115879	1115886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28550	NC_017044	TCA	2	6	1115932	1115937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28551	NC_017044	ATTT	2	8	1115942	1115949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28552	NC_017044	A	7	7	1115961	1115967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28553	NC_017044	AAC	2	6	1116033	1116038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28554	NC_017044	A	6	6	1116054	1116059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28555	NC_017044	ATC	3	9	1116090	1116098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28556	NC_017044	CTAC	2	8	1116111	1116118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28557	NC_017044	ATT	2	6	1116141	1116146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28558	NC_017044	TCA	2	6	1116205	1116210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28569	NC_017044	TA	6	12	1116467	1116478	50 %	50 %	0 %	0 %	383484482
28570	NC_017044	TGC	3	9	1116546	1116554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484482
28571	NC_017044	TC	3	6	1116564	1116569	0 %	50 %	0 %	50 %	383484482
28572	NC_017044	TCA	2	6	1116584	1116589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484482
28573	NC_017044	AG	3	6	1116605	1116610	50 %	0 %	50 %	0 %	383484482
28574	NC_017044	ACT	2	6	1116617	1116622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28579	NC_017044	CTG	2	6	1116801	1116806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484483
28580	NC_017044	AC	3	6	1116896	1116901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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28587	NC_017044	AAT	2	6	1117198	1117203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28588	NC_017044	A	6	6	1117229	1117234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28589	NC_017044	CTC	2	6	1117267	1117272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28590	NC_017044	GCT	2	6	1117290	1117295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28591	NC_017044	ATT	2	6	1117308	1117313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28592	NC_017044	TAT	2	6	1117348	1117353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484485
28593	NC_017044	CAT	2	6	1117365	1117370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484485
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28601	NC_017044	TTG	2	6	1117572	1117577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484485
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28603	NC_017044	CATC	2	8	1117637	1117644	25 %	25 %	0 %	50 %	383484485
28604	NC_017044	AAT	2	6	1117671	1117676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484485
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28606	NC_017044	AT	3	6	1117729	1117734	50 %	50 %	0 %	0 %	383484485
28607	NC_017044	TAA	2	6	1117776	1117781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28608	NC_017044	ATCT	2	8	1117794	1117801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28609	NC_017044	TAATT	2	10	1117831	1117840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28610	NC_017044	ATAA	2	8	1117993	1118000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28611	NC_017044	TTTC	2	8	1118010	1118017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28612	NC_017044	GCA	2	6	1118094	1118099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484486
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28615	NC_017044	ATC	2	6	1118241	1118246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484486
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28617	NC_017044	GGT	2	6	1118319	1118324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484486
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28619	NC_017044	TGA	2	6	1118393	1118398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484486
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28987	NC_017044	ATC	2	6	1132653	1132658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484499
28988	NC_017044	ACT	2	6	1132659	1132664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484499
28989	NC_017044	AGT	2	6	1132710	1132715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484499
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28991	NC_017044	TGA	2	6	1132785	1132790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484499
28992	NC_017044	TAT	2	6	1132913	1132918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484499
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