MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017044	TAA	2	6	1019473	1019478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484383
26003	NC_017044	TACC	2	8	1019502	1019509	25 %	25 %	0 %	50 %	383484383
26004	NC_017044	ATTTA	2	10	1019517	1019526	40 %	60 %	0 %	0 %	383484383
26005	NC_017044	TTTGTC	2	12	1019527	1019538	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484383
26006	NC_017044	AAT	2	6	1019573	1019578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484383
26007	NC_017044	AGA	2	6	1019589	1019594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484383
26008	NC_017044	TGG	2	6	1019602	1019607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484383
26009	NC_017044	GCT	2	6	1019648	1019653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484383
26010	NC_017044	CTT	2	6	1019660	1019665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484383
26011	NC_017044	ACTTT	2	10	1019679	1019688	20 %	60 %	0 %	20 %	383484383
26012	NC_017044	T	6	6	1019750	1019755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26013	NC_017044	AT	3	6	1019757	1019762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_017044	TTC	2	6	1019851	1019856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26015	NC_017044	ATCAAT	2	12	1019863	1019874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26016	NC_017044	ATC	2	6	1019881	1019886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26017	NC_017044	TTA	2	6	1019906	1019911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26018	NC_017044	GTA	2	6	1019924	1019929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26019	NC_017044	ACT	2	6	1019959	1019964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26020	NC_017044	TTGCC	2	10	1019967	1019976	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26021	NC_017044	GTT	2	6	1019999	1020004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26022	NC_017044	ATT	2	6	1020062	1020067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26023	NC_017044	A	6	6	1020121	1020126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26024	NC_017044	CAT	2	6	1020129	1020134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26025	NC_017044	TTG	2	6	1020146	1020151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26026	NC_017044	ATA	2	6	1020178	1020183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26027	NC_017044	AAG	2	6	1020200	1020205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26028	NC_017044	TACA	2	8	1020335	1020342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26029	NC_017044	ATT	2	6	1020363	1020368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26030	NC_017044	TAA	2	6	1020369	1020374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26031	NC_017044	AGC	2	6	1020399	1020404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26032	NC_017044	CAT	2	6	1020437	1020442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26033	NC_017044	CATTGT	2	12	1020488	1020499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26034	NC_017044	ATT	3	9	1020522	1020530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26035	NC_017044	ATA	2	6	1020574	1020579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26036	NC_017044	ACTA	2	8	1020722	1020729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26037	NC_017044	T	6	6	1020737	1020742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26038	NC_017044	AAG	2	6	1020751	1020756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26039	NC_017044	TTCTA	2	10	1020794	1020803	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26040	NC_017044	T	7	7	1020854	1020860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26041	NC_017044	ATT	2	6	1020902	1020907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26042	NC_017044	GTAA	2	8	1020909	1020916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26043	NC_017044	TA	3	6	1020929	1020934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26044	NC_017044	A	6	6	1020942	1020947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_017044	TC	3	6	1020951	1020956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26046	NC_017044	GCT	2	6	1020990	1020995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26047	NC_017044	ATT	2	6	1021022	1021027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26048	NC_017044	T	6	6	1021026	1021031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26049	NC_017044	ATC	2	6	1021091	1021096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26050	NC_017044	TAGCA	2	10	1021097	1021106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26051	NC_017044	ATT	2	6	1021161	1021166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26052	NC_017044	ATT	2	6	1021206	1021211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26053	NC_017044	AGC	2	6	1021230	1021235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26054	NC_017044	TACTT	2	10	1021236	1021245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26055	NC_017044	GTA	2	6	1021366	1021371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26056	NC_017044	AT	3	6	1021400	1021405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26057	NC_017044	TAT	2	6	1021419	1021424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26058	NC_017044	TTA	2	6	1021435	1021440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26059	NC_017044	TAAA	2	8	1021455	1021462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26060	NC_017044	TA	4	8	1021505	1021512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26061	NC_017044	ATT	2	6	1021530	1021535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26062	NC_017044	CA	3	6	1021549	1021554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26063	NC_017044	AG	3	6	1021577	1021582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26064	NC_017044	A	7	7	1021613	1021619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26065	NC_017044	ACATA	2	10	1021632	1021641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26066	NC_017044	T	6	6	1021645	1021650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26069	NC_017044	TAT	2	6	1021713	1021718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26070	NC_017044	AT	3	6	1021761	1021766	50 %	50 %	0 %	0 %	383484384
26071	NC_017044	ATT	2	6	1021776	1021781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484384
26072	NC_017044	AAT	2	6	1021786	1021791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484384
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26074	NC_017044	GT	3	6	1021942	1021947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26075	NC_017044	AAT	2	6	1021964	1021969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26076	NC_017044	ATT	2	6	1022039	1022044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26077	NC_017044	A	7	7	1022073	1022079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26078	NC_017044	A	6	6	1022099	1022104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26079	NC_017044	GAA	2	6	1022111	1022116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26082	NC_017044	ACA	2	6	1022256	1022261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26083	NC_017044	TGA	2	6	1022280	1022285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26084	NC_017044	ATT	2	6	1022299	1022304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26085	NC_017044	GGAA	2	8	1022319	1022326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26087	NC_017044	TTA	2	6	1022338	1022343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26088	NC_017044	CTTG	2	8	1022382	1022389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26089	NC_017044	AGA	2	6	1022395	1022400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484385
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26093	NC_017044	CAA	2	6	1022583	1022588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484385
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26095	NC_017044	TAA	2	6	1022656	1022661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484385
26096	NC_017044	ATT	2	6	1022697	1022702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484385
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26103	NC_017044	CTA	2	6	1022889	1022894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484385
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26105	NC_017044	ATAA	2	8	1022998	1023005	75 %	25 %	0 %	0 %	383484385
26106	NC_017044	ATT	2	6	1023035	1023040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26107	NC_017044	T	8	8	1023067	1023074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26108	NC_017044	TGG	2	6	1023078	1023083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484386
26109	NC_017044	TCT	2	6	1023143	1023148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484386
26110	NC_017044	TAC	2	6	1023152	1023157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484386
26111	NC_017044	ATA	2	6	1023189	1023194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484386
26112	NC_017044	ATT	2	6	1023217	1023222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484386
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26115	NC_017044	A	6	6	1023354	1023359	100 %	0 %	0 %	0 %	383484386
26116	NC_017044	TAT	2	6	1023360	1023365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484386
26117	NC_017044	ATT	2	6	1023368	1023373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484386
26118	NC_017044	TAT	2	6	1023419	1023424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26119	NC_017044	T	7	7	1023424	1023430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26120	NC_017044	GTT	2	6	1023512	1023517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26121	NC_017044	ACCC	2	8	1023526	1023533	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26122	NC_017044	TTG	2	6	1023557	1023562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26123	NC_017044	AAT	2	6	1023612	1023617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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