MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_017044	T	6	6	999406	999411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25503	NC_017044	AGATA	2	10	999476	999485	60 %	20 %	20 %	0 %	383484365
25504	NC_017044	TTA	2	6	999493	999498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484365
25505	NC_017044	CGT	2	6	999594	999599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484365
25506	NC_017044	TAA	2	6	999623	999628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484365
25507	NC_017044	ATT	2	6	999631	999636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484365
25508	NC_017044	T	6	6	999813	999818	0 %	100 %	0 %	0 %	383484365
25509	NC_017044	A	7	7	999888	999894	100 %	0 %	0 %	0 %	383484365
25510	NC_017044	A	6	6	999902	999907	100 %	0 %	0 %	0 %	383484365
25511	NC_017044	ATA	2	6	999919	999924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484365
25512	NC_017044	ATG	2	6	1000015	1000020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484365
25513	NC_017044	TTAA	2	8	1000032	1000039	50 %	50 %	0 %	0 %	383484365
25514	NC_017044	CGG	2	6	1000076	1000081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383484365
25515	NC_017044	TAC	2	6	1000082	1000087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484365
25516	NC_017044	AG	3	6	1000155	1000160	50 %	0 %	50 %	0 %	383484365
25517	NC_017044	GTT	2	6	1000168	1000173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484365
25518	NC_017044	GCT	2	6	1000177	1000182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484365
25519	NC_017044	TAT	2	6	1000190	1000195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484365
25520	NC_017044	T	6	6	1000267	1000272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_017044	TAT	2	6	1000294	1000299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_017044	AT	3	6	1000323	1000328	50 %	50 %	0 %	0 %	383484366
25523	NC_017044	GAA	2	6	1000372	1000377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484366
25524	NC_017044	GCA	2	6	1000388	1000393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484366
25525	NC_017044	GCA	2	6	1000396	1000401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484366
25526	NC_017044	GTG	2	6	1000478	1000483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484366
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25529	NC_017044	AGG	2	6	1000623	1000628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484366
25530	NC_017044	A	7	7	1000681	1000687	100 %	0 %	0 %	0 %	383484366
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25532	NC_017044	TTA	2	6	1000754	1000759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484366
25533	NC_017044	A	6	6	1000765	1000770	100 %	0 %	0 %	0 %	383484366
25534	NC_017044	AATC	2	8	1000775	1000782	50 %	25 %	0 %	25 %	383484366
25535	NC_017044	AGC	2	6	1000794	1000799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484366
25536	NC_017044	ATTA	2	8	1000821	1000828	50 %	50 %	0 %	0 %	383484366
25537	NC_017044	A	7	7	1000841	1000847	100 %	0 %	0 %	0 %	383484366
25538	NC_017044	ATT	2	6	1000864	1000869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484366
25539	NC_017044	TAC	2	6	1000913	1000918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484366
25540	NC_017044	CAT	2	6	1000927	1000932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484366
25541	NC_017044	GAT	2	6	1000939	1000944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484366
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25543	NC_017044	AATG	2	8	1000987	1000994	50 %	25 %	25 %	0 %	383484366
25544	NC_017044	TA	3	6	1001043	1001048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_017044	AGCA	2	8	1001116	1001123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25546	NC_017044	CTT	3	9	1001182	1001190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25547	NC_017044	A	6	6	1001257	1001262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25548	NC_017044	GCA	2	6	1001306	1001311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25549	NC_017044	AT	3	6	1001338	1001343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25550	NC_017044	TTA	2	6	1001405	1001410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25551	NC_017044	ATT	2	6	1001439	1001444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_017044	GTA	2	6	1001456	1001461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25553	NC_017044	TAC	2	6	1001470	1001475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25554	NC_017044	TAA	3	9	1001494	1001502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25555	NC_017044	ATGA	2	8	1001573	1001580	50 %	25 %	25 %	0 %	383484367
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25557	NC_017044	AT	3	6	1001651	1001656	50 %	50 %	0 %	0 %	383484367
25558	NC_017044	ATA	2	6	1001673	1001678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484367
25559	NC_017044	TCT	2	6	1001684	1001689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484367
25560	NC_017044	GAA	2	6	1001690	1001695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484367
25561	NC_017044	TAAT	2	8	1001760	1001767	50 %	50 %	0 %	0 %	383484367
25562	NC_017044	TTA	2	6	1001800	1001805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484367
25563	NC_017044	ATTG	2	8	1001808	1001815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25564	NC_017044	TA	3	6	1001913	1001918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25565	NC_017044	TGA	2	6	1001939	1001944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25568	NC_017044	TAA	2	6	1002003	1002008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25569	NC_017044	TA	3	6	1002069	1002074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25570	NC_017044	TCA	2	6	1002098	1002103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25571	NC_017044	AAC	2	6	1002152	1002157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25572	NC_017044	TAA	2	6	1002162	1002167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25573	NC_017044	ACA	2	6	1002190	1002195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484368
25574	NC_017044	TAC	2	6	1002203	1002208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484368
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25591	NC_017044	ACC	2	6	1002528	1002533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25592	NC_017044	GCGA	2	8	1002542	1002549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25593	NC_017044	A	6	6	1002573	1002578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25594	NC_017044	A	7	7	1002583	1002589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25595	NC_017044	T	6	6	1002605	1002610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25596	NC_017044	TGC	2	6	1002618	1002623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25597	NC_017044	TTAC	2	8	1002629	1002636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25598	NC_017044	A	6	6	1002658	1002663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25599	NC_017044	TGC	2	6	1002705	1002710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25600	NC_017044	TGCCC	2	10	1002779	1002788	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25601	NC_017044	AGC	2	6	1002844	1002849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25602	NC_017044	TTTG	2	8	1002851	1002858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25603	NC_017044	ATC	2	6	1002874	1002879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25604	NC_017044	ATCG	2	8	1002928	1002935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25605	NC_017044	GTAA	2	8	1003002	1003009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25606	NC_017044	ATA	2	6	1003045	1003050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25607	NC_017044	T	6	6	1003072	1003077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25608	NC_017044	TAA	2	6	1003090	1003095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25609	NC_017044	GAC	2	6	1003128	1003133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25610	NC_017044	GGA	2	6	1003164	1003169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25611	NC_017044	GGC	2	6	1003184	1003189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25612	NC_017044	T	6	6	1003262	1003267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25613	NC_017044	GCC	2	6	1003282	1003287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25614	NC_017044	ATC	2	6	1003295	1003300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25615	NC_017044	GGC	2	6	1003345	1003350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25616	NC_017044	ATC	2	6	1003438	1003443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25617	NC_017044	TAA	2	6	1003519	1003524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25618	NC_017044	TGT	2	6	1003534	1003539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25619	NC_017044	AAGTA	2	10	1003543	1003552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25620	NC_017044	GCCATG	2	12	1003565	1003576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25621	NC_017044	CTA	2	6	1003581	1003586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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