MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017044	TGA	2	6	980083	980088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484347
25003	NC_017044	A	7	7	980115	980121	100 %	0 %	0 %	0 %	383484347
25004	NC_017044	CTA	2	6	980130	980135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484347
25005	NC_017044	A	6	6	980196	980201	100 %	0 %	0 %	0 %	383484347
25006	NC_017044	AAT	2	6	980218	980223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484347
25007	NC_017044	CTTA	2	8	980245	980252	25 %	50 %	0 %	25 %	383484347
25008	NC_017044	ACTT	2	8	980263	980270	25 %	50 %	0 %	25 %	383484347
25009	NC_017044	AT	3	6	980301	980306	50 %	50 %	0 %	0 %	383484347
25010	NC_017044	ACTAA	2	10	980318	980327	60 %	20 %	0 %	20 %	383484347
25011	NC_017044	AAAG	2	8	980372	980379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_017044	GTAA	2	8	980390	980397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25013	NC_017044	ATT	2	6	980423	980428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25014	NC_017044	AT	4	8	980448	980455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25015	NC_017044	TCC	2	6	980489	980494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25016	NC_017044	CAT	2	6	980527	980532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25017	NC_017044	AGC	2	6	980563	980568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25018	NC_017044	ATA	3	9	980596	980604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_017044	TTAC	2	8	980628	980635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25020	NC_017044	CTTT	3	12	980683	980694	0 %	75 %	0 %	25 %	383484348
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25023	NC_017044	TTTA	2	8	980843	980850	25 %	75 %	0 %	0 %	383484348
25024	NC_017044	CGAT	2	8	980856	980863	25 %	25 %	25 %	25 %	383484348
25025	NC_017044	TAA	2	6	980875	980880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484348
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25030	NC_017044	ATT	2	6	981045	981050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484348
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25042	NC_017044	T	6	6	981567	981572	0 %	100 %	0 %	0 %	383484348
25043	NC_017044	TTTA	2	8	981647	981654	25 %	75 %	0 %	0 %	383484348
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25046	NC_017044	AATA	2	8	981744	981751	75 %	25 %	0 %	0 %	383484348
25047	NC_017044	AAT	2	6	981872	981877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484348
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25050	NC_017044	ATT	2	6	981945	981950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_017044	AT	3	6	981985	981990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_017044	CT	3	6	982006	982011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25053	NC_017044	GTAGA	2	10	982042	982051	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_017044	A	6	6	982100	982105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25055	NC_017044	TA	3	6	982134	982139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25056	NC_017044	A	6	6	982153	982158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25057	NC_017044	AT	3	6	982192	982197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25058	NC_017044	AAT	2	6	982210	982215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25059	NC_017044	AAT	2	6	982246	982251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25060	NC_017044	TAT	2	6	982288	982293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25061	NC_017044	TA	3	6	982303	982308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25062	NC_017044	TTA	2	6	982311	982316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25065	NC_017044	TAT	2	6	982402	982407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25066	NC_017044	ATTT	2	8	982410	982417	25 %	75 %	0 %	0 %	383484349
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25076	NC_017044	TACCT	2	10	982749	982758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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25101	NC_017044	T	6	6	983936	983941	0 %	100 %	0 %	0 %	383484350
25102	NC_017044	TA	3	6	983945	983950	50 %	50 %	0 %	0 %	383484350
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25111	NC_017044	TTTA	2	8	984200	984207	25 %	75 %	0 %	0 %	383484351
25112	NC_017044	AGG	2	6	984269	984274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484351
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25124	NC_017044	TGTT	2	8	984993	985000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25125	NC_017044	TAA	2	6	985023	985028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25126	NC_017044	AC	3	6	985078	985083	50 %	0 %	0 %	50 %	383484352
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