MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_017044	ACA	2	6	961400	961405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24503	NC_017044	CAG	2	6	961426	961431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484318
24504	NC_017044	T	6	6	961454	961459	0 %	100 %	0 %	0 %	383484318
24505	NC_017044	TCT	2	6	961463	961468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484318
24506	NC_017044	TTTA	2	8	961496	961503	25 %	75 %	0 %	0 %	383484318
24507	NC_017044	CAA	2	6	961561	961566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484318
24508	NC_017044	TCC	2	6	961607	961612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383484318
24509	NC_017044	CTT	2	6	961641	961646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484318
24510	NC_017044	AGC	2	6	961658	961663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484318
24511	NC_017044	TCA	2	6	961720	961725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484318
24512	NC_017044	CTT	2	6	961771	961776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484318
24513	NC_017044	AAAGC	2	10	961839	961848	60 %	0 %	20 %	20 %	383484318
24514	NC_017044	TAC	2	6	961862	961867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484318
24515	NC_017044	T	8	8	961917	961924	0 %	100 %	0 %	0 %	383484318
24516	NC_017044	TAC	2	6	961937	961942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24517	NC_017044	ATTTT	2	10	961959	961968	20 %	80 %	0 %	0 %	383484319
24518	NC_017044	CT	3	6	961969	961974	0 %	50 %	0 %	50 %	383484319
24519	NC_017044	ACA	2	6	961997	962002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484319
24520	NC_017044	T	7	7	962062	962068	0 %	100 %	0 %	0 %	383484319
24521	NC_017044	TTC	2	6	962074	962079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484319
24522	NC_017044	T	7	7	962116	962122	0 %	100 %	0 %	0 %	383484319
24523	NC_017044	T	7	7	962125	962131	0 %	100 %	0 %	0 %	383484319
24524	NC_017044	AGC	3	9	962152	962160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484319
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24527	NC_017044	AT	4	8	962197	962204	50 %	50 %	0 %	0 %	383484319
24528	NC_017044	CTT	3	9	962273	962281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484319
24529	NC_017044	T	6	6	962280	962285	0 %	100 %	0 %	0 %	383484319
24530	NC_017044	TTAGC	2	10	962292	962301	20 %	40 %	20 %	20 %	383484319
24531	NC_017044	AATTT	2	10	962323	962332	40 %	60 %	0 %	0 %	383484320
24532	NC_017044	CTT	2	6	962340	962345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484320
24533	NC_017044	TTCCTT	2	12	962376	962387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484320
24534	NC_017044	GGT	2	6	962399	962404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484320
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24537	NC_017044	TAT	2	6	962523	962528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484320
24538	NC_017044	AGCA	2	8	962536	962543	50 %	0 %	25 %	25 %	383484320
24539	NC_017044	TTAAAT	2	12	962544	962555	50 %	50 %	0 %	0 %	383484320
24540	NC_017044	CTT	2	6	962616	962621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484320
24541	NC_017044	CTT	2	6	962651	962656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484320
24542	NC_017044	T	6	6	962859	962864	0 %	100 %	0 %	0 %	383484320
24543	NC_017044	CGC	2	6	962891	962896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383484321
24544	NC_017044	AGAA	2	8	962946	962953	75 %	0 %	25 %	0 %	383484321
24545	NC_017044	TA	4	8	962954	962961	50 %	50 %	0 %	0 %	383484321
24546	NC_017044	ATT	2	6	962967	962972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484321
24547	NC_017044	ATA	2	6	962973	962978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484321
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24549	NC_017044	T	7	7	963103	963109	0 %	100 %	0 %	0 %	383484321
24550	NC_017044	AGT	2	6	963111	963116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484321
24551	NC_017044	TA	3	6	963117	963122	50 %	50 %	0 %	0 %	383484321
24552	NC_017044	TA	3	6	963129	963134	50 %	50 %	0 %	0 %	383484321
24553	NC_017044	CTT	2	6	963137	963142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484321
24554	NC_017044	TAG	2	6	963417	963422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484322
24555	NC_017044	ATG	2	6	963423	963428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484322
24556	NC_017044	TAT	2	6	963525	963530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484322
24557	NC_017044	T	9	9	963544	963552	0 %	100 %	0 %	0 %	383484322
24558	NC_017044	T	6	6	963566	963571	0 %	100 %	0 %	0 %	383484322
24559	NC_017044	ACTT	2	8	963577	963584	25 %	50 %	0 %	25 %	383484322
24560	NC_017044	TA	4	8	963592	963599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24561	NC_017044	ATTA	2	8	963608	963615	50 %	50 %	0 %	0 %	383484323
24562	NC_017044	TAAT	2	8	963721	963728	50 %	50 %	0 %	0 %	383484323
24563	NC_017044	CAA	2	6	963830	963835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484323
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24565	NC_017044	A	6	6	963850	963855	100 %	0 %	0 %	0 %	383484323
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24570	NC_017044	ATT	2	6	964147	964152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484323
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24575	NC_017044	TTA	2	6	964300	964305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484324
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24577	NC_017044	TTACT	2	10	964369	964378	20 %	60 %	0 %	20 %	383484324
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24584	NC_017044	TTTAA	2	10	964464	964473	40 %	60 %	0 %	0 %	383484324
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24594	NC_017044	AAATA	2	10	964875	964884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24595	NC_017044	A	6	6	964913	964918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24596	NC_017044	CTT	2	6	964995	965000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484326
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24600	NC_017044	T	6	6	965053	965058	0 %	100 %	0 %	0 %	383484326
24601	NC_017044	CTTT	2	8	965077	965084	0 %	75 %	0 %	25 %	383484326
24602	NC_017044	CTA	2	6	965232	965237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484327
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24604	NC_017044	TTG	2	6	965261	965266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484327
24605	NC_017044	TTAAA	2	10	965272	965281	60 %	40 %	0 %	0 %	383484327
24606	NC_017044	T	7	7	965288	965294	0 %	100 %	0 %	0 %	383484327
24607	NC_017044	ACTT	2	8	965341	965348	25 %	50 %	0 %	25 %	383484327
24608	NC_017044	TAA	2	6	965351	965356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484327
24609	NC_017044	TCAT	2	8	965364	965371	25 %	50 %	0 %	25 %	383484327
24610	NC_017044	TCT	2	6	965443	965448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484328
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24613	NC_017044	ACCTTT	2	12	965511	965522	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484328
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24617	NC_017044	ACCCT	2	10	965725	965734	20 %	20 %	0 %	60 %	383484328
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