MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_017044	CTT	2	6	820568	820573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21003	NC_017044	A	7	7	820585	820591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21004	NC_017044	TTG	2	6	820595	820600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21005	NC_017044	TTACT	2	10	820627	820636	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21006	NC_017044	TA	4	8	820647	820654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_017044	ATAA	2	8	820667	820674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_017044	TAA	2	6	820733	820738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_017044	TGC	2	6	820752	820757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21011	NC_017044	TAAC	2	8	820793	820800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21012	NC_017044	AG	3	6	820882	820887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_017044	A	8	8	820902	820909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_017044	AT	5	10	820921	820930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21015	NC_017044	TGG	2	6	820965	820970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_017044	TCA	2	6	821009	821014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_017044	TA	3	6	821040	821045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_017044	TAA	2	6	821072	821077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_017044	ACT	2	6	821099	821104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21021	NC_017044	ATA	2	6	821137	821142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_017044	A	6	6	821154	821159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_017044	CTATC	2	10	821186	821195	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21024	NC_017044	AAT	2	6	821280	821285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_017044	ATT	2	6	821298	821303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21032	NC_017044	TTA	2	6	821616	821621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21039	NC_017044	AAG	2	6	821898	821903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21040	NC_017044	GAAA	2	8	821945	821952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_017044	AAG	2	6	822015	822020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21043	NC_017044	ATA	2	6	822051	822056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_017044	AAATTT	2	12	822148	822159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21048	NC_017044	CAT	2	6	822344	822349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21051	NC_017044	TA	3	6	822512	822517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21056	NC_017044	ATTT	2	8	822633	822640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_017044	CAAG	3	12	822663	822674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21058	NC_017044	CAAA	2	8	822694	822701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21059	NC_017044	TAAC	2	8	822747	822754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21060	NC_017044	TGA	2	6	822832	822837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_017044	TAG	2	6	822873	822878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21064	NC_017044	TAG	2	6	823132	823137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_017044	T	7	7	823154	823160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_017044	TAC	2	6	823180	823185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21067	NC_017044	CAG	2	6	823260	823265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21068	NC_017044	GAA	2	6	823287	823292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21069	NC_017044	GCAA	2	8	823301	823308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21073	NC_017044	CTTAA	2	10	823454	823463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21074	NC_017044	A	6	6	823462	823467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21075	NC_017044	ATTA	2	8	823469	823476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21076	NC_017044	TAG	2	6	823488	823493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21078	NC_017044	AT	3	6	823542	823547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21089	NC_017044	TAC	2	6	824086	824091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21097	NC_017044	TTA	2	6	824502	824507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21102	NC_017044	ATA	2	6	824774	824779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_017044	AGT	2	6	824788	824793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21106	NC_017044	TTA	2	6	824868	824873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21108	NC_017044	GCTA	2	8	824956	824963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21109	NC_017044	TAA	2	6	825021	825026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_017044	TAT	2	6	825048	825053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_017044	A	7	7	825095	825101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21112	NC_017044	ATTT	2	8	825202	825209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_017044	TATGC	2	10	825215	825224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21114	NC_017044	TTA	2	6	825383	825388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21115	NC_017044	GAT	2	6	825451	825456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21116	NC_017044	TTTA	2	8	825467	825474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_017044	AGCT	2	8	825477	825484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21118	NC_017044	TGC	2	6	825491	825496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21119	NC_017044	ATGA	2	8	825499	825506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_017044	ATT	2	6	825519	825524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_017044	TAAA	2	8	825539	825546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_017044	TAA	2	6	825584	825589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21123	NC_017044	GCTAT	2	10	825713	825722	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21124	NC_017044	ATAAA	2	10	825746	825755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21125	NC_017044	CTA	2	6	825770	825775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21127	NC_017044	TGA	2	6	825824	825829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21128	NC_017044	A	7	7	825966	825972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_017044	ATA	2	6	825986	825991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21130	NC_017044	ATA	2	6	826019	826024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21131	NC_017044	GTA	2	6	826052	826057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21257	NC_017044	T	6	6	831323	831328	0 %	100 %	0 %	0 %	383484178
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