MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017044	CTAG	2	8	764509	764516	25 %	25 %	25 %	25 %	383484102
19503	NC_017044	TAT	2	6	764567	764572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484102
19504	NC_017044	AT	3	6	764606	764611	50 %	50 %	0 %	0 %	383484102
19505	NC_017044	T	7	7	764626	764632	0 %	100 %	0 %	0 %	383484102
19506	NC_017044	CGT	2	6	764635	764640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484102
19507	NC_017044	CAG	2	6	764669	764674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484102
19508	NC_017044	ATC	2	6	764711	764716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484102
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19510	NC_017044	ATT	4	12	764794	764805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484102
19511	NC_017044	A	6	6	764906	764911	100 %	0 %	0 %	0 %	383484103
19512	NC_017044	AGA	2	6	764916	764921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484103
19513	NC_017044	TTA	2	6	764988	764993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484103
19514	NC_017044	AGA	2	6	765024	765029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484103
19515	NC_017044	AAT	2	6	765039	765044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484103
19516	NC_017044	TAA	2	6	765078	765083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484103
19517	NC_017044	GCT	2	6	765084	765089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484103
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19519	NC_017044	CTC	2	6	765122	765127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383484103
19520	NC_017044	ATTT	2	8	765152	765159	25 %	75 %	0 %	0 %	383484103
19521	NC_017044	GCA	2	6	765196	765201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484103
19522	NC_017044	AGCTA	2	10	765224	765233	40 %	20 %	20 %	20 %	383484103
19523	NC_017044	TGA	2	6	765234	765239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484103
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19526	NC_017044	ATAA	2	8	765376	765383	75 %	25 %	0 %	0 %	383484103
19527	NC_017044	AAT	2	6	765397	765402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484103
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19532	NC_017044	TGA	2	6	765501	765506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484103
19533	NC_017044	ATTTT	2	10	765587	765596	20 %	80 %	0 %	0 %	383484103
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19535	NC_017044	ACAA	2	8	765683	765690	75 %	0 %	0 %	25 %	383484103
19536	NC_017044	ATA	2	6	765706	765711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484103
19537	NC_017044	TAA	2	6	765720	765725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484103
19538	NC_017044	A	6	6	765734	765739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_017044	TAT	2	6	765765	765770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_017044	A	7	7	765777	765783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_017044	TAC	2	6	765820	765825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484104
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19544	NC_017044	T	7	7	766020	766026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_017044	TAA	2	6	766062	766067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_017044	TTA	2	6	766105	766110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484105
19547	NC_017044	TCAA	2	8	766148	766155	50 %	25 %	0 %	25 %	383484105
19548	NC_017044	A	6	6	766154	766159	100 %	0 %	0 %	0 %	383484105
19549	NC_017044	AAAC	2	8	766181	766188	75 %	0 %	0 %	25 %	383484105
19550	NC_017044	CGG	2	6	766191	766196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383484105
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19552	NC_017044	TTA	3	9	766211	766219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484105
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19555	NC_017044	A	7	7	766309	766315	100 %	0 %	0 %	0 %	383484105
19556	NC_017044	ATT	2	6	766318	766323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484105
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19558	NC_017044	GAA	2	6	766417	766422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484105
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19560	NC_017044	AAAGT	2	10	766480	766489	60 %	20 %	20 %	0 %	383484105
19561	NC_017044	TAA	2	6	766516	766521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484105
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19563	NC_017044	ATCTT	2	10	766568	766577	20 %	60 %	0 %	20 %	383484105
19564	NC_017044	GCGA	2	8	766652	766659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19565	NC_017044	TAA	2	6	766734	766739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_017044	CGC	2	6	766823	766828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19571	NC_017044	TAC	2	6	767146	767151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484106
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19576	NC_017044	CCTG	2	8	767304	767311	0 %	25 %	25 %	50 %	383484106
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19590	NC_017044	TG	3	6	768015	768020	0 %	50 %	50 %	0 %	383484106
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19601	NC_017044	TTG	2	6	768322	768327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_017044	AGC	2	6	768341	768346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19603	NC_017044	TTAC	2	8	768396	768403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19604	NC_017044	ATG	2	6	768418	768423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_017044	ACC	2	6	768441	768446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19606	NC_017044	AAC	2	6	768458	768463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484107
19607	NC_017044	AATTA	2	10	768505	768514	60 %	40 %	0 %	0 %	383484107
19608	NC_017044	GTA	2	6	768546	768551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484107
19609	NC_017044	T	6	6	768617	768622	0 %	100 %	0 %	0 %	383484107
19610	NC_017044	TC	3	6	768626	768631	0 %	50 %	0 %	50 %	383484107
19611	NC_017044	CAA	2	6	768678	768683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484107
19612	NC_017044	CTTG	2	8	768698	768705	0 %	50 %	25 %	25 %	383484107
19613	NC_017044	AAAAT	2	10	768708	768717	80 %	20 %	0 %	0 %	383484107
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19621	NC_017044	TTA	2	6	769146	769151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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