MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017044	ATA	2	6	626604	626609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483979
16003	NC_017044	A	7	7	626688	626694	100 %	0 %	0 %	0 %	383483979
16004	NC_017044	GTA	2	6	626696	626701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483979
16005	NC_017044	AT	3	6	626702	626707	50 %	50 %	0 %	0 %	383483979
16006	NC_017044	TAT	2	6	626726	626731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483979
16007	NC_017044	TAT	2	6	626768	626773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483979
16008	NC_017044	TTA	2	6	626804	626809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483979
16009	NC_017044	AT	3	6	626895	626900	50 %	50 %	0 %	0 %	383483979
16010	NC_017044	CGC	2	6	626951	626956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483979
16011	NC_017044	TGA	2	6	626999	627004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483979
16012	NC_017044	A	6	6	627008	627013	100 %	0 %	0 %	0 %	383483979
16013	NC_017044	GTTT	2	8	627053	627060	0 %	75 %	25 %	0 %	383483979
16014	NC_017044	CCTGCT	2	12	627073	627084	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383483979
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16016	NC_017044	TAA	2	6	627107	627112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483979
16017	NC_017044	T	6	6	627118	627123	0 %	100 %	0 %	0 %	383483979
16018	NC_017044	A	7	7	627138	627144	100 %	0 %	0 %	0 %	383483979
16019	NC_017044	TTTA	2	8	627153	627160	25 %	75 %	0 %	0 %	383483979
16020	NC_017044	AT	3	6	627186	627191	50 %	50 %	0 %	0 %	383483979
16021	NC_017044	GCT	2	6	627205	627210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483979
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16023	NC_017044	CTG	2	6	627239	627244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483979
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16028	NC_017044	ACCGG	2	10	627385	627394	20 %	0 %	40 %	40 %	383483979
16029	NC_017044	TAT	2	6	627399	627404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483979
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16032	NC_017044	AAT	2	6	627473	627478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_017044	TGC	2	6	627579	627584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483980
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16036	NC_017044	TTTGT	2	10	627633	627642	0 %	80 %	20 %	0 %	383483980
16037	NC_017044	AAT	2	6	627652	627657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_017044	T	6	6	627662	627667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_017044	TA	3	6	627749	627754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_017044	A	6	6	627804	627809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_017044	ATC	2	6	627852	627857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_017044	CAG	2	6	627925	627930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_017044	GGT	2	6	627962	627967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017044	GAA	2	6	627973	627978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017044	TTA	2	6	627993	627998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017044	ATG	2	6	628017	628022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_017044	ATA	2	6	628041	628046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_017044	ATT	2	6	628050	628055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_017044	ATT	2	6	628077	628082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_017044	TATAGT	2	12	628098	628109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_017044	A	6	6	628166	628171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017044	AAAT	2	8	628175	628182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_017044	TGG	2	6	628236	628241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_017044	ATA	2	6	628249	628254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_017044	TCT	2	6	628269	628274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16058	NC_017044	TTA	2	6	628565	628570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_017044	TA	4	8	628627	628634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_017044	ATGA	2	8	628682	628689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16062	NC_017044	A	6	6	628723	628728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16064	NC_017044	TAT	2	6	628770	628775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_017044	ATA	2	6	628793	628798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16068	NC_017044	TA	3	6	628907	628912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16074	NC_017044	TA	3	6	629149	629154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_017044	AAAT	2	8	629211	629218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_017044	ATGGG	2	10	629263	629272	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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16092	NC_017044	TG	3	6	629941	629946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16096	NC_017044	TAT	2	6	630183	630188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16100	NC_017044	TGC	3	9	630427	630435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483981
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16102	NC_017044	A	6	6	630485	630490	100 %	0 %	0 %	0 %	383483981
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16106	NC_017044	TAT	2	6	630596	630601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_017044	TAAA	2	8	630677	630684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16119	NC_017044	GAA	2	6	630947	630952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483982
16120	NC_017044	A	6	6	631014	631019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_017044	TA	3	6	631065	631070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_017044	GAT	2	6	631119	631124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483983
16123	NC_017044	AG	3	6	631218	631223	50 %	0 %	50 %	0 %	383483983
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16126	NC_017044	AC	3	6	631264	631269	50 %	0 %	0 %	50 %	383483983
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