MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017044	TCA	2	6	587424	587429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483937
15003	NC_017044	AAT	2	6	587430	587435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483937
15004	NC_017044	ACT	2	6	587436	587441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483937
15005	NC_017044	CCA	2	6	587502	587507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483937
15006	NC_017044	TAT	2	6	587579	587584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483937
15007	NC_017044	TGA	2	6	587624	587629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483937
15008	NC_017044	ATG	2	6	587752	587757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483937
15009	NC_017044	AGT	2	6	587759	587764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483937
15010	NC_017044	GGTGG	3	15	587784	587798	0 %	20 %	80 %	0 %	383483937
15011	NC_017044	AT	3	6	587827	587832	50 %	50 %	0 %	0 %	383483937
15012	NC_017044	TAC	2	6	587899	587904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483937
15013	NC_017044	TA	3	6	587908	587913	50 %	50 %	0 %	0 %	383483937
15014	NC_017044	ATT	2	6	587918	587923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483937
15015	NC_017044	TCCGAT	2	12	587936	587947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383483937
15016	NC_017044	TGC	2	6	587954	587959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483937
15017	NC_017044	ATT	2	6	587962	587967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483937
15018	NC_017044	AAGC	2	8	588007	588014	50 %	0 %	25 %	25 %	383483937
15019	NC_017044	A	6	6	588024	588029	100 %	0 %	0 %	0 %	383483937
15020	NC_017044	CAT	2	6	588041	588046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483937
15021	NC_017044	CTAT	2	8	588054	588061	25 %	50 %	0 %	25 %	383483937
15022	NC_017044	ATT	2	6	588117	588122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483938
15023	NC_017044	GAA	2	6	588128	588133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483938
15024	NC_017044	GTATT	2	10	588147	588156	20 %	60 %	20 %	0 %	383483938
15025	NC_017044	AGA	2	6	588202	588207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483938
15026	NC_017044	ATT	3	9	588313	588321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483938
15027	NC_017044	TAGAAT	2	12	588352	588363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383483938
15028	NC_017044	TAG	2	6	588378	588383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483938
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15030	NC_017044	A	8	8	588404	588411	100 %	0 %	0 %	0 %	383483938
15031	NC_017044	AG	3	6	588464	588469	50 %	0 %	50 %	0 %	383483938
15032	NC_017044	TAA	2	6	588510	588515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483938
15033	NC_017044	A	6	6	588646	588651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_017044	GCA	2	6	588661	588666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483939
15035	NC_017044	TAT	2	6	588667	588672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483939
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15037	NC_017044	ATT	2	6	588828	588833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483939
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15039	NC_017044	TAA	2	6	588913	588918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483939
15040	NC_017044	TA	3	6	588920	588925	50 %	50 %	0 %	0 %	383483939
15041	NC_017044	ATA	2	6	588930	588935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483939
15042	NC_017044	AAT	2	6	588997	589002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483939
15043	NC_017044	A	6	6	589034	589039	100 %	0 %	0 %	0 %	383483939
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15045	NC_017044	AAAGTT	2	12	589079	589090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383483939
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15052	NC_017044	TTG	2	6	589464	589469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_017044	TTG	2	6	589512	589517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_017044	ATC	2	6	589530	589535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_017044	GAG	2	6	589541	589546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017044	GAC	2	6	589619	589624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_017044	CAA	2	6	589639	589644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_017044	TAG	2	6	589649	589654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_017044	TTTA	2	8	589689	589696	25 %	75 %	0 %	0 %	383483940
15060	NC_017044	TTC	2	6	589793	589798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483940
15061	NC_017044	AAT	2	6	589803	589808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483940
15062	NC_017044	TCT	3	9	589912	589920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483940
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15068	NC_017044	CTG	2	6	590060	590065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483940
15069	NC_017044	ATA	2	6	590149	590154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483940
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15071	NC_017044	TAC	3	9	590280	590288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483940
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15078	NC_017044	TTTTA	2	10	590581	590590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_017044	T	6	6	590631	590636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_017044	T	7	7	590639	590645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_017044	ACA	2	6	590699	590704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_017044	TATTT	2	10	590755	590764	20 %	80 %	0 %	0 %	383483941
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15102	NC_017044	ATACT	2	10	591558	591567	40 %	40 %	0 %	20 %	383483941
15103	NC_017044	ATA	2	6	591571	591576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483941
15104	NC_017044	T	6	6	591685	591690	0 %	100 %	0 %	0 %	383483941
15105	NC_017044	CTT	3	9	591693	591701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483941
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15108	NC_017044	ATTTA	2	10	591781	591790	40 %	60 %	0 %	0 %	383483941
15109	NC_017044	AAC	2	6	591823	591828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483941
15110	NC_017044	ATTT	2	8	591906	591913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017044	TTA	2	6	591988	591993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483942
15112	NC_017044	AAT	2	6	592017	592022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483942
15113	NC_017044	TA	3	6	592023	592028	50 %	50 %	0 %	0 %	383483942
15114	NC_017044	AT	3	6	592054	592059	50 %	50 %	0 %	0 %	383483942
15115	NC_017044	ATT	2	6	592075	592080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483942
15116	NC_017044	ATTA	2	8	592122	592129	50 %	50 %	0 %	0 %	383483942
15117	NC_017044	ATTT	2	8	592157	592164	25 %	75 %	0 %	0 %	383483942
15118	NC_017044	ATG	2	6	592199	592204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483942
15119	NC_017044	TTA	2	6	592216	592221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483942
15120	NC_017044	GCT	2	6	592249	592254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483942
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15497	NC_017044	CAC	2	6	606255	606260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483959
15498	NC_017044	GCA	2	6	606263	606268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483959
15499	NC_017044	TA	4	8	606352	606359	50 %	50 %	0 %	0 %	383483959
15500	NC_017044	TAA	2	6	606398	606403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483959

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