MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017044	TTA	2	6	529534	529539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483878
13503	NC_017044	TA	3	6	529570	529575	50 %	50 %	0 %	0 %	383483878
13504	NC_017044	AT	3	6	529634	529639	50 %	50 %	0 %	0 %	383483878
13505	NC_017044	ATT	2	6	529665	529670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483878
13506	NC_017044	TTA	2	6	529716	529721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483878
13507	NC_017044	GAAG	2	8	529743	529750	50 %	0 %	50 %	0 %	383483878
13508	NC_017044	TAAT	2	8	529756	529763	50 %	50 %	0 %	0 %	383483878
13509	NC_017044	ATTT	2	8	529834	529841	25 %	75 %	0 %	0 %	383483878
13510	NC_017044	AGA	2	6	529892	529897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483878
13511	NC_017044	AAT	2	6	529898	529903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483878
13512	NC_017044	AGC	2	6	529907	529912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483878
13513	NC_017044	TAT	2	6	529937	529942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483878
13514	NC_017044	G	6	6	529974	529979	0 %	0 %	100 %	0 %	383483878
13515	NC_017044	GAC	2	6	529985	529990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483878
13516	NC_017044	GTCAGC	2	12	530002	530013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383483878
13517	NC_017044	CAA	2	6	530071	530076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483878
13518	NC_017044	ATT	2	6	530151	530156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483878
13519	NC_017044	ATA	2	6	530188	530193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483878
13520	NC_017044	TAA	2	6	530279	530284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483878
13521	NC_017044	TATT	2	8	530327	530334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017044	ATT	3	9	530336	530344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017044	A	6	6	530406	530411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017044	T	7	7	530421	530427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_017044	ATT	2	6	530428	530433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_017044	TCA	2	6	530445	530450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13528	NC_017044	ATT	2	6	530532	530537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483879
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13530	NC_017044	T	6	6	530585	530590	0 %	100 %	0 %	0 %	383483879
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13533	NC_017044	TAT	2	6	530756	530761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483879
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13536	NC_017044	TAT	2	6	530846	530851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483879
13537	NC_017044	TGCGT	2	10	530889	530898	0 %	40 %	40 %	20 %	383483879
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13540	NC_017044	AACT	2	8	531026	531033	50 %	25 %	0 %	25 %	383483879
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13550	NC_017044	AAT	2	6	531300	531305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483879
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13555	NC_017044	ATTT	2	8	531432	531439	25 %	75 %	0 %	0 %	383483879
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13569	NC_017044	TCATTG	2	12	531757	531768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13570	NC_017044	ATA	2	6	531803	531808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_017044	A	7	7	531808	531814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13574	NC_017044	TATT	2	8	531909	531916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_017044	TTA	2	6	531936	531941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483880
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13601	NC_017044	CAA	2	6	532967	532972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_017044	CA	3	6	533001	533006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13603	NC_017044	TTG	2	6	533078	533083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483881
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13606	NC_017044	T	7	7	533143	533149	0 %	100 %	0 %	0 %	383483881
13607	NC_017044	T	6	6	533159	533164	0 %	100 %	0 %	0 %	383483881
13608	NC_017044	TAT	2	6	533263	533268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483881
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13614	NC_017044	TTTTA	2	10	533515	533524	20 %	80 %	0 %	0 %	383483881
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13994	NC_017044	TCT	2	6	547587	547592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483894
13995	NC_017044	AATT	2	8	547664	547671	50 %	50 %	0 %	0 %	383483894
13996	NC_017044	ATT	2	6	547682	547687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483894
13997	NC_017044	GAT	2	6	547782	547787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483894
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13999	NC_017044	AT	3	6	547813	547818	50 %	50 %	0 %	0 %	383483894
14000	NC_017044	T	8	8	547831	547838	0 %	100 %	0 %	0 %	383483894

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