MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017044	ATTT	2	8	218527	218534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017044	T	7	7	218532	218538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017044	GAT	2	6	218561	218566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483550
5504	NC_017044	TGT	2	6	218583	218588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483550
5505	NC_017044	ATT	2	6	218628	218633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483550
5506	NC_017044	GTTTCA	2	12	218659	218670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383483550
5507	NC_017044	TA	3	6	218681	218686	50 %	50 %	0 %	0 %	383483550
5508	NC_017044	ATT	2	6	218688	218693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483550
5509	NC_017044	T	6	6	218692	218697	0 %	100 %	0 %	0 %	383483550
5510	NC_017044	TGC	2	6	218730	218735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483550
5511	NC_017044	ATC	2	6	218742	218747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483550
5512	NC_017044	TTC	2	6	218820	218825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483550
5513	NC_017044	TTTG	2	8	218870	218877	0 %	75 %	25 %	0 %	383483550
5514	NC_017044	TA	3	6	218885	218890	50 %	50 %	0 %	0 %	383483550
5515	NC_017044	ATG	2	6	218894	218899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483550
5516	NC_017044	TTC	2	6	218904	218909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483550
5517	NC_017044	GTT	2	6	218923	218928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483550
5518	NC_017044	T	7	7	218927	218933	0 %	100 %	0 %	0 %	383483550
5519	NC_017044	TTG	2	6	218948	218953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483550
5520	NC_017044	TTA	2	6	218968	218973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483550
5521	NC_017044	TAA	2	6	218981	218986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483550
5522	NC_017044	TA	3	6	219002	219007	50 %	50 %	0 %	0 %	383483550
5523	NC_017044	TAGC	2	8	219020	219027	25 %	25 %	25 %	25 %	383483550
5524	NC_017044	GTT	2	6	219040	219045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483550
5525	NC_017044	TAAA	2	8	219056	219063	75 %	25 %	0 %	0 %	383483550
5526	NC_017044	T	7	7	219064	219070	0 %	100 %	0 %	0 %	383483550
5527	NC_017044	TTA	2	6	219124	219129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483550
5528	NC_017044	CTA	2	6	219155	219160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483550
5529	NC_017044	GCC	2	6	219234	219239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483550
5530	NC_017044	ATT	2	6	219250	219255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483550
5531	NC_017044	AGTT	2	8	219279	219286	25 %	50 %	25 %	0 %	383483550
5532	NC_017044	TAG	2	6	219287	219292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483550
5533	NC_017044	AGT	2	6	219296	219301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483550
5534	NC_017044	GTC	2	6	219318	219323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483550
5535	NC_017044	TAA	2	6	219324	219329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483550
5536	NC_017044	AT	4	8	219333	219340	50 %	50 %	0 %	0 %	383483550
5537	NC_017044	CTT	2	6	219371	219376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483550
5538	NC_017044	TTTA	2	8	219384	219391	25 %	75 %	0 %	0 %	383483550
5539	NC_017044	CAGT	2	8	219446	219453	25 %	25 %	25 %	25 %	383483550
5540	NC_017044	ATC	2	6	219519	219524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483550
5541	NC_017044	TA	3	6	219549	219554	50 %	50 %	0 %	0 %	383483550
5542	NC_017044	T	6	6	219641	219646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017044	A	6	6	219649	219654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017044	GTCAA	2	10	219656	219665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5545	NC_017044	TAT	2	6	219675	219680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017044	TAAA	2	8	219681	219688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017044	TA	3	6	219713	219718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017044	ATT	2	6	219775	219780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483551
5549	NC_017044	TAA	2	6	219802	219807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483551
5550	NC_017044	TTAC	2	8	219813	219820	25 %	50 %	0 %	25 %	383483551
5551	NC_017044	AAAAGC	2	12	219835	219846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383483551
5552	NC_017044	T	6	6	219884	219889	0 %	100 %	0 %	0 %	383483551
5553	NC_017044	AGTA	2	8	219895	219902	50 %	25 %	25 %	0 %	383483551
5554	NC_017044	GTTT	2	8	219903	219910	0 %	75 %	25 %	0 %	383483551
5555	NC_017044	TAG	2	6	219916	219921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483551
5556	NC_017044	TAA	2	6	219942	219947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483551
5557	NC_017044	AT	3	6	220132	220137	50 %	50 %	0 %	0 %	383483551
5558	NC_017044	ATA	2	6	220157	220162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483551
5559	NC_017044	TGG	2	6	220228	220233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483551
5560	NC_017044	TAG	2	6	220242	220247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483551
5561	NC_017044	GT	3	6	220260	220265	0 %	50 %	50 %	0 %	383483551
5562	NC_017044	AAAT	2	8	220303	220310	75 %	25 %	0 %	0 %	383483551
5563	NC_017044	TTC	2	6	220329	220334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483551
5564	NC_017044	TAT	2	6	220348	220353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483551
5565	NC_017044	CAG	2	6	220355	220360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483551
5566	NC_017044	AG	3	6	220425	220430	50 %	0 %	50 %	0 %	383483551
5567	NC_017044	AAGT	2	8	220477	220484	50 %	25 %	25 %	0 %	383483551
5568	NC_017044	AGT	2	6	220519	220524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483551
5569	NC_017044	AAAT	2	8	220557	220564	75 %	25 %	0 %	0 %	383483551
5570	NC_017044	ATT	2	6	220579	220584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483551
5571	NC_017044	GAA	2	6	220610	220615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483551
5572	NC_017044	AAG	2	6	220617	220622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483551
5573	NC_017044	AT	4	8	220699	220706	50 %	50 %	0 %	0 %	383483551
5574	NC_017044	T	6	6	220775	220780	0 %	100 %	0 %	0 %	383483552
5575	NC_017044	TAA	2	6	220784	220789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483552
5576	NC_017044	T	6	6	220823	220828	0 %	100 %	0 %	0 %	383483552
5577	NC_017044	CTG	2	6	220916	220921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483552
5578	NC_017044	AT	3	6	220992	220997	50 %	50 %	0 %	0 %	383483552
5579	NC_017044	CAT	2	6	221000	221005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483552
5580	NC_017044	ATT	2	6	221088	221093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483552
5581	NC_017044	AAT	2	6	221100	221105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483552
5582	NC_017044	GT	3	6	221200	221205	0 %	50 %	50 %	0 %	383483552
5583	NC_017044	AAGGC	2	10	221208	221217	40 %	0 %	40 %	20 %	383483552
5584	NC_017044	TGC	2	6	221244	221249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483553
5585	NC_017044	TTTCTT	2	12	221293	221304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383483553
5586	NC_017044	TTTTCT	2	12	221313	221324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383483553
5587	NC_017044	AT	3	6	221326	221331	50 %	50 %	0 %	0 %	383483553
5588	NC_017044	TGC	2	6	221422	221427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483553
5589	NC_017044	CT	3	6	221450	221455	0 %	50 %	0 %	50 %	383483553
5590	NC_017044	TAT	2	6	221479	221484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483553
5591	NC_017044	T	6	6	221486	221491	0 %	100 %	0 %	0 %	383483553
5592	NC_017044	AT	3	6	221509	221514	50 %	50 %	0 %	0 %	383483554
5593	NC_017044	ATC	2	6	221580	221585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483554
5594	NC_017044	ATG	2	6	221625	221630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483554
5595	NC_017044	A	6	6	221725	221730	100 %	0 %	0 %	0 %	383483554
5596	NC_017044	TAA	2	6	221769	221774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483554
5597	NC_017044	AATA	2	8	221797	221804	75 %	25 %	0 %	0 %	383483554
5598	NC_017044	ATT	2	6	221831	221836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483554
5599	NC_017044	GGT	2	6	221850	221855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483554
5600	NC_017044	A	6	6	221974	221979	100 %	0 %	0 %	0 %	383483554
5601	NC_017044	AAT	3	9	221981	221989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483554
5602	NC_017044	AGA	2	6	222019	222024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483554
5603	NC_017044	TCA	3	9	222044	222052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483554
5604	NC_017044	TAT	2	6	222073	222078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483554
5605	NC_017044	GGAG	2	8	222088	222095	25 %	0 %	75 %	0 %	383483554
5606	NC_017044	ATG	2	6	222105	222110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483554
5607	NC_017044	CTT	2	6	222119	222124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483554
5608	NC_017044	AT	3	6	222165	222170	50 %	50 %	0 %	0 %	383483554
5609	NC_017044	CAG	2	6	222183	222188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483554
5610	NC_017044	GTT	2	6	222214	222219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483554
5611	NC_017044	GCT	2	6	222309	222314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017044	TA	3	6	222417	222422	50 %	50 %	0 %	0 %	383483555
5613	NC_017044	AAT	2	6	222435	222440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483555
5614	NC_017044	AAATTA	2	12	222469	222480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483555
5615	NC_017044	AAT	2	6	222481	222486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483555
5616	NC_017044	AGA	2	6	222516	222521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483555
5617	NC_017044	TAA	2	6	222522	222527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483555
5618	NC_017044	AGT	2	6	222534	222539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483555
5619	NC_017044	ATT	2	6	222549	222554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483555
5620	NC_017044	TATT	2	8	222560	222567	25 %	75 %	0 %	0 %	383483555
5621	NC_017044	TTG	2	6	222606	222611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017044	TG	3	6	222610	222615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017044	TAT	2	6	222681	222686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017044	CAA	2	6	222752	222757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_017044	AAT	2	6	222769	222774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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