MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_017043	TGC	2	6	1278331	1278336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32502	NC_017043	ATA	2	6	1278420	1278425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_017043	AGC	2	6	1278448	1278453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32504	NC_017043	A	6	6	1278479	1278484	100 %	0 %	0 %	0 %	383483339
32505	NC_017043	CTT	2	6	1278501	1278506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483339
32506	NC_017043	T	7	7	1278557	1278563	0 %	100 %	0 %	0 %	383483339
32507	NC_017043	ATA	2	6	1278626	1278631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483339
32508	NC_017043	TA	3	6	1278643	1278648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32509	NC_017043	TCA	2	6	1278649	1278654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32510	NC_017043	AATT	2	8	1278725	1278732	50 %	50 %	0 %	0 %	383483340
32511	NC_017043	TTGTTA	2	12	1278763	1278774	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383483340
32512	NC_017043	A	6	6	1278818	1278823	100 %	0 %	0 %	0 %	383483340
32513	NC_017043	TAT	2	6	1278863	1278868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483340
32514	NC_017043	TA	4	8	1278902	1278909	50 %	50 %	0 %	0 %	383483340
32515	NC_017043	GAAA	2	8	1278985	1278992	75 %	0 %	25 %	0 %	383483340
32516	NC_017043	A	6	6	1279017	1279022	100 %	0 %	0 %	0 %	383483340
32517	NC_017043	ATG	2	6	1279039	1279044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483340
32518	NC_017043	ATA	2	6	1279048	1279053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483340
32519	NC_017043	TGAT	2	8	1279138	1279145	25 %	50 %	25 %	0 %	383483340
32520	NC_017043	A	6	6	1279219	1279224	100 %	0 %	0 %	0 %	383483340
32521	NC_017043	ATA	2	6	1279297	1279302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483340
32522	NC_017043	G	6	6	1279327	1279332	0 %	0 %	100 %	0 %	383483340
32523	NC_017043	GCTT	2	8	1279343	1279350	0 %	50 %	25 %	25 %	383483340
32524	NC_017043	TGC	2	6	1279376	1279381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483340
32525	NC_017043	AGA	2	6	1279451	1279456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483340
32526	NC_017043	TAATA	2	10	1279463	1279472	60 %	40 %	0 %	0 %	383483340
32527	NC_017043	ATT	2	6	1279510	1279515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483340
32528	NC_017043	AAT	2	6	1279522	1279527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483340
32529	NC_017043	GTA	2	6	1279540	1279545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32530	NC_017043	ATA	2	6	1279582	1279587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32531	NC_017043	A	6	6	1279590	1279595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32532	NC_017043	AGC	2	6	1279653	1279658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32533	NC_017043	CAAG	2	8	1279666	1279673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32534	NC_017043	A	8	8	1279693	1279700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32535	NC_017043	ATT	2	6	1279717	1279722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.