MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017043	TAA	2	6	233283	233288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482359
6002	NC_017043	TCT	2	6	233386	233391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482359
6003	NC_017043	T	9	9	233417	233425	0 %	100 %	0 %	0 %	383482359
6004	NC_017043	CTA	2	6	233558	233563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6005	NC_017043	AAG	2	6	233606	233611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482359
6006	NC_017043	TAT	2	6	233619	233624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482359
6007	NC_017043	ACA	2	6	233707	233712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482359
6008	NC_017043	TAA	2	6	233763	233768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482359
6009	NC_017043	CTT	2	6	233774	233779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482359
6010	NC_017043	CAC	2	6	233834	233839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482359
6011	NC_017043	TCAATA	2	12	233890	233901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482359
6012	NC_017043	TTA	2	6	233917	233922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482359
6013	NC_017043	GCT	2	6	233947	233952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482359
6014	NC_017043	CAT	2	6	233993	233998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6015	NC_017043	CTG	2	6	233999	234004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482359
6016	NC_017043	TAA	2	6	234014	234019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482359
6017	NC_017043	TGT	2	6	234136	234141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482359
6018	NC_017043	GCA	2	6	234163	234168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482359
6019	NC_017043	ATC	2	6	234270	234275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6020	NC_017043	TTG	2	6	234335	234340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482359
6021	NC_017043	TA	3	6	234491	234496	50 %	50 %	0 %	0 %	383482359
6022	NC_017043	CTTTT	2	10	234528	234537	0 %	80 %	0 %	20 %	383482359
6023	NC_017043	TCG	3	9	234589	234597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482359
6024	NC_017043	T	6	6	234621	234626	0 %	100 %	0 %	0 %	383482359
6025	NC_017043	T	7	7	234630	234636	0 %	100 %	0 %	0 %	383482359
6026	NC_017043	CTG	2	6	234677	234682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482359
6027	NC_017043	TTCT	2	8	234693	234700	0 %	75 %	0 %	25 %	383482359
6028	NC_017043	CTA	2	6	234731	234736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
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6030	NC_017043	TCA	2	6	234793	234798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6031	NC_017043	TTC	2	6	234834	234839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482359
6032	NC_017043	CTT	2	6	234863	234868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482359
6033	NC_017043	ATTTA	2	10	234954	234963	40 %	60 %	0 %	0 %	383482359
6034	NC_017043	CAG	2	6	234971	234976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482359
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6039	NC_017043	GTA	2	6	235072	235077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482359
6040	NC_017043	ACT	2	6	235080	235085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6041	NC_017043	CTA	2	6	235106	235111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482359
6042	NC_017043	AG	3	6	235153	235158	50 %	0 %	50 %	0 %	383482359
6043	NC_017043	TTA	2	6	235168	235173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482359
6044	NC_017043	T	6	6	235258	235263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017043	CTA	2	6	235268	235273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_017043	GCG	2	6	235300	235305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017043	A	7	7	235364	235370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017043	TTTAT	2	10	235385	235394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017043	TATT	2	8	235418	235425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017043	ACTA	2	8	235473	235480	50 %	25 %	0 %	25 %	383482360
6051	NC_017043	TC	3	6	235584	235589	0 %	50 %	0 %	50 %	383482360
6052	NC_017043	TCT	2	6	235595	235600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482360
6053	NC_017043	AT	3	6	235656	235661	50 %	50 %	0 %	0 %	383482360
6054	NC_017043	TAAT	2	8	235730	235737	50 %	50 %	0 %	0 %	383482360
6055	NC_017043	TCC	2	6	235766	235771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482360
6056	NC_017043	ACT	2	6	235807	235812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482360
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6058	NC_017043	ATAA	2	8	235889	235896	75 %	25 %	0 %	0 %	383482360
6059	NC_017043	TCT	2	6	235924	235929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482360
6060	NC_017043	ACT	2	6	236045	236050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482360
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6064	NC_017043	TAC	2	6	236244	236249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482360
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6093	NC_017043	ATCA	2	8	237359	237366	50 %	25 %	0 %	25 %	383482361
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6099	NC_017043	CTAT	2	8	237520	237527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_017043	AT	3	6	237571	237576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_017043	ATT	2	6	237861	237866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482362
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6111	NC_017043	TAG	2	6	237983	237988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482362
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6113	NC_017043	TTC	2	6	238026	238031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017043	CGC	2	6	238079	238084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_017043	ATAA	2	8	238128	238135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017043	TA	3	6	238184	238189	50 %	50 %	0 %	0 %	383482363
6117	NC_017043	AT	3	6	238298	238303	50 %	50 %	0 %	0 %	383482363
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6119	NC_017043	AAAGGA	2	12	238314	238325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482363
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6122	NC_017043	TAG	2	6	238399	238404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482363
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6124	NC_017043	TTA	2	6	238465	238470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482363
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6149	NC_017043	AT	3	6	239488	239493	50 %	50 %	0 %	0 %	383482365
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6231	NC_017043	TAA	2	6	242442	242447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_017043	AT	3	6	242460	242465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_017043	ATT	2	6	242472	242477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6234	NC_017043	T	6	6	242480	242485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_017043	CTC	2	6	242841	242846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482369
6247	NC_017043	A	6	6	242922	242927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_017043	TGT	3	9	242958	242966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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