MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_017042	TGA	2	6	1286532	1286537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482118
33003	NC_017042	TTTA	2	8	1286601	1286608	25 %	75 %	0 %	0 %	383482118
33004	NC_017042	AGCA	2	8	1286613	1286620	50 %	0 %	25 %	25 %	383482118
33005	NC_017042	CAT	3	9	1286635	1286643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482118
33006	NC_017042	ATAA	2	8	1286686	1286693	75 %	25 %	0 %	0 %	383482118
33007	NC_017042	TAG	2	6	1286696	1286701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482118
33008	NC_017042	ATT	2	6	1286773	1286778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482118
33009	NC_017042	T	6	6	1286781	1286786	0 %	100 %	0 %	0 %	383482118
33010	NC_017042	AT	4	8	1286812	1286819	50 %	50 %	0 %	0 %	383482118
33011	NC_017042	CTA	2	6	1286835	1286840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482119
33012	NC_017042	CGT	2	6	1286867	1286872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482119
33013	NC_017042	GATAA	2	10	1286879	1286888	60 %	20 %	20 %	0 %	383482119
33014	NC_017042	CG	3	6	1286892	1286897	0 %	0 %	50 %	50 %	383482119
33015	NC_017042	GCG	3	9	1286895	1286903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482119
33016	NC_017042	GTT	2	6	1286918	1286923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482119
33017	NC_017042	AT	3	6	1286950	1286955	50 %	50 %	0 %	0 %	383482119
33018	NC_017042	TTA	2	6	1286996	1287001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482119
33019	NC_017042	T	6	6	1287102	1287107	0 %	100 %	0 %	0 %	383482119
33020	NC_017042	AT	3	6	1287134	1287139	50 %	50 %	0 %	0 %	383482119
33021	NC_017042	AT	4	8	1287174	1287181	50 %	50 %	0 %	0 %	383482119
33022	NC_017042	TG	3	6	1287212	1287217	0 %	50 %	50 %	0 %	383482119
33023	NC_017042	TAT	2	6	1287249	1287254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482119
33024	NC_017042	T	6	6	1287256	1287261	0 %	100 %	0 %	0 %	383482119
33025	NC_017042	TAA	2	6	1287277	1287282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482119
33026	NC_017042	TTA	2	6	1287309	1287314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482119
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33029	NC_017042	TTTG	2	8	1287414	1287421	0 %	75 %	25 %	0 %	383482119
33030	NC_017042	CTG	2	6	1287425	1287430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482119
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33032	NC_017042	A	6	6	1287531	1287536	100 %	0 %	0 %	0 %	383482119
33033	NC_017042	T	7	7	1287559	1287565	0 %	100 %	0 %	0 %	383482119
33034	NC_017042	AGT	2	6	1287601	1287606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482119
33035	NC_017042	AT	3	6	1287627	1287632	50 %	50 %	0 %	0 %	383482119
33036	NC_017042	TGCT	2	8	1287684	1287691	0 %	50 %	25 %	25 %	383482119
33037	NC_017042	TTA	2	6	1287722	1287727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482119
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33042	NC_017042	GCA	2	6	1287937	1287942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482120
33043	NC_017042	TTA	2	6	1287951	1287956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482120
33044	NC_017042	ATT	2	6	1287964	1287969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482120
33045	NC_017042	ATTT	2	8	1287985	1287992	25 %	75 %	0 %	0 %	383482120
33046	NC_017042	AACGT	2	10	1288018	1288027	40 %	20 %	20 %	20 %	383482120
33047	NC_017042	A	6	6	1288038	1288043	100 %	0 %	0 %	0 %	383482120
33048	NC_017042	TTG	2	6	1288063	1288068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33049	NC_017042	CTA	2	6	1288090	1288095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33050	NC_017042	GTT	2	6	1288117	1288122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33051	NC_017042	ACA	2	6	1288188	1288193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33052	NC_017042	ATA	2	6	1288221	1288226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33053	NC_017042	CA	3	6	1288377	1288382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33054	NC_017042	A	7	7	1288386	1288392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33055	NC_017042	TTAA	2	8	1288400	1288407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33056	NC_017042	T	6	6	1288415	1288420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33057	NC_017042	TGG	2	6	1288539	1288544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383482121
33058	NC_017042	T	6	6	1288547	1288552	0 %	100 %	0 %	0 %	383482121
33059	NC_017042	TC	3	6	1288565	1288570	0 %	50 %	0 %	50 %	383482121
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33085	NC_017042	TAA	2	6	1289377	1289382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33088	NC_017042	TA	3	6	1289437	1289442	50 %	50 %	0 %	0 %	383482122
33089	NC_017042	ACC	2	6	1289487	1289492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482122
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33092	NC_017042	TAA	2	6	1289765	1289770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482122
33093	NC_017042	TAG	2	6	1289783	1289788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482122
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33102	NC_017042	AT	3	6	1290154	1290159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33103	NC_017042	ATATT	2	10	1290163	1290172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_017042	T	6	6	1290171	1290176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_017042	ATA	2	6	1290208	1290213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33106	NC_017042	TTA	2	6	1290220	1290225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33107	NC_017042	ATAAA	2	10	1290235	1290244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.