MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_017042	CGC	2	6	1245852	1245857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482087
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32005	NC_017042	TA	3	6	1245882	1245887	50 %	50 %	0 %	0 %	383482087
32006	NC_017042	CTAACT	2	12	1245998	1246009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482087
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32043	NC_017042	TA	3	6	1247372	1247377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32044	NC_017042	AAT	2	6	1247393	1247398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32045	NC_017042	TA	3	6	1247409	1247414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32046	NC_017042	ATT	2	6	1247418	1247423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32052	NC_017042	ATT	2	6	1247615	1247620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482089
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32061	NC_017042	ATA	2	6	1247848	1247853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32101	NC_017042	A	6	6	1249345	1249350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32103	NC_017042	TAAAA	2	10	1249426	1249435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32119	NC_017042	T	6	6	1250143	1250148	0 %	100 %	0 %	0 %	383482094
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32121	NC_017042	AAT	2	6	1250161	1250166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482094
32122	NC_017042	T	7	7	1250230	1250236	0 %	100 %	0 %	0 %	383482094
32123	NC_017042	ATT	2	6	1250242	1250247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482094
32124	NC_017042	GCT	2	6	1250474	1250479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482094
32125	NC_017042	CCG	2	6	1250564	1250569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482094
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32134	NC_017042	AG	3	6	1250948	1250953	50 %	0 %	50 %	0 %	383482094
32135	NC_017042	TGC	2	6	1250966	1250971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482094
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32143	NC_017042	TA	3	6	1251157	1251162	50 %	50 %	0 %	0 %	383482094
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32150	NC_017042	AAGA	2	8	1251420	1251427	75 %	0 %	25 %	0 %	383482094
32151	NC_017042	CTT	2	6	1251432	1251437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482094
32152	NC_017042	GTTA	2	8	1251463	1251470	25 %	50 %	25 %	0 %	383482094
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32154	NC_017042	AAT	2	6	1251534	1251539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482094
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32158	NC_017042	ATA	2	6	1251742	1251747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482094
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32191	NC_017042	AT	4	8	1253223	1253230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32192	NC_017042	GAG	2	6	1253277	1253282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32193	NC_017042	TTAA	2	8	1253383	1253390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32200	NC_017042	AAG	2	6	1253757	1253762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32201	NC_017042	T	7	7	1253773	1253779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32202	NC_017042	GAA	2	6	1253789	1253794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32204	NC_017042	A	6	6	1253887	1253892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32209	NC_017042	ACCAA	2	10	1254005	1254014	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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32211	NC_017042	CTT	2	6	1254112	1254117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32213	NC_017042	TATT	2	8	1254159	1254166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32214	NC_017042	AAT	2	6	1254211	1254216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32217	NC_017042	TA	10	20	1254253	1254272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32219	NC_017042	GGT	2	6	1254497	1254502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32220	NC_017042	T	6	6	1254545	1254550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32221	NC_017042	TCT	2	6	1254554	1254559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32222	NC_017042	TTTCTC	2	12	1254634	1254645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32223	NC_017042	TTC	2	6	1254676	1254681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32224	NC_017042	TTG	2	6	1254697	1254702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32225	NC_017042	ATC	2	6	1254727	1254732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32226	NC_017042	GTTCTT	2	12	1254813	1254824	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32227	NC_017042	TAA	2	6	1254838	1254843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32228	NC_017042	ATC	2	6	1254862	1254867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32229	NC_017042	T	8	8	1254878	1254885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32230	NC_017042	AATA	2	8	1254901	1254908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32231	NC_017042	ATG	2	6	1254958	1254963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32232	NC_017042	TCA	2	6	1254983	1254988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32233	NC_017042	ATT	2	6	1255016	1255021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32234	NC_017042	CTT	2	6	1255054	1255059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32235	NC_017042	AAC	2	6	1255080	1255085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32236	NC_017042	TA	3	6	1255141	1255146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32237	NC_017042	CTT	2	6	1255187	1255192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32238	NC_017042	TA	3	6	1255223	1255228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32239	NC_017042	AAG	2	6	1255265	1255270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32240	NC_017042	AG	3	6	1255269	1255274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32241	NC_017042	TTA	2	6	1255285	1255290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32491	NC_017042	TA	3	6	1265728	1265733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32492	NC_017042	AAAT	2	8	1265763	1265770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32493	NC_017042	TA	3	6	1265809	1265814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32494	NC_017042	CTAT	2	8	1265841	1265848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32495	NC_017042	CTT	2	6	1265854	1265859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32496	NC_017042	TTA	2	6	1265878	1265883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32497	NC_017042	A	6	6	1266017	1266022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32499	NC_017042	AAC	2	6	1266104	1266109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32500	NC_017042	AAT	2	6	1266167	1266172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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