MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017042	TAT	2	6	1204913	1204918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31003	NC_017042	ATT	2	6	1204919	1204924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31004	NC_017042	ATTA	2	8	1204940	1204947	50 %	50 %	0 %	0 %	383482054
31005	NC_017042	T	8	8	1205003	1205010	0 %	100 %	0 %	0 %	383482054
31006	NC_017042	CTTAT	2	10	1205016	1205025	20 %	60 %	0 %	20 %	383482054
31007	NC_017042	T	6	6	1205085	1205090	0 %	100 %	0 %	0 %	383482054
31008	NC_017042	A	6	6	1205105	1205110	100 %	0 %	0 %	0 %	383482054
31009	NC_017042	TTA	2	6	1205253	1205258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31010	NC_017042	ACTA	2	8	1205267	1205274	50 %	25 %	0 %	25 %	383482054
31011	NC_017042	A	6	6	1205274	1205279	100 %	0 %	0 %	0 %	383482054
31012	NC_017042	TGAG	2	8	1205284	1205291	25 %	25 %	50 %	0 %	383482054
31013	NC_017042	TTA	2	6	1205313	1205318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31014	NC_017042	T	6	6	1205319	1205324	0 %	100 %	0 %	0 %	383482054
31015	NC_017042	ATG	2	6	1205335	1205340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482054
31016	NC_017042	TTA	2	6	1205365	1205370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31017	NC_017042	A	6	6	1205382	1205387	100 %	0 %	0 %	0 %	383482054
31018	NC_017042	ATA	2	6	1205392	1205397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482054
31019	NC_017042	TTG	2	6	1205410	1205415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482054
31020	NC_017042	ATA	2	6	1205419	1205424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482054
31021	NC_017042	T	6	6	1205429	1205434	0 %	100 %	0 %	0 %	383482054
31022	NC_017042	TAT	2	6	1205459	1205464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31023	NC_017042	AAAAT	2	10	1205467	1205476	80 %	20 %	0 %	0 %	383482054
31024	NC_017042	AAT	2	6	1205529	1205534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482054
31025	NC_017042	TAAA	2	8	1205572	1205579	75 %	25 %	0 %	0 %	383482054
31026	NC_017042	ATTA	2	8	1205621	1205628	50 %	50 %	0 %	0 %	383482054
31027	NC_017042	ATT	2	6	1205633	1205638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31028	NC_017042	TTA	2	6	1205656	1205661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31029	NC_017042	TAT	2	6	1205673	1205678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31030	NC_017042	ATT	2	6	1205687	1205692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31031	NC_017042	ATG	3	9	1205703	1205711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482054
31032	NC_017042	GTT	2	6	1205731	1205736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482054
31033	NC_017042	TTA	2	6	1205737	1205742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31034	NC_017042	A	6	6	1205770	1205775	100 %	0 %	0 %	0 %	383482054
31035	NC_017042	ATT	2	6	1205828	1205833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31036	NC_017042	TACT	2	8	1205839	1205846	25 %	50 %	0 %	25 %	383482054
31037	NC_017042	TAA	2	6	1205849	1205854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482054
31038	NC_017042	TGC	2	6	1205867	1205872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482054
31039	NC_017042	TTA	2	6	1205877	1205882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31040	NC_017042	T	6	6	1205898	1205903	0 %	100 %	0 %	0 %	383482054
31041	NC_017042	TAT	2	6	1205915	1205920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482054
31042	NC_017042	TAC	2	6	1206006	1206011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31043	NC_017042	CGA	2	6	1206033	1206038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31044	NC_017042	TTTA	2	8	1206077	1206084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_017042	AG	3	6	1206137	1206142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31046	NC_017042	A	6	6	1206143	1206148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31047	NC_017042	A	7	7	1206229	1206235	100 %	0 %	0 %	0 %	383482055
31048	NC_017042	TAA	2	6	1206274	1206279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482055
31049	NC_017042	A	7	7	1206278	1206284	100 %	0 %	0 %	0 %	383482055
31050	NC_017042	CTTATG	2	12	1206301	1206312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482055
31051	NC_017042	ATG	2	6	1206327	1206332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482055
31052	NC_017042	TTA	2	6	1206427	1206432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482055
31053	NC_017042	TCG	2	6	1206446	1206451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482055
31054	NC_017042	T	7	7	1206455	1206461	0 %	100 %	0 %	0 %	383482055
31055	NC_017042	TG	3	6	1206480	1206485	0 %	50 %	50 %	0 %	383482055
31056	NC_017042	CGT	2	6	1206510	1206515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482055
31057	NC_017042	AAG	2	6	1206523	1206528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482055
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31063	NC_017042	ACT	2	6	1206651	1206656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482055
31064	NC_017042	CGGT	2	8	1206696	1206703	0 %	25 %	50 %	25 %	383482055
31065	NC_017042	CGG	2	6	1206710	1206715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482055
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31069	NC_017042	AAG	2	6	1206749	1206754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482055
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31083	NC_017042	TATT	2	8	1207310	1207317	25 %	75 %	0 %	0 %	383482056
31084	NC_017042	T	6	6	1207316	1207321	0 %	100 %	0 %	0 %	383482056
31085	NC_017042	A	7	7	1207331	1207337	100 %	0 %	0 %	0 %	383482056
31086	NC_017042	GTA	2	6	1207365	1207370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482056
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31088	NC_017042	AT	3	6	1207411	1207416	50 %	50 %	0 %	0 %	383482056
31089	NC_017042	A	6	6	1207462	1207467	100 %	0 %	0 %	0 %	383482056
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31093	NC_017042	TAC	2	6	1207594	1207599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482056
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31102	NC_017042	ATCT	2	8	1207989	1207996	25 %	50 %	0 %	25 %	383482056
31103	NC_017042	TAT	2	6	1208016	1208021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482056
31104	NC_017042	T	9	9	1208042	1208050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_017042	TTG	2	6	1208081	1208086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_017042	TG	3	6	1208107	1208112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_017042	A	6	6	1208140	1208145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_017042	A	6	6	1208150	1208155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_017042	TAA	2	6	1208159	1208164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_017042	CAA	2	6	1208230	1208235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31111	NC_017042	AC	3	6	1208414	1208419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31112	NC_017042	TA	3	6	1208424	1208429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31113	NC_017042	TTTA	2	8	1208437	1208444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_017042	TTA	2	6	1208453	1208458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31115	NC_017042	CTA	2	6	1208471	1208476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482057
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31117	NC_017042	AGAT	2	8	1208516	1208523	50 %	25 %	25 %	0 %	383482057
31118	NC_017042	TAA	2	6	1208666	1208671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482057
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