MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017042	GGTA	2	8	642850	642857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_017042	GAT	2	6	642910	642915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16503	NC_017042	ACT	2	6	642966	642971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_017042	CT	3	6	643027	643032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16505	NC_017042	TA	3	6	643292	643297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_017042	TATC	2	8	643381	643388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16507	NC_017042	TAG	2	6	643565	643570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_017042	AT	3	6	643582	643587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_017042	CTA	2	6	643598	643603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_017042	ACTT	2	8	643767	643774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16511	NC_017042	GCG	2	6	643816	643821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_017042	AAAT	2	8	643884	643891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_017042	GAT	2	6	643902	643907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_017042	TAG	2	6	643928	643933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_017042	CTA	2	6	643946	643951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_017042	TTTG	2	8	643976	643983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_017042	GTC	2	6	644016	644021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16518	NC_017042	GGTT	2	8	644055	644062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_017042	ACATA	2	10	644121	644130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16520	NC_017042	GTA	2	6	644173	644178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_017042	AAC	2	6	644181	644186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16522	NC_017042	ATAA	2	8	644224	644231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_017042	TGC	2	6	644310	644315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16524	NC_017042	ACT	2	6	644362	644367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16525	NC_017042	CAT	2	6	644372	644377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_017042	AAGG	2	8	644477	644484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_017042	AAT	2	6	644496	644501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_017042	CAT	2	6	644579	644584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_017042	ATATTA	2	12	644623	644634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_017042	CTT	2	6	644672	644677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16531	NC_017042	TAGTAT	2	12	644699	644710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_017042	GTT	2	6	644714	644719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_017042	GCG	2	6	644762	644767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_017042	TAT	2	6	644772	644777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_017042	AG	3	6	644886	644891	50 %	0 %	50 %	0 %	383481494
16536	NC_017042	TAT	2	6	644907	644912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481494
16537	NC_017042	TGC	2	6	644935	644940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481494
16538	NC_017042	AAT	2	6	645047	645052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481494
16539	NC_017042	GTT	2	6	645132	645137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481494
16540	NC_017042	AAT	2	6	645140	645145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481494
16541	NC_017042	T	6	6	645191	645196	0 %	100 %	0 %	0 %	383481494
16542	NC_017042	ATC	2	6	645197	645202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481494
16543	NC_017042	ATC	2	6	645220	645225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_017042	TTA	2	6	645227	645232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_017042	ACC	2	6	645260	645265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383481495
16546	NC_017042	ATTA	2	8	645272	645279	50 %	50 %	0 %	0 %	383481495
16547	NC_017042	AACC	2	8	645303	645310	50 %	0 %	0 %	50 %	383481495
16548	NC_017042	TGT	2	6	645314	645319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481495
16549	NC_017042	CAC	2	6	645322	645327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383481495
16550	NC_017042	TGC	2	6	645329	645334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481495
16551	NC_017042	TAC	2	6	645388	645393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16552	NC_017042	ATAG	2	8	645406	645413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_017042	TTAATA	2	12	645440	645451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_017042	CGGT	2	8	645554	645561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16555	NC_017042	TAT	2	6	645611	645616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_017042	TGC	2	6	645618	645623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16557	NC_017042	TTG	2	6	645660	645665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_017042	GCA	2	6	645698	645703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_017042	TA	3	6	645749	645754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_017042	ATAA	2	8	645780	645787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_017042	TTTAC	2	10	645809	645818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16562	NC_017042	GGTA	2	8	645832	645839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_017042	GCT	2	6	645852	645857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_017042	AGT	2	6	645917	645922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_017042	TCG	2	6	645964	645969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_017042	TAG	3	9	646009	646017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_017042	TAA	2	6	646159	646164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_017042	ATT	2	6	646183	646188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481496
16569	NC_017042	T	7	7	646187	646193	0 %	100 %	0 %	0 %	383481496
16570	NC_017042	T	6	6	646207	646212	0 %	100 %	0 %	0 %	383481496
16571	NC_017042	CATA	2	8	646217	646224	50 %	25 %	0 %	25 %	383481496
16572	NC_017042	GCGA	2	8	646233	646240	25 %	0 %	50 %	25 %	383481496
16573	NC_017042	AAG	2	6	646245	646250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481496
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16577	NC_017042	ATC	2	6	646454	646459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481496
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16581	NC_017042	TA	3	6	646565	646570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_017042	CTT	2	6	646677	646682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16583	NC_017042	TCA	2	6	646688	646693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16584	NC_017042	GCT	2	6	646823	646828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16585	NC_017042	ATG	3	9	646852	646860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_017042	TAA	2	6	646879	646884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_017042	TATCAA	2	12	646901	646912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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16589	NC_017042	CTG	2	6	646965	646970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_017042	TGT	2	6	646971	646976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_017042	TAA	2	6	647041	647046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16592	NC_017042	CTG	2	6	647103	647108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481497
16593	NC_017042	TCTGC	2	10	647118	647127	0 %	40 %	20 %	40 %	383481497
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16598	NC_017042	ATTTA	2	10	647398	647407	40 %	60 %	0 %	0 %	383481497
16599	NC_017042	TAGA	2	8	647443	647450	50 %	25 %	25 %	0 %	383481497
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16601	NC_017042	TACT	2	8	647531	647538	25 %	50 %	0 %	25 %	383481497
16602	NC_017042	T	8	8	647550	647557	0 %	100 %	0 %	0 %	383481497
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16605	NC_017042	TAA	2	6	647718	647723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16606	NC_017042	GCT	2	6	647741	647746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481498
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16609	NC_017042	GGA	2	6	647845	647850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_017042	ATT	3	9	647854	647862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16611	NC_017042	AAT	2	6	647874	647879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16612	NC_017042	AGT	2	6	647887	647892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16613	NC_017042	AGA	2	6	647945	647950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16614	NC_017042	AT	3	6	647975	647980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16615	NC_017042	AAAT	2	8	648031	648038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_017042	ATTA	2	8	648053	648060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16617	NC_017042	TAT	2	6	648106	648111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16618	NC_017042	T	6	6	648111	648116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_017042	AACT	2	8	648118	648125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16620	NC_017042	TAA	2	6	648141	648146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16621	NC_017042	TCAC	2	8	648208	648215	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16625	NC_017042	CT	3	6	648368	648373	0 %	50 %	0 %	50 %	383481499
16626	NC_017042	TAGA	2	8	648376	648383	50 %	25 %	25 %	0 %	383481499
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16999	NC_017042	ATC	2	6	664285	664290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481515
17000	NC_017042	AAT	2	6	664312	664317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481515

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