MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017042	TTA	2	6	547228	547233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_017042	AGC	2	6	547292	547297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_017042	CAT	2	6	547342	547347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_017042	TAA	2	6	547360	547365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_017042	ACT	2	6	547367	547372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_017042	ATTT	2	8	547374	547381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_017042	T	6	6	547428	547433	0 %	100 %	0 %	0 %	383481399
14008	NC_017042	ATA	2	6	547547	547552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_017042	CTA	2	6	547561	547566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_017042	TAAA	2	8	547583	547590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017042	AAT	2	6	547600	547605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_017042	TGA	2	6	547618	547623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_017042	GTA	2	6	547629	547634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017042	TTA	2	6	547702	547707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017042	TCA	2	6	547713	547718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_017042	TGT	2	6	547751	547756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481400
14017	NC_017042	TAA	2	6	547765	547770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481400
14018	NC_017042	ATT	2	6	547788	547793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481400
14019	NC_017042	CTT	2	6	547814	547819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481400
14020	NC_017042	TAT	2	6	547837	547842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481400
14021	NC_017042	ATA	2	6	547855	547860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481400
14022	NC_017042	ATT	2	6	547875	547880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481400
14023	NC_017042	AT	3	6	547881	547886	50 %	50 %	0 %	0 %	383481400
14024	NC_017042	ATT	2	6	547892	547897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481400
14025	NC_017042	GTT	2	6	547938	547943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_017042	GT	3	6	547944	547949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_017042	AAC	2	6	548000	548005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_017042	TAA	2	6	548015	548020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_017042	CA	3	6	548082	548087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14030	NC_017042	ATA	2	6	548133	548138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_017042	A	7	7	548138	548144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_017042	T	7	7	548160	548166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_017042	ATCT	2	8	548228	548235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14034	NC_017042	TAA	2	6	548237	548242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_017042	TAT	2	6	548269	548274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_017042	A	6	6	548284	548289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_017042	TGTAGG	2	12	548290	548301	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_017042	A	6	6	548303	548308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_017042	ATAA	2	8	548321	548328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_017042	ACCT	2	8	548330	548337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14041	NC_017042	ATT	2	6	548345	548350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481401
14042	NC_017042	GTT	2	6	548476	548481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481401
14043	NC_017042	GCCT	2	8	548553	548560	0 %	25 %	25 %	50 %	383481401
14044	NC_017042	TTTAA	2	10	548596	548605	40 %	60 %	0 %	0 %	383481401
14045	NC_017042	AACT	2	8	548619	548626	50 %	25 %	0 %	25 %	383481401
14046	NC_017042	GCA	2	6	548632	548637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481401
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14049	NC_017042	TCT	2	6	548925	548930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481401
14050	NC_017042	GAAC	2	8	548947	548954	50 %	0 %	25 %	25 %	383481401
14051	NC_017042	ATA	2	6	548969	548974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_017042	TTA	2	6	548983	548988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_017042	A	7	7	548999	549005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_017042	TA	3	6	549006	549011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_017042	A	6	6	549070	549075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_017042	CAAT	2	8	549103	549110	50 %	25 %	0 %	25 %	383481402
14057	NC_017042	ATCA	2	8	549120	549127	50 %	25 %	0 %	25 %	383481402
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14060	NC_017042	TGA	2	6	549380	549385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481402
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14062	NC_017042	T	6	6	549426	549431	0 %	100 %	0 %	0 %	383481402
14063	NC_017042	T	6	6	549481	549486	0 %	100 %	0 %	0 %	383481402
14064	NC_017042	CGT	2	6	549519	549524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481402
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14068	NC_017042	CGC	3	9	549649	549657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481402
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14072	NC_017042	TATT	2	8	549778	549785	25 %	75 %	0 %	0 %	383481402
14073	NC_017042	T	7	7	549800	549806	0 %	100 %	0 %	0 %	383481402
14074	NC_017042	GAAT	2	8	549811	549818	50 %	25 %	25 %	0 %	383481402
14075	NC_017042	TA	3	6	549824	549829	50 %	50 %	0 %	0 %	383481402
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14079	NC_017042	AACA	2	8	549903	549910	75 %	0 %	0 %	25 %	383481402
14080	NC_017042	T	6	6	549921	549926	0 %	100 %	0 %	0 %	383481402
14081	NC_017042	T	6	6	549948	549953	0 %	100 %	0 %	0 %	383481402
14082	NC_017042	GA	3	6	550000	550005	50 %	0 %	50 %	0 %	383481402
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14084	NC_017042	T	6	6	550091	550096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_017042	AT	4	8	550164	550171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_017042	AC	3	6	550206	550211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14089	NC_017042	TTTC	2	8	550348	550355	0 %	75 %	0 %	25 %	383481403
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14092	NC_017042	AGCC	2	8	550465	550472	25 %	0 %	25 %	50 %	383481403
14093	NC_017042	AAT	2	6	550482	550487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481403
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14095	NC_017042	CTCA	2	8	550584	550591	25 %	25 %	0 %	50 %	383481403
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14099	NC_017042	AAC	2	6	550766	550771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481403
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14102	NC_017042	ATT	2	6	550988	550993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_017042	ACGT	2	8	550997	551004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14104	NC_017042	TTTA	2	8	551059	551066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_017042	TACT	2	8	551070	551077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_017042	ATTT	2	8	551096	551103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_017042	ATT	2	6	551129	551134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_017042	AT	3	6	551143	551148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_017042	ATA	2	6	551185	551190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481404
14110	NC_017042	AAAG	2	8	551337	551344	75 %	0 %	25 %	0 %	383481404
14111	NC_017042	A	6	6	551350	551355	100 %	0 %	0 %	0 %	383481404
14112	NC_017042	GAT	2	6	551382	551387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481404
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14115	NC_017042	A	8	8	551529	551536	100 %	0 %	0 %	0 %	383481404
14116	NC_017042	AT	3	6	551550	551555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_017042	A	6	6	551561	551566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_017042	AGA	2	6	551578	551583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_017042	A	6	6	551618	551623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_017042	TAT	2	6	551665	551670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_017042	A	6	6	551724	551729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_017042	ATATCA	2	12	551750	551761	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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14124	NC_017042	GAA	2	6	551805	551810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_017042	ACA	2	6	551900	551905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481405
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14127	NC_017042	AAAG	2	8	551927	551934	75 %	0 %	25 %	0 %	383481405
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