MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017042	ATG	2	6	509103	509108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481359
13003	NC_017042	T	7	7	509117	509123	0 %	100 %	0 %	0 %	383481359
13004	NC_017042	CAC	2	6	509159	509164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383481359
13005	NC_017042	TTA	2	6	509266	509271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481359
13006	NC_017042	TAA	2	6	509294	509299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481359
13007	NC_017042	TAA	2	6	509325	509330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481359
13008	NC_017042	TTA	2	6	509369	509374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481359
13009	NC_017042	TCT	2	6	509416	509421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481359
13010	NC_017042	AAT	2	6	509431	509436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481359
13011	NC_017042	ATA	2	6	509488	509493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481359
13012	NC_017042	ATT	2	6	509501	509506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017042	TCA	2	6	509515	509520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_017042	TTGT	2	8	509521	509528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017042	GTA	2	6	509555	509560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_017042	ATG	2	6	509622	509627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017042	CAA	2	6	509642	509647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_017042	TTA	2	6	509678	509683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13019	NC_017042	TCT	2	6	509729	509734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481360
13020	NC_017042	TCCGT	2	10	509735	509744	0 %	40 %	20 %	40 %	383481360
13021	NC_017042	CAA	2	6	509784	509789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481360
13022	NC_017042	ATA	2	6	509793	509798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13023	NC_017042	ATG	2	6	509915	509920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481360
13024	NC_017042	ACC	2	6	509971	509976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383481360
13025	NC_017042	GCT	2	6	510062	510067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481360
13026	NC_017042	TCT	2	6	510092	510097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481360
13027	NC_017042	TAC	2	6	510123	510128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481360
13028	NC_017042	TCT	2	6	510179	510184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481360
13029	NC_017042	TGA	2	6	510229	510234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481360
13030	NC_017042	AT	3	6	510347	510352	50 %	50 %	0 %	0 %	383481360
13031	NC_017042	ATA	2	6	510397	510402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13032	NC_017042	AGA	2	6	510460	510465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481360
13033	NC_017042	TAAA	2	8	510474	510481	75 %	25 %	0 %	0 %	383481360
13034	NC_017042	TTA	2	6	510482	510487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13035	NC_017042	ACA	2	6	510626	510631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481360
13036	NC_017042	TAGC	2	8	510713	510720	25 %	25 %	25 %	25 %	383481360
13037	NC_017042	T	6	6	510764	510769	0 %	100 %	0 %	0 %	383481360
13038	NC_017042	TTC	2	6	510776	510781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481360
13039	NC_017042	TAG	2	6	510882	510887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481360
13040	NC_017042	AAAG	2	8	510898	510905	75 %	0 %	25 %	0 %	383481360
13041	NC_017042	TAT	2	6	510916	510921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13042	NC_017042	TAA	2	6	510939	510944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13043	NC_017042	AT	3	6	510950	510955	50 %	50 %	0 %	0 %	383481360
13044	NC_017042	A	6	6	510966	510971	100 %	0 %	0 %	0 %	383481360
13045	NC_017042	TAA	2	6	511063	511068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13046	NC_017042	GAA	2	6	511112	511117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481360
13047	NC_017042	TAA	2	6	511192	511197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13048	NC_017042	AT	3	6	511214	511219	50 %	50 %	0 %	0 %	383481360
13049	NC_017042	ATT	3	9	511223	511231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13050	NC_017042	ATA	2	6	511239	511244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481360
13051	NC_017042	T	8	8	511394	511401	0 %	100 %	0 %	0 %	383481360
13052	NC_017042	ATT	3	9	511411	511419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13053	NC_017042	TAT	2	6	511422	511427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481360
13054	NC_017042	TTATA	2	10	511437	511446	40 %	60 %	0 %	0 %	383481361
13055	NC_017042	AAT	2	6	511447	511452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481361
13056	NC_017042	ATTA	2	8	511454	511461	50 %	50 %	0 %	0 %	383481361
13057	NC_017042	TTC	2	6	511463	511468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481361
13058	NC_017042	GCT	2	6	511491	511496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481361
13059	NC_017042	TAT	2	6	511537	511542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481361
13060	NC_017042	AT	3	6	511574	511579	50 %	50 %	0 %	0 %	383481361
13061	NC_017042	ATT	3	9	511625	511633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481361
13062	NC_017042	CTT	2	6	511678	511683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481361
13063	NC_017042	CTT	2	6	511816	511821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481361
13064	NC_017042	TC	3	6	511906	511911	0 %	50 %	0 %	50 %	383481361
13065	NC_017042	TTTG	2	8	511929	511936	0 %	75 %	25 %	0 %	383481361
13066	NC_017042	TGAT	2	8	511979	511986	25 %	50 %	25 %	0 %	383481361
13067	NC_017042	ACT	2	6	511998	512003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481361
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13069	NC_017042	GTA	2	6	512296	512301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481361
13070	NC_017042	T	6	6	512302	512307	0 %	100 %	0 %	0 %	383481361
13071	NC_017042	AG	3	6	512331	512336	50 %	0 %	50 %	0 %	383481361
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13074	NC_017042	ATT	2	6	512457	512462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481361
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13080	NC_017042	ATA	2	6	512686	512691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481362
13081	NC_017042	ATT	2	6	512749	512754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481362
13082	NC_017042	CAT	2	6	512808	512813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481362
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13089	NC_017042	A	6	6	513126	513131	100 %	0 %	0 %	0 %	383481364
13090	NC_017042	CAA	2	6	513224	513229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481364
13091	NC_017042	CTT	2	6	513293	513298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481364
13092	NC_017042	CAATAA	2	12	513299	513310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383481364
13093	NC_017042	ATT	3	9	513312	513320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481364
13094	NC_017042	T	7	7	513319	513325	0 %	100 %	0 %	0 %	383481364
13095	NC_017042	TA	3	6	513349	513354	50 %	50 %	0 %	0 %	383481364
13096	NC_017042	ATT	2	6	513358	513363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481364
13097	NC_017042	AAT	2	6	513393	513398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017042	CGCTC	2	10	513491	513500	0 %	20 %	20 %	60 %	383481365
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13101	NC_017042	A	6	6	513657	513662	100 %	0 %	0 %	0 %	383481366
13102	NC_017042	GAA	2	6	513667	513672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481366
13103	NC_017042	AGC	2	6	513681	513686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481366
13104	NC_017042	ATA	2	6	513755	513760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481366
13105	NC_017042	ATT	2	6	513763	513768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481366
13106	NC_017042	ATG	2	6	513919	513924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481366
13107	NC_017042	TTG	2	6	513926	513931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481366
13108	NC_017042	AT	3	6	513944	513949	50 %	50 %	0 %	0 %	383481366
13109	NC_017042	AAT	2	6	513988	513993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481366
13110	NC_017042	GCA	2	6	513997	514002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481366
13111	NC_017042	AAT	2	6	514060	514065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481366
13112	NC_017042	CTG	2	6	514070	514075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481366
13113	NC_017042	TG	3	6	514115	514120	0 %	50 %	50 %	0 %	383481366
13114	NC_017042	ATA	2	6	514133	514138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481366
13115	NC_017042	CTA	2	6	514165	514170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481367
13116	NC_017042	ACT	2	6	514173	514178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481367
13117	NC_017042	A	6	6	514182	514187	100 %	0 %	0 %	0 %	383481367
13118	NC_017042	TGAA	2	8	514219	514226	50 %	25 %	25 %	0 %	383481367
13119	NC_017042	A	6	6	514260	514265	100 %	0 %	0 %	0 %	383481367
13120	NC_017042	GTC	2	6	514294	514299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481367
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13499	NC_017042	ACT	2	6	529105	529110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481378
13500	NC_017042	CTT	2	6	529202	529207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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