MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017042	TTTGA	2	10	429542	429551	20 %	60 %	20 %	0 %	383481274
11003	NC_017042	ATA	2	6	429636	429641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_017042	ATT	2	6	429653	429658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_017042	GAT	2	6	429694	429699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017042	CAA	2	6	429720	429725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017042	A	6	6	429768	429773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017042	TAAAA	2	10	429782	429791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017042	CGA	2	6	429847	429852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481275
11010	NC_017042	G	6	6	429861	429866	0 %	0 %	100 %	0 %	383481275
11011	NC_017042	GCC	2	6	429929	429934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481275
11012	NC_017042	AGTTTA	2	12	430024	430035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383481275
11013	NC_017042	AT	4	8	430086	430093	50 %	50 %	0 %	0 %	383481275
11014	NC_017042	AT	3	6	430104	430109	50 %	50 %	0 %	0 %	383481275
11015	NC_017042	TTTTA	2	10	430110	430119	20 %	80 %	0 %	0 %	383481275
11016	NC_017042	A	6	6	430130	430135	100 %	0 %	0 %	0 %	383481275
11017	NC_017042	TA	3	6	430152	430157	50 %	50 %	0 %	0 %	383481275
11018	NC_017042	GGT	2	6	430195	430200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383481275
11019	NC_017042	TTG	2	6	430218	430223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481275
11020	NC_017042	ATT	2	6	430278	430283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481275
11021	NC_017042	T	6	6	430294	430299	0 %	100 %	0 %	0 %	383481275
11022	NC_017042	TAA	2	6	430306	430311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481275
11023	NC_017042	A	6	6	430310	430315	100 %	0 %	0 %	0 %	383481275
11024	NC_017042	GTA	2	6	430392	430397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481275
11025	NC_017042	T	7	7	430408	430414	0 %	100 %	0 %	0 %	383481275
11026	NC_017042	AT	3	6	430449	430454	50 %	50 %	0 %	0 %	383481275
11027	NC_017042	GAT	2	6	430473	430478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481275
11028	NC_017042	GGC	2	6	430566	430571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481275
11029	NC_017042	GTT	2	6	430587	430592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481275
11030	NC_017042	ATT	2	6	430667	430672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481275
11031	NC_017042	AAT	2	6	430691	430696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481275
11032	NC_017042	TAA	2	6	430720	430725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481275
11033	NC_017042	TAA	2	6	430768	430773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481275
11034	NC_017042	T	6	6	430784	430789	0 %	100 %	0 %	0 %	383481275
11035	NC_017042	TTA	2	6	430807	430812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_017042	ATC	2	6	430821	430826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481276
11037	NC_017042	TCT	2	6	430845	430850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481276
11038	NC_017042	GCG	2	6	430975	430980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481276
11039	NC_017042	TTA	2	6	430990	430995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481276
11040	NC_017042	GAA	2	6	431066	431071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481276
11041	NC_017042	TAC	2	6	431075	431080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481276
11042	NC_017042	ATT	2	6	431083	431088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481276
11043	NC_017042	AT	3	6	431091	431096	50 %	50 %	0 %	0 %	383481276
11044	NC_017042	GAT	2	6	431100	431105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481276
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11046	NC_017042	GGC	2	6	431148	431153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481276
11047	NC_017042	AAAT	2	8	431158	431165	75 %	25 %	0 %	0 %	383481276
11048	NC_017042	TAGAT	2	10	431228	431237	40 %	40 %	20 %	0 %	383481276
11049	NC_017042	ATT	2	6	431272	431277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481276
11050	NC_017042	AGT	2	6	431280	431285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481276
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11052	NC_017042	TTA	2	6	431459	431464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481276
11053	NC_017042	ATA	2	6	431485	431490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481276
11054	NC_017042	ATT	2	6	431555	431560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481276
11055	NC_017042	GAT	2	6	431580	431585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481276
11056	NC_017042	TAA	2	6	431594	431599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481276
11057	NC_017042	AAT	2	6	431603	431608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481276
11058	NC_017042	AT	3	6	431621	431626	50 %	50 %	0 %	0 %	383481276
11059	NC_017042	TAA	2	6	431639	431644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481276
11060	NC_017042	A	6	6	431659	431664	100 %	0 %	0 %	0 %	383481276
11061	NC_017042	TTTTA	2	10	431703	431712	20 %	80 %	0 %	0 %	383481276
11062	NC_017042	TTA	2	6	431829	431834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_017042	T	6	6	431898	431903	0 %	100 %	0 %	0 %	383481277
11064	NC_017042	TTG	2	6	431905	431910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481277
11065	NC_017042	T	8	8	431912	431919	0 %	100 %	0 %	0 %	383481277
11066	NC_017042	TAA	2	6	431922	431927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481277
11067	NC_017042	ATTG	2	8	431932	431939	25 %	50 %	25 %	0 %	383481277
11068	NC_017042	AT	3	6	431982	431987	50 %	50 %	0 %	0 %	383481277
11069	NC_017042	GAT	2	6	432025	432030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481277
11070	NC_017042	TTA	2	6	432040	432045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481277
11071	NC_017042	AAATG	2	10	432093	432102	60 %	20 %	20 %	0 %	383481277
11072	NC_017042	CAG	2	6	432134	432139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481277
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11095	NC_017042	TTCT	2	8	432737	432744	0 %	75 %	0 %	25 %	383481277
11096	NC_017042	AAG	2	6	432745	432750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481277
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11104	NC_017042	A	6	6	433056	433061	100 %	0 %	0 %	0 %	383481277
11105	NC_017042	TTG	2	6	433072	433077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017042	GAAA	2	8	433105	433112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017042	GCA	2	6	433121	433126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11109	NC_017042	ACA	2	6	433200	433205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_017042	TTA	2	6	433260	433265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481278
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11115	NC_017042	TAT	2	6	433412	433417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481278
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11118	NC_017042	TA	3	6	433456	433461	50 %	50 %	0 %	0 %	383481278
11119	NC_017042	AGC	2	6	433481	433486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481278
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11121	NC_017042	ATT	2	6	433641	433646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481278
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11239	NC_017042	TAA	2	6	439130	439135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_017042	GAT	2	6	439272	439277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481286
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