MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017042	TTA	2	6	410409	410414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481253
10503	NC_017042	A	6	6	410480	410485	100 %	0 %	0 %	0 %	383481253
10504	NC_017042	A	6	6	410489	410494	100 %	0 %	0 %	0 %	383481253
10505	NC_017042	ATT	2	6	410508	410513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_017042	TAA	2	6	410537	410542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_017042	ATT	2	6	410553	410558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_017042	TGG	2	6	410610	410615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383481254
10509	NC_017042	AAGTTT	2	12	410626	410637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383481254
10510	NC_017042	TA	3	6	410638	410643	50 %	50 %	0 %	0 %	383481254
10511	NC_017042	AAG	2	6	410654	410659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481254
10512	NC_017042	CAT	2	6	410662	410667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481254
10513	NC_017042	TGA	2	6	410721	410726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481254
10514	NC_017042	A	8	8	410764	410771	100 %	0 %	0 %	0 %	383481254
10515	NC_017042	AGCAG	2	10	410880	410889	40 %	0 %	40 %	20 %	383481254
10516	NC_017042	ATA	2	6	410902	410907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_017042	ATTT	2	8	410945	410952	25 %	75 %	0 %	0 %	383481255
10518	NC_017042	ATT	2	6	410956	410961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481255
10519	NC_017042	AT	4	8	410973	410980	50 %	50 %	0 %	0 %	383481255
10520	NC_017042	T	6	6	411006	411011	0 %	100 %	0 %	0 %	383481255
10521	NC_017042	CAT	2	6	411017	411022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481255
10522	NC_017042	TATT	2	8	411069	411076	25 %	75 %	0 %	0 %	383481255
10523	NC_017042	T	6	6	411075	411080	0 %	100 %	0 %	0 %	383481255
10524	NC_017042	TGA	2	6	411111	411116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481255
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10528	NC_017042	T	6	6	411301	411306	0 %	100 %	0 %	0 %	383481255
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10531	NC_017042	TTA	2	6	411526	411531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481255
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10534	NC_017042	GTTT	2	8	411668	411675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_017042	TTTAT	2	10	411707	411716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_017042	AT	3	6	411720	411725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_017042	ATT	2	6	411747	411752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_017042	T	7	7	411751	411757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_017042	T	6	6	411811	411816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_017042	TAAA	2	8	411833	411840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_017042	TAA	2	6	411882	411887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481256
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10543	NC_017042	AATT	2	8	411909	411916	50 %	50 %	0 %	0 %	383481256
10544	NC_017042	TAG	2	6	412011	412016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481256
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10553	NC_017042	TTA	2	6	412361	412366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481256
10554	NC_017042	AATATC	2	12	412367	412378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383481256
10555	NC_017042	AT	4	8	412401	412408	50 %	50 %	0 %	0 %	383481256
10556	NC_017042	TAT	2	6	412414	412419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481256
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10560	NC_017042	TTA	2	6	412518	412523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481256
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10562	NC_017042	TA	4	8	412570	412577	50 %	50 %	0 %	0 %	383481256
10563	NC_017042	TTCT	2	8	412578	412585	0 %	75 %	0 %	25 %	383481256
10564	NC_017042	T	7	7	412600	412606	0 %	100 %	0 %	0 %	383481256
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10591	NC_017042	A	7	7	413838	413844	100 %	0 %	0 %	0 %	383481258
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10594	NC_017042	A	6	6	414032	414037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_017042	ATT	2	6	414071	414076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_017042	TTA	2	6	414127	414132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_017042	TTA	2	6	414152	414157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_017042	TGA	3	9	414171	414179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10603	NC_017042	GT	3	6	414326	414331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_017042	AGC	2	6	414480	414485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481259
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10609	NC_017042	ATA	2	6	414561	414566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481260
10610	NC_017042	AGA	2	6	414590	414595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481260
10611	NC_017042	AGA	2	6	414599	414604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481260
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10614	NC_017042	TTA	2	6	414686	414691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481261
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10621	NC_017042	AC	3	6	415051	415056	50 %	0 %	0 %	50 %	383481262
10622	NC_017042	TATTT	2	10	415096	415105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_017042	TA	3	6	415134	415139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_017042	TAA	2	6	415170	415175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481263
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10995	NC_017042	A	6	6	429268	429273	100 %	0 %	0 %	0 %	383481274
10996	NC_017042	ATA	3	9	429311	429319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481274
10997	NC_017042	TAA	2	6	429321	429326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481274
10998	NC_017042	AGA	2	6	429432	429437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481274
10999	NC_017042	GCT	2	6	429445	429450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481274
11000	NC_017042	A	6	6	429453	429458	100 %	0 %	0 %	0 %	383481274

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