MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016931	GAA	2	6	157299	157304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713226
4002	NC_016931	CTT	2	6	157327	157332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713226
4003	NC_016931	TA	3	6	157376	157381	50 %	50 %	0 %	0 %	379713226
4004	NC_016931	TAC	3	9	157400	157408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713226
4005	NC_016931	A	6	6	157418	157423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016931	TA	3	6	157447	157452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016931	CAA	2	6	157473	157478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016931	AT	3	6	157480	157485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016931	AAT	2	6	157486	157491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713227
4010	NC_016931	TAA	2	6	157519	157524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713227
4011	NC_016931	GATTTT	2	12	157529	157540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379713227
4012	NC_016931	A	6	6	157550	157555	100 %	0 %	0 %	0 %	379713227
4013	NC_016931	TA	4	8	157609	157616	50 %	50 %	0 %	0 %	379713227
4014	NC_016931	AATTT	2	10	157617	157626	40 %	60 %	0 %	0 %	379713227
4015	NC_016931	CGG	2	6	157642	157647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713227
4016	NC_016931	AGGTG	2	10	157723	157732	20 %	20 %	60 %	0 %	379713227
4017	NC_016931	GTA	3	9	157779	157787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713227
4018	NC_016931	GAA	2	6	157790	157795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713227
4019	NC_016931	TTAA	2	8	157817	157824	50 %	50 %	0 %	0 %	379713227
4020	NC_016931	TCTT	2	8	157937	157944	0 %	75 %	0 %	25 %	379713227
4021	NC_016931	TGC	2	6	158080	158085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713227
4022	NC_016931	TAT	2	6	158095	158100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713227
4023	NC_016931	GTA	2	6	158123	158128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713227
4024	NC_016931	AT	3	6	158129	158134	50 %	50 %	0 %	0 %	379713227
4025	NC_016931	A	8	8	158168	158175	100 %	0 %	0 %	0 %	379713227
4026	NC_016931	TTA	2	6	158235	158240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713227
4027	NC_016931	T	6	6	158312	158317	0 %	100 %	0 %	0 %	379713227
4028	NC_016931	ATA	2	6	158321	158326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713227
4029	NC_016931	TGTT	2	8	158373	158380	0 %	75 %	25 %	0 %	379713227
4030	NC_016931	TAA	2	6	158392	158397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713227
4031	NC_016931	A	6	6	158396	158401	100 %	0 %	0 %	0 %	379713227
4032	NC_016931	TTG	2	6	158440	158445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016931	AGA	3	9	158589	158597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713228
4034	NC_016931	GCA	2	6	158622	158627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713228
4035	NC_016931	AAG	2	6	158650	158655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713228
4036	NC_016931	GAG	2	6	158744	158749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713228
4037	NC_016931	TAG	2	6	158816	158821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713228
4038	NC_016931	CGA	2	6	158829	158834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713228
4039	NC_016931	AT	3	6	158864	158869	50 %	50 %	0 %	0 %	379713228
4040	NC_016931	TTGC	3	12	158901	158912	0 %	50 %	25 %	25 %	379713228
4041	NC_016931	AAT	2	6	158932	158937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713228
4042	NC_016931	AAG	2	6	159011	159016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713228
4043	NC_016931	ATTT	2	8	159061	159068	25 %	75 %	0 %	0 %	379713228
4044	NC_016931	GAA	2	6	159100	159105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713228
4045	NC_016931	A	6	6	159133	159138	100 %	0 %	0 %	0 %	379713228
4046	NC_016931	GCC	2	6	159156	159161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713228
4047	NC_016931	ACT	2	6	159196	159201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713228
4048	NC_016931	ATAA	2	8	159202	159209	75 %	25 %	0 %	0 %	379713228
4049	NC_016931	AGT	2	6	159225	159230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713228
4050	NC_016931	GAG	2	6	159248	159253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713228
4051	NC_016931	GAA	2	6	159343	159348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713228
4052	NC_016931	ATTG	2	8	159372	159379	25 %	50 %	25 %	0 %	379713228
4053	NC_016931	GCGG	2	8	159388	159395	0 %	0 %	75 %	25 %	379713228
4054	NC_016931	GTG	2	6	159401	159406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713228
4055	NC_016931	TTC	2	6	159441	159446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713228
4056	NC_016931	TTA	2	6	159466	159471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713228
4057	NC_016931	TAT	2	6	159534	159539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713228
4058	NC_016931	ATT	2	6	159562	159567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713228
4059	NC_016931	CATG	2	8	159597	159604	25 %	25 %	25 %	25 %	379713228
4060	NC_016931	ATG	2	6	159661	159666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713228
4061	NC_016931	A	6	6	159688	159693	100 %	0 %	0 %	0 %	379713228
4062	NC_016931	GAAA	2	8	159723	159730	75 %	0 %	25 %	0 %	379713228
4063	NC_016931	GAG	2	6	159862	159867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016931	AAT	2	6	159940	159945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016931	AAT	2	6	160013	160018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016931	ATA	2	6	160038	160043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713229
4067	NC_016931	TAA	2	6	160057	160062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713229
4068	NC_016931	G	6	6	160080	160085	0 %	0 %	100 %	0 %	379713229
4069	NC_016931	TTTTGT	2	12	160087	160098	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	379713229
4070	NC_016931	TTA	2	6	160116	160121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713229
4071	NC_016931	TTA	2	6	160128	160133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713229
4072	NC_016931	TA	3	6	160190	160195	50 %	50 %	0 %	0 %	379713229
4073	NC_016931	ATT	2	6	160227	160232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713229
4074	NC_016931	T	7	7	160240	160246	0 %	100 %	0 %	0 %	379713229
4075	NC_016931	AT	3	6	160342	160347	50 %	50 %	0 %	0 %	379713229
4076	NC_016931	ATTG	2	8	160384	160391	25 %	50 %	25 %	0 %	379713229
4077	NC_016931	AT	4	8	160400	160407	50 %	50 %	0 %	0 %	379713229
4078	NC_016931	A	7	7	160415	160421	100 %	0 %	0 %	0 %	379713229
4079	NC_016931	TA	3	6	160445	160450	50 %	50 %	0 %	0 %	379713229
4080	NC_016931	TA	4	8	160543	160550	50 %	50 %	0 %	0 %	379713229
4081	NC_016931	GATA	2	8	160553	160560	50 %	25 %	25 %	0 %	379713229
4082	NC_016931	T	6	6	160575	160580	0 %	100 %	0 %	0 %	379713229
4083	NC_016931	ATA	2	6	160614	160619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713229
4084	NC_016931	TAG	2	6	160636	160641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713229
4085	NC_016931	ATTT	2	8	160690	160697	25 %	75 %	0 %	0 %	379713229
4086	NC_016931	CAA	2	6	160704	160709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713229
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4088	NC_016931	TTA	2	6	160740	160745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713229
4089	NC_016931	GAT	2	6	160939	160944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713230
4090	NC_016931	TTTA	2	8	161007	161014	25 %	75 %	0 %	0 %	379713230
4091	NC_016931	ACTT	2	8	161103	161110	25 %	50 %	0 %	25 %	379713230
4092	NC_016931	A	6	6	161112	161117	100 %	0 %	0 %	0 %	379713230
4093	NC_016931	TA	3	6	161119	161124	50 %	50 %	0 %	0 %	379713230
4094	NC_016931	GAA	2	6	161140	161145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713230
4095	NC_016931	TAA	2	6	161169	161174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713230
4096	NC_016931	TA	3	6	161208	161213	50 %	50 %	0 %	0 %	379713230
4097	NC_016931	AAC	2	6	161232	161237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713230
4098	NC_016931	ATC	2	6	161339	161344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713230
4099	NC_016931	ACCT	2	8	161345	161352	25 %	25 %	0 %	50 %	379713230
4100	NC_016931	AT	3	6	161353	161358	50 %	50 %	0 %	0 %	379713230
4101	NC_016931	GTAAAA	2	12	161410	161421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379713230
4102	NC_016931	AACA	2	8	161429	161436	75 %	0 %	0 %	25 %	379713230
4103	NC_016931	AAG	2	6	161456	161461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713230
4104	NC_016931	GCA	2	6	161473	161478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713230
4105	NC_016931	AG	3	6	161537	161542	50 %	0 %	50 %	0 %	379713231
4106	NC_016931	GCC	2	6	161570	161575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713231
4107	NC_016931	AC	3	6	161583	161588	50 %	0 %	0 %	50 %	379713231
4108	NC_016931	GAAGT	2	10	161636	161645	40 %	20 %	40 %	0 %	379713231
4109	NC_016931	TTA	2	6	161717	161722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713231
4110	NC_016931	AAT	2	6	161728	161733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713231
4111	NC_016931	ACT	2	6	161771	161776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713231
4112	NC_016931	ATT	2	6	161783	161788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713231
4113	NC_016931	TAT	2	6	161794	161799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713231
4114	NC_016931	ATT	2	6	161927	161932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713231
4115	NC_016931	TGA	2	6	161950	161955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713231
4116	NC_016931	ATA	2	6	161964	161969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713231
4117	NC_016931	T	6	6	162061	162066	0 %	100 %	0 %	0 %	379713231
4118	NC_016931	ATC	2	6	162075	162080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713231
4119	NC_016931	GCTT	2	8	162087	162094	0 %	50 %	25 %	25 %	379713231
4120	NC_016931	AT	3	6	162142	162147	50 %	50 %	0 %	0 %	379713231
4121	NC_016931	GAC	2	6	162188	162193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713231
4122	NC_016931	GCA	2	6	162221	162226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713231
4123	NC_016931	AGAA	2	8	162261	162268	75 %	0 %	25 %	0 %	379713231
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