MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_016931	TGC	2	6	1217600	1217605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714238
31002	NC_016931	ATGC	2	8	1217617	1217624	25 %	25 %	25 %	25 %	379714238
31003	NC_016931	TCT	2	6	1217644	1217649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714238
31004	NC_016931	GCA	2	6	1217692	1217697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714238
31005	NC_016931	AAT	2	6	1217778	1217783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714238
31006	NC_016931	AAT	2	6	1217797	1217802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714238
31007	NC_016931	T	6	6	1217818	1217823	0 %	100 %	0 %	0 %	379714238
31008	NC_016931	ATT	3	9	1217832	1217840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_016931	GAAA	2	8	1217843	1217850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_016931	CTC	2	6	1218005	1218010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714239
31011	NC_016931	TAT	3	9	1218053	1218061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714239
31012	NC_016931	TCTT	2	8	1218102	1218109	0 %	75 %	0 %	25 %	379714239
31013	NC_016931	T	6	6	1218212	1218217	0 %	100 %	0 %	0 %	379714239
31014	NC_016931	ACA	2	6	1218234	1218239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714239
31015	NC_016931	TAA	2	6	1218248	1218253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714239
31016	NC_016931	CT	3	6	1218291	1218296	0 %	50 %	0 %	50 %	379714240
31017	NC_016931	TATC	2	8	1218309	1218316	25 %	50 %	0 %	25 %	379714240
31018	NC_016931	AATA	2	8	1218329	1218336	75 %	25 %	0 %	0 %	379714240
31019	NC_016931	GTT	2	6	1218366	1218371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714240
31020	NC_016931	TAA	2	6	1218387	1218392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714240
31021	NC_016931	CTT	2	6	1218402	1218407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714240
31022	NC_016931	AAT	2	6	1218454	1218459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714240
31023	NC_016931	ACTTA	2	10	1218463	1218472	40 %	40 %	0 %	20 %	379714240
31024	NC_016931	ATT	2	6	1218535	1218540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_016931	ATA	2	6	1218541	1218546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31026	NC_016931	A	8	8	1218556	1218563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31027	NC_016931	T	7	7	1218571	1218577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_016931	TAA	2	6	1218593	1218598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714241
31029	NC_016931	TAGT	2	8	1218647	1218654	25 %	50 %	25 %	0 %	379714241
31030	NC_016931	TCT	2	6	1218704	1218709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714241
31031	NC_016931	CCG	2	6	1218737	1218742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714241
31032	NC_016931	GCC	2	6	1218791	1218796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714241
31033	NC_016931	CT	3	6	1218939	1218944	0 %	50 %	0 %	50 %	379714241
31034	NC_016931	T	6	6	1219069	1219074	0 %	100 %	0 %	0 %	379714241
31035	NC_016931	A	7	7	1219097	1219103	100 %	0 %	0 %	0 %	379714241
31036	NC_016931	T	6	6	1219131	1219136	0 %	100 %	0 %	0 %	379714241
31037	NC_016931	CAA	3	9	1219163	1219171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714241
31038	NC_016931	AGA	2	6	1219274	1219279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31039	NC_016931	ATA	2	6	1219301	1219306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_016931	AGC	2	6	1219380	1219385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31041	NC_016931	CTA	2	6	1219442	1219447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31042	NC_016931	TAA	2	6	1219478	1219483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_016931	TAT	2	6	1219506	1219511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31044	NC_016931	C	6	6	1219581	1219586	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31045	NC_016931	AT	3	6	1219587	1219592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31046	NC_016931	ATC	2	6	1219649	1219654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31047	NC_016931	TAC	2	6	1219671	1219676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31048	NC_016931	GT	3	6	1219710	1219715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31049	NC_016931	T	6	6	1219862	1219867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31050	NC_016931	T	6	6	1219890	1219895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31051	NC_016931	AT	3	6	1219899	1219904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_016931	TAA	2	6	1219918	1219923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31053	NC_016931	TCC	2	6	1219945	1219950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31054	NC_016931	GGCA	2	8	1219973	1219980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31055	NC_016931	GCT	2	6	1219998	1220003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31056	NC_016931	AGC	2	6	1220016	1220021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31057	NC_016931	CCG	2	6	1220025	1220030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31058	NC_016931	AAC	2	6	1220039	1220044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31059	NC_016931	CGAA	2	8	1220074	1220081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31060	NC_016931	CCT	2	6	1220121	1220126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31061	NC_016931	ATA	2	6	1220151	1220156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31062	NC_016931	ATA	2	6	1220163	1220168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31063	NC_016931	TAA	2	6	1220274	1220279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31064	NC_016931	AATTGA	2	12	1220384	1220395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31065	NC_016931	ATT	2	6	1220401	1220406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31066	NC_016931	TAA	2	6	1220420	1220425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31067	NC_016931	ATT	2	6	1220432	1220437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_016931	AGC	2	6	1220459	1220464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31069	NC_016931	ATG	2	6	1220500	1220505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31070	NC_016931	ACA	2	6	1220544	1220549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31071	NC_016931	ATTAGA	2	12	1220554	1220565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31072	NC_016931	ATA	2	6	1220627	1220632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31073	NC_016931	ATA	2	6	1220636	1220641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31074	NC_016931	TAT	2	6	1220651	1220656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31075	NC_016931	TAT	2	6	1220683	1220688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31076	NC_016931	TTA	2	6	1220760	1220765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714242
31077	NC_016931	TGATTT	2	12	1220846	1220857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379714242
31078	NC_016931	T	8	8	1220894	1220901	0 %	100 %	0 %	0 %	379714242
31079	NC_016931	GAA	2	6	1220902	1220907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714242
31080	NC_016931	TCA	2	6	1220916	1220921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714242
31081	NC_016931	TAC	2	6	1220942	1220947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31082	NC_016931	TTC	2	6	1221008	1221013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31083	NC_016931	TAA	2	6	1221036	1221041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_016931	TTCTTT	2	12	1221108	1221119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31085	NC_016931	CTT	2	6	1221122	1221127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31086	NC_016931	AATT	2	8	1221188	1221195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31087	NC_016931	ATTTA	2	10	1221211	1221220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31088	NC_016931	TTC	2	6	1221223	1221228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31089	NC_016931	T	7	7	1221247	1221253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_016931	TCC	2	6	1221265	1221270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31091	NC_016931	TAAAT	2	10	1221307	1221316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_016931	AAG	2	6	1221323	1221328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_016931	GTTA	2	8	1221337	1221344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_016931	TAAC	2	8	1221353	1221360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31095	NC_016931	ACT	2	6	1221379	1221384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31096	NC_016931	GCC	2	6	1221395	1221400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31097	NC_016931	TGA	2	6	1221428	1221433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31098	NC_016931	TCA	2	6	1221473	1221478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31099	NC_016931	T	6	6	1221490	1221495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31100	NC_016931	TTC	2	6	1221535	1221540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31101	NC_016931	GT	3	6	1221591	1221596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31102	NC_016931	ATT	2	6	1221631	1221636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_016931	TGC	2	6	1221688	1221693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_016931	T	6	6	1221767	1221772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_016931	GTA	2	6	1221795	1221800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_016931	ATT	2	6	1221897	1221902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_016931	CCAG	2	8	1221983	1221990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31108	NC_016931	TGC	2	6	1222053	1222058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31109	NC_016931	TTAC	2	8	1222064	1222071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31110	NC_016931	CAA	2	6	1222109	1222114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31111	NC_016931	TTTA	2	8	1222163	1222170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_016931	AAT	2	6	1222202	1222207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714243
31113	NC_016931	TTTA	2	8	1222291	1222298	25 %	75 %	0 %	0 %	379714243
31114	NC_016931	GATA	2	8	1222301	1222308	50 %	25 %	25 %	0 %	379714243
31115	NC_016931	AAGA	2	8	1222309	1222316	75 %	0 %	25 %	0 %	379714243
31116	NC_016931	GTA	2	6	1222339	1222344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714243
31117	NC_016931	TGC	2	6	1222408	1222413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714244
31118	NC_016931	GTA	2	6	1222442	1222447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714244
31119	NC_016931	AGT	2	6	1222478	1222483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714244
31120	NC_016931	ATT	2	6	1222496	1222501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714244
31121	NC_016931	ATT	2	6	1222529	1222534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714244
31122	NC_016931	CGGTAT	2	12	1222543	1222554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379714244
31123	NC_016931	TGA	2	6	1222606	1222611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714244
31124	NC_016931	TGC	2	6	1222669	1222674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714244
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